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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 90 / 151 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003142 Chr04 NC_080390.1:47991555-47991567promoter 内 2405-2417 bp + 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47993151-48004402(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G004615 Chr02 NC_080388.1:68663393-68663405promoter 内 2397-2409 bp + 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 68664997-68666698(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G002808 Chr01 NC_080387.1:46624609-46624621promoter 内 2320-2332 bp + 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46620761-46622940(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATTTAGGTAAA
SmilChr03G003785 Chr03 NC_080389.1:56972385-56972397promoter 内 2310-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56965623-56970706(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G001271 Chr02 NC_080388.1:23268029-23268041promoter 内 2292-2304 bp - 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23269738-23271189(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr03G003787 Chr03 NC_080389.1:56972385-56972397promoter 内 2286-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56969406-56970682(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr04G002062 Chr04 NC_080390.1:33361456-33361468promoter 内 2272-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 33363185-33367784(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr04G000126 Chr04 NC_080390.1:1072730-1072742promoter 内 2216-2228 bp - 1773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1067777-1070957(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G004624 Chr01 NC_080387.1:64262528-64262540promoter 内 2178-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 64264351-64266280(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTCCT
SmilChr05G001591 Chr05 NC_080391.1:14611291-14611303promoter 内 2156-2168 bp + 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 14607856-14609458(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTTGTAGGTAGC
SmilChr02G003423 Chr02 NC_080388.1:55441458-55441470promoter 内 2137-2149 bp - 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55436345-55439606(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G002802 Chr02 NC_080388.1:48096262-48096274promoter 内 2104-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48098159-48098990(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58312279-58312291promoter 内 2073-2085 bp - 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 58314207-58315187(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G003829 Chr01 NC_080387.1:56629803-56629815promoter 内 2046-2058 bp + 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56631758-56633259(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G004526 Chr02 NC_080388.1:67859591-67859603promoter 内 2044-2056 bp - 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 67842087-67857646(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
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SmilChr05G001303 Chr05 NC_080391.1:11249990-11250002promoter 内 1848-1860 bp + 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 11252143-11254400(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATTTT
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SmilChr05G001440 Chr05 NC_080391.1:13153876-13153888promoter 内 1762-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 13150479-13151649(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTT
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SmilChr05G000419 Chr05 NC_080391.1:3170210-3170222promoter 内 1706-1718 bp + 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3164749-3167927(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAATTAGGTAAT
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SmilChr01G005405 Chr01 NC_080387.1:71309552-71309564promoter 内 1699-1711 bp - 2290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71305825-71307262(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr03G004406 Chr03 NC_080389.1:62228832-62228844promoter 内 1690-1702 bp - 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62224399-62226533(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAGAT
SmilChr03G004389 Chr03 NC_080389.1:62092233-62092245promoter 内 1689-1701 bp - 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 62087818-62089933(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAGAT
SmilChr03G004737 Chr03 NC_080389.1:64505259-64505271promoter 内 1677-1689 bp - 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 64495204-64502947(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr03G002765 Chr03 NC_080389.1:43945953-43945965promoter 内 1670-1682 bp + 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 43948284-43949415(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr04G002060 Chr04 NC_080390.1:33348175-33348187promoter 内 1665-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 33350511-33354304(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAACCC
SmilChr04G004014 Chr04 NC_080390.1:55430794-55430806promoter 内 1663-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 55426993-55428468(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAATTAGGTAAT
SmilChr02G002800 Chr02 NC_080388.1:48096262-48096274promoter 内 1636-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48092925-48093909(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr03G002602 Chr03 NC_080389.1:41331277-41331289promoter 内 1628-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 41328038-41328916(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTT
SmilChr05G000836 Chr05 NC_080391.1:6592852-6592864promoter 内 1582-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6589888-6590445(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr04G001653 Chr04 NC_080390.1:27496248-27496260promoter 内 1580-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27498669-27521537(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACAAAC
SmilChr02G003209 Chr02 NC_080388.1:53258139-53258151promoter 内 1572-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53260568-53261383(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAATTTAGGTAAA
SmilChr05G001928 Chr05 NC_080391.1:19587528-19587540promoter 内 1560-1572 bp - 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19589969-19590709(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCAGTAGGTACC
SmilChr05G002046 Chr05 NC_080391.1:21283711-21283723promoter 内 1556-1568 bp - 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21286156-21286228(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr01G001681 Chr01 NC_080387.1:31011949-31011961promoter 内 1483-1495 bp - 2506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 31008781-31009443(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr03G002650 Chr03 NC_080389.1:42162658-42162670promoter 内 1441-1453 bp + 2548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 42165218-42170027(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr01G001951 Chr01 NC_080387.1:34724776-34724788promoter 内 1429-1441 bp + 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 34727348-34728983(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr02G004141 Chr02 NC_080388.1:63735273-63735285promoter 内 1385-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 63731730-63732669(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCAACTACCTTT
SmilChr03G002947 Chr03 NC_080389.1:46201751-46201763promoter 内 1343-1355 bp + 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46204409-46206841(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
SmilChr04G003382 Chr04 NC_080390.1:50359359-50359371promoter 内 1334-1346 bp + 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50362026-50363193(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCAACTACCTTT
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SmilChr01G003535 Chr01 NC_080387.1:53986176-53986188promoter 内 1316-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 53979613-53983503(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGTTGAG
SmilChr02G003473 Chr02 NC_080388.1:56037781-56037793promoter 内 1313-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56040469-56045779(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACATTA