转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 90 / 149 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003830 Chr01 NC_080387.1:56637533-56637543promoter 内 2171-2181 bp - 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 56631798-56635713(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAC
SmilChr07G002663 Chr07 NC_080393.1:25842098-25842108promoter 内 2169-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25843930-25846169(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr01G002949 Chr01 NC_080387.1:48359466-48359476promoter 内 2128-2138 bp + 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 48361339-48364998(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCA
SmilChr02G000676 Chr02 NC_080388.1:10558619-10558629promoter 内 2099-2109 bp + 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10554034-10556727(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTC
SmilChr02G005482 Chr02 NC_080388.1:75033613-75033623promoter 内 2074-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 75029459-75031696(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr06G002406 Chr06 NC_080392.1:34824091-34824101promoter 内 2056-2066 bp + 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 34820163-34822156(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr05G001548 Chr05 NC_080391.1:14179070-14179080promoter 内 2023-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14181048-14188279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G001780 Chr01 NC_080387.1:32688574-32688584promoter 内 2020-2030 bp - 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 32690555-32691341(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr02G000473 Chr02 NC_080388.1:6471728-6471738promoter 内 2009-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6467041-6469746(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr05G000372 Chr05 NC_080391.1:2760234-2760244promoter 内 1998-2008 bp - 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2762237-2764929(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr02G002251 Chr02 NC_080388.1:39934260-39934270promoter 内 1989-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39936272-39942429(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGGGCTGTCA
SmilChr07G000145 Chr07 NC_080393.1:880808-880818promoter 内 1984-1994 bp - 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 872390-878801(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr07G000282 Chr07 NC_080393.1:1830192-1830202promoter 内 1984-1994 bp + 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1819978-1828185(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGA
SmilChr04G000343 Chr04 NC_080390.1:3150180-3150190promoter 内 1966-1976 bp + 2025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 3146931-3148155(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr07G002087 Chr07 NC_080393.1:18985879-18985889promoter 内 1952-1962 bp + 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 18978924-18983840(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr04G000432 Chr04 NC_080390.1:4595663-4595673promoter 内 1925-1935 bp - 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4597739-4598868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr07G000149 Chr07 NC_080393.1:893383-893393promoter 内 1902-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 888198-891294(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr04G002886 Chr04 NC_080390.1:45064626-45064636promoter 内 1890-1900 bp + 2101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 45059347-45062525(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGA
SmilChr01G003883 Chr01 NC_080387.1:57156528-57156538promoter 内 1886-1896 bp + 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 57158643-57163874(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr03G002035 Chr03 NC_080389.1:30711159-30711169promoter 内 1873-1883 bp + 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 30713287-30715139(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr03G001821 Chr03 NC_080389.1:24899919-24899929promoter 内 1834-1844 bp + 2157 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 24889803-24897762(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr07G001395 Chr07 NC_080393.1:10830672-10830682promoter 内 1803-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 10826590-10828484(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr03G000111 Chr03 NC_080389.1:1226804-1226814promoter 内 1785-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1229020-1261784(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr07G002158 Chr07 NC_080393.1:19737740-19737750promoter 内 1735-1745 bp - 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 19728434-19735484(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCA
SmilChr06G002695 Chr06 NC_080392.1:38877425-38877435promoter 内 1721-1731 bp - 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 38873357-38875155(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr07G000146 Chr07 NC_080393.1:880808-880818promoter 内 1689-1699 bp - 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 875844-878506(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr04G003258 Chr04 NC_080390.1:49304108-49304118promoter 内 1673-1683 bp - 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49301026-49301790(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G000118 Chr01 NC_080387.1:2035515-2035525promoter 内 1657-1667 bp - 2334 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2032181-2033181(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1782641-1782651promoter 内 1655-1665 bp - 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 1784987-1786606(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr04G002467 Chr04 NC_080390.1:39496434-39496444promoter 内 1606-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 39498829-39500814(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTC
SmilChr07G000150 Chr07 NC_080393.1:897063-897073promoter 内 1601-1611 bp - 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 891921-894673(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr06G000922 Chr06 NC_080392.1:8754207-8754217promoter 内 1571-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 8751317-8751787(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGGGCTGTCA
SmilChr07G001295 Chr07 NC_080393.1:9945615-9945625promoter 内 1541-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 9941828-9943165(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAG
SmilChr01G000719 Chr01 NC_080387.1:16090934-16090944promoter 内 1539-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 16093396-16094636(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr04G003231 Chr04 NC_080390.1:49136727-49136737promoter 内 1535-1545 bp + 2456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 49139193-49140204(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCA
SmilChr05G000847 Chr05 NC_080391.1:6684231-6684241promoter 内 1522-1532 bp - 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 6686710-6688112(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr02G003772 Chr02 NC_080388.1:59411947-59411957promoter 内 1520-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 59408949-59409476(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr07G000147 Chr07 NC_080393.1:885344-885354promoter 内 1481-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 879402-882834(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr05G004111 Chr05 NC_080391.1:54960703-54960713promoter 内 1431-1441 bp + 2560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 54956469-54958143(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr07G000162 Chr07 NC_080393.1:961621-961631promoter 内 1419-1429 bp - 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 964203-966755(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr02G000393 Chr02 NC_080388.1:4870276-4870286promoter 内 1416-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 4872861-4879280(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G001566 Chr01 NC_080387.1:29675460-29675470promoter 内 1404-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 29678057-29679748(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr02G002122 Chr02 NC_080388.1:37994893-37994903promoter 内 1367-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 37997527-38000094(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr06G002065 Chr06 NC_080392.1:27185261-27185271promoter 内 1363-1373 bp + 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 27178638-27182633(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr02G001628 Chr02 NC_080388.1:30233000-30233010promoter 内 1337-1347 bp - 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 30235664-30237252(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr05G000391 Chr05 NC_080391.1:2950289-2950299promoter 内 1328-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 2952962-2953927(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATA
SmilChr05G001576 Chr05 NC_080391.1:14430114-14430124promoter 内 1322-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 14432793-14434284(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG
SmilChr04G001540 Chr04 NC_080390.1:25372253-25372263promoter 内 1306-1316 bp + 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 25364426-25369568(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr06G002682 Chr06 NC_080392.1:38754722-38754732promoter 内 1277-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 38749379-38752008(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGA
SmilChr07G000144 Chr07 NC_080393.1:873756-873766promoter 内 1271-1281 bp - 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 1 864747-871036(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCG