转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 91 / 136 下载 TSV

上一页 91 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004171 Chr03 NC_080389.1:60458603-60458613promoter 内 505-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 60451762-60455117(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATC
SmilChr05G003433 Chr05 NC_080391.1:45619187-45619197promoter 内 497-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45622691-45624225(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCG
SmilChr01G001508 Chr01 NC_080387.1:28907444-28907454promoter 内 493-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28910952-28915196(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGA
SmilChr05G000206 Chr05 NC_080391.1:1629631-1629641promoter 内 437-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1633195-1645182(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGC
SmilChr03G002432 Chr03 NC_080389.1:38622684-38622694promoter 内 425-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38626260-38630452(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGA
SmilChr08G001074 Chr08 NC_080394.1:8281812-8281822promoter 内 406-416 bp + 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8273423-8278227(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCC
SmilChr04G001040 Chr04 NC_080390.1:14816289-14816299promoter 内 320-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14811360-14812618(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACG
SmilChr01G001746 Chr01 NC_080387.1:32134701-32134711promoter 内 289-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32138413-32139448(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCACA
SmilChr05G004270 Chr05 NC_080391.1:56470551-56470561promoter 内 272-282 bp - 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56474280-56476087(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCC
SmilChr07G000069 Chr07 NC_080393.1:330742-330752promoter 内 225-235 bp + 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 323572-326976(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCC
SmilChr02G000833 Chr02 NC_080388.1:14098328-14098338promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14102115-14103030(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGA
SmilChr02G000905 Chr02 NC_080388.1:15623943-15623953promoter 内 196-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15619672-15620148(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATC
SmilChr05G000106 Chr05 NC_080391.1:687363-687373promoter 内 100-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 680867-683472(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCG
SmilChr07G004310 Chr07 NC_080393.1:55673171-55673181promoter 内 66-76 bp + 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55667805-55669246(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGTG
SmilChr07G002428 Chr07 NC_080393.1:22597030-22597040promoter 内 64-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22600967-22601666(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCC
SmilChr02G002168 Chr02 NC_080388.1:38904925-38904935promoter 内 59-69 bp - 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38908867-38910207(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCC
SmilChr08G003291 Chr08 NC_080394.1:34018192-34018202promoter 内 27-37 bp - 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34022166-34023383(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCC
SmilChr08G003289 Chr08 NC_080394.1:34004050-34004060promoter 内 23-33 bp - 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34008028-34009245(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCC
SmilChr03G004052 Chr03 NC_080389.1:59485266-59485276promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59473631-59481295(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGTA
SmilChr07G001223 Chr07 NC_080393.1:9357708-9357718promoter 内 1-11 bp + 3990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9361708-9363904(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGAC
SmilChr05G003793 Chr05 NC_080391.1:51271185-51271195promoter 内 3480-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 51266820-51270674(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACGG
SmilChr02G003930 Chr02 NC_080388.1:61372256-61372266promoter 内 3192-3202 bp + 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61373065-61374600(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCATG
SmilChr02G003929 Chr02 NC_080388.1:61372256-61372266promoter 内 2776-2786 bp + 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61365591-61371041(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr01G003091 Chr01 NC_080387.1:49723446-49723456promoter 内 2775-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49724672-49735047(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr01G004466 Chr01 NC_080387.1:62753185-62753195promoter 内 2747-2757 bp - 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62754439-62755737(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGA
SmilChr04G000219 Chr04 NC_080390.1:1913994-1914004promoter 内 2454-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1908422-1912457(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCATG
SmilChr07G000853 Chr07 NC_080393.1:6075329-6075339promoter 内 2300-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6077030-6082154(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGA
SmilChr03G003266 Chr03 NC_080389.1:50589893-50589903promoter 内 1954-1964 bp + 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 50591940-50592010(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCATG
SmilChr08G002359 Chr08 NC_080394.1:22346598-22346608promoter 内 1846-1856 bp - 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 22348753-22354106(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGA
SmilChr07G004379 Chr07 NC_080393.1:56334590-56334600promoter 内 1350-1360 bp - 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56337241-56338762(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr01G000333 Chr01 NC_080387.1:6776820-6776830promoter 内 1235-1245 bp - 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6779586-6783573(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr06G002933 Chr06 NC_080392.1:42176017-42176027promoter 内 1192-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42170249-42173218(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGA
SmilChr01G004465 Chr01 NC_080387.1:62753185-62753195promoter 内 1179-1189 bp - 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62745873-62750373(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTA
SmilChr05G001887 Chr05 NC_080391.1:19188066-19188076promoter 内 1155-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19184342-19185230(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCA
SmilChr02G004889 Chr02 NC_080388.1:70949972-70949982promoter 内 1088-1098 bp - 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70945121-70947069(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCA
SmilChr01G003090 Chr01 NC_080387.1:49723446-49723456promoter 内 808-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49717894-49720263(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCATG
SmilChr07G003524 Chr07 NC_080393.1:40392541-40392551promoter 内 614-624 bp - 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 40395928-40397083(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr05G001056 Chr05 NC_080391.1:8740949-8740959promoter 内 283-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 8744667-8749253(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCA
SmilChr04G000975 Chr04 NC_080390.1:13074409-13074419promoter 内 110-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 13078300-13079759(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCA
SmilChr04G001726 Chr04 NC_080390.1:28501214-28501224promoter 内 40-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28505175-28509187(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCATG
SmilChr02G004678 Chr02 NC_080388.1:69112356-69112366promoter 内 23-33 bp - 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 69116334-69125127(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CATGCTGAGCC
SmilChr04G001158 Chr04 NC_080390.1:17139160-17139170promoter 内 2865-2875 bp + 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 4 17140296-17140640(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr01G000145 Chr01 NC_080387.1:2439196-2439206promoter 内 2222-2232 bp + 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 2440975-2446801(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr08G004775 Chr08 NC_080394.1:57064200-57064210promoter 内 1002-1012 bp - 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 57067199-57069431(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr06G002068 Chr06 NC_080392.1:27246199-27246209promoter 内 694-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 27249506-27250123(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr01G003759 Chr01 NC_080387.1:55978895-55978905promoter 内 3306-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 55979590-55982896(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr01G002149 Chr01 NC_080387.1:37479185-37479195promoter 内 3282-3292 bp + 709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 37479904-37482870(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAG
SmilChr01G002394 Chr01 NC_080387.1:41245032-41245042promoter 内 2702-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 41246331-41247259(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGCT
SmilChr05G003635 Chr05 NC_080391.1:48735637-48735647promoter 内 1448-1458 bp + 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 48730138-48733094(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr02G001717 Chr02 NC_080388.1:31629663-31629673promoter 内 1234-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 31626175-31626906(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT