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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G001896; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004057-RA_Salv SmilChr08G001896 MYB XP_057783815.1 MP00564 AAAAATTAGGTGAAA

可能结合的靶基因

9893 个结合位点 6984 个候选靶基因 第 91 / 140 下载 TSV

上一页 91 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003976 Chr02 NC_080388.1:62023290-62023304promoter 内 3888-3902 bp - 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62023403-62027692(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCACACCTAACCAAT
SmilChr03G003584 Chr03 NC_080389.1:54478082-54478096promoter 内 3881-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54476504-54477976(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTATGTAGGTGAAT
SmilChr02G004018 Chr02 NC_080388.1:62476277-62476291promoter 内 3780-3794 bp + 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62476498-62479981(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TAGATTTAGGTGATC
SmilChr01G005766 Chr01 NC_080387.1:73749158-73749172promoter 内 3747-3761 bp + 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73749412-73754693(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTAATTAGGTGTGT
SmilChr03G001704 Chr03 NC_080389.1:22634692-22634706promoter 内 3729-3743 bp + 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 22632393-22634434(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTTCACCTAAAACGA
SmilChr02G005101 Chr02 NC_080388.1:72551770-72551784promoter 内 3705-3719 bp - 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 72552066-72559973(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATGCACCTAAATTTT
SmilChr02G004304 Chr02 NC_080388.1:65423915-65423929promoter 内 3614-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 65424302-65430699(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTGACCTAATAATG
SmilChr03G003237 Chr03 NC_080389.1:50272395-50272409promoter 内 3601-3615 bp + 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50272795-50275365(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAAAATTAGTTCGAA
SmilChr01G000171 Chr01 NC_080387.1:2815688-2815702promoter 内 3593-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2814620-2815294(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCCCACCTAAAACAC
SmilChr02G000273 Chr02 NC_080388.1:3516224-3516238promoter 内 3580-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3515075-3515817(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 AATTATTAGGTAATC
SmilChr02G002388 Chr02 NC_080388.1:41813997-41814011promoter 内 3564-3578 bp - 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41812293-41813574(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGGATTTTGGTGAAA
SmilChr01G004389 Chr01 NC_080387.1:62053854-62053868promoter 内 3515-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62054340-62056294(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TATAATTAGGTGTCT
SmilChr03G000542 Chr03 NC_080389.1:5887509-5887523promoter 内 3467-3481 bp - 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5888043-5890586(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCAGACCTAATTTTG
SmilChr02G003481 Chr02 NC_080388.1:56090771-56090785promoter 内 3435-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56091337-56093015(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTTGTTAGGTGATA
SmilChr01G001323 Chr01 NC_080387.1:26264621-26264635promoter 内 3398-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26265224-26266468(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCACACCTAACCTAA
SmilChr01G001951 Chr01 NC_080387.1:34726736-34726750promoter 内 3389-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34727348-34728983(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGTTTGTAGGTGAAA
SmilChr01G004734 Chr01 NC_080387.1:65518348-65518362promoter 内 3362-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 65513431-65517723(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTATACCTAATCTTT
SmilChr01G006022 Chr01 NC_080387.1:75806319-75806333promoter 内 3360-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75800542-75805692(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTACACCTAAATCTA
SmilChr02G003024 Chr02 NC_080388.1:50922408-50922422promoter 内 3171-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50918719-50921592(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACAAACA
SmilChr02G003650 Chr02 NC_080388.1:57887265-57887279promoter 内 3157-3171 bp + 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57880193-57886435(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACCGACCAAATTTTT
SmilChr02G001658 Chr02 NC_080388.1:30771477-30771491promoter 内 3111-3125 bp - 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30772367-30780224(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GGCAACCTAATACTT
SmilChr02G004306 Chr02 NC_080388.1:65442722-65442736promoter 内 3110-3124 bp - 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 65443613-65445499(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCCACCTAAACCTA
SmilChr03G002071 Chr03 NC_080389.1:31605150-31605164promoter 内 3061-3075 bp + 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 31606090-31607582(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGAAATTAGGTTGCA
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SmilChr02G004815 Chr02 NC_080388.1:70303876-70303890promoter 内 3000-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70301268-70302889(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TATGACCTAATTTTC
SmilChr02G004737 Chr02 NC_080388.1:69584611-69584625promoter 内 2956-2970 bp - 1031 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69585656-69585774(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CCTAACCTAATTAGG
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SmilChr01G003264 Chr01 NC_080387.1:51331031-51331045promoter 内 2909-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51323635-51329953(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ATTCACCTACAATTA
SmilChr02G003036 Chr02 NC_080388.1:51075616-51075630promoter 内 2868-2882 bp - 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51076749-51078464(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTCCACCGAATTTTT
SmilChr01G004074 Chr01 NC_080387.1:59179205-59179219promoter 内 2804-2818 bp - 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 59176511-59178022(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTATTTTAGGTGAAA
SmilChr01G001271 Chr01 NC_080387.1:25409463-25409477promoter 内 2778-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25402670-25408254(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CATCACCTACCAAAC
SmilChr02G002756 Chr02 NC_080388.1:47605439-47605453promoter 内 2743-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47603079-47604195(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTCACCTACAACAA
SmilChr02G004446 Chr02 NC_080388.1:66812547-66812561promoter 内 2729-2743 bp + 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 66813819-66814358(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTATTTTAGGTGAAA
SmilChr02G003943 Chr02 NC_080388.1:61575382-61575396promoter 内 2610-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61576773-61582490(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CTCAACCTAATACTT
SmilChr01G005765 Chr01 NC_080387.1:73749158-73749172promoter 内 2608-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73746735-73747779(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 ACACACCTAATTAAG
SmilChr02G004619 Chr02 NC_080388.1:68699240-68699254promoter 内 2309-2323 bp - 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 68700932-68727977(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CACCAACTAATTTTT
SmilChr01G005072 Chr01 NC_080387.1:68598055-68598069promoter 内 2269-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 68599787-68603091(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TCTAACCAAATTTTT
SmilChr02G005491 Chr02 NC_080388.1:75074134-75074148promoter 内 2231-2245 bp + 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75075904-75082376(+) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TTTAATTAGGTATAA
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SmilChr01G005353 Chr01 NC_080387.1:70766417-70766431promoter 内 2176-2190 bp - 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70763380-70764606(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GTAAATTAGGTTACA
SmilChr03G002910 Chr03 NC_080389.1:45859260-45859274promoter 内 2134-2148 bp - 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 45856219-45857407(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GAAAATTAGTTGGTG
SmilChr03G000304 Chr03 NC_080389.1:3473079-3473093promoter 内 2081-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3466537-3471173(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 GAAAATTAGGTTGCT
SmilChr01G003768 Chr01 NC_080387.1:56049503-56049517promoter 内 2052-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56045957-56047568(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 TGTATTTAGGTGAGT
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SmilChr03G003240 Chr03 NC_080389.1:50308256-50308270promoter 内 1773-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50305301-50306042(-) SMil_00004057-RA_Salv MP00564 CAAAATTAGTTCGAA