转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000830; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021489-RA_Salv SmilChr05G000830 NAC XP_057764550.1 MP00058 TACGTAAC

可能结合的靶基因

9855 个结合位点 7440 个候选靶基因 第 92 / 149 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001675 Chr06 NC_080392.1:19015511-19015518promoter 内 591-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 19018921-19023592(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr02G002210 Chr02 NC_080388.1:39349715-39349722promoter 内 590-597 bp + 3404 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 39353126-39355654(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr02G003280 Chr02 NC_080388.1:54106577-54106584promoter 内 589-596 bp - 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 54109989-54111942(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr07G002310 Chr07 NC_080393.1:21384657-21384664promoter 内 586-593 bp - 3408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 21378583-21381249(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr03G004486 Chr03 NC_080389.1:62983887-62983894promoter 内 580-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 62979683-62980473(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr08G000906 Chr08 NC_080394.1:6699089-6699096promoter 内 576-583 bp - 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 6702514-6703481(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr02G004027 Chr02 NC_080388.1:62549844-62549851promoter 内 571-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 62542073-62546421(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr05G004327 Chr05 NC_080391.1:56923261-56923268promoter 内 566-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 56926696-56928175(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr06G002815 Chr06 NC_080392.1:40869862-40869869promoter 内 562-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 40862184-40866430(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr04G002457 Chr04 NC_080390.1:39366328-39366335promoter 内 561-568 bp - 3433 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 39369768-39372681(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr02G001395 Chr02 NC_080388.1:26492914-26492921promoter 内 556-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 26487820-26489476(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr04G003548 Chr04 NC_080390.1:51822155-51822162promoter 内 555-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 51825601-51826604(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr08G001313 Chr08 NC_080394.1:10460673-10460680promoter 内 555-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10464119-10464904(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr02G003260 Chr02 NC_080388.1:53892243-53892250promoter 内 553-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 53895691-53899274(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr08G002058 Chr08 NC_080394.1:18456205-18456212promoter 内 553-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 18448750-18452764(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr04G000577 Chr04 NC_080390.1:6423372-6423379promoter 内 542-549 bp - 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 6426831-6429688(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr05G003994 Chr05 NC_080391.1:53782351-53782358promoter 内 540-547 bp + 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 53785812-53787681(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr04G002683 Chr04 NC_080390.1:42280891-42280898promoter 内 538-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 42275407-42277435(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr01G004649 Chr01 NC_080387.1:64565947-64565954promoter 内 536-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 64569412-64572379(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr07G001372 Chr07 NC_080393.1:10644067-10644074promoter 内 536-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10639206-10640609(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr03G003004 Chr03 NC_080389.1:46890083-46890090promoter 内 533-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 46886538-46886622(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr01G000979 Chr01 NC_080387.1:20740731-20740738promoter 内 532-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 20744200-20746027(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr03G003076 Chr03 NC_080389.1:47785749-47785756promoter 内 529-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 47781488-47782284(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr01G000303 Chr01 NC_080387.1:5938118-5938125promoter 内 527-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 5941592-5945008(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr05G002862 Chr05 NC_080391.1:34120350-34120357promoter 内 526-533 bp - 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34123825-34124359(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr03G002019 Chr03 NC_080389.1:30227622-30227629promoter 内 517-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 30221594-30224145(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr04G004101 Chr04 NC_080390.1:55973899-55973906promoter 内 517-524 bp + 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 55977383-55986866(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr02G001120 Chr02 NC_080388.1:20210220-20210227promoter 内 516-523 bp + 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 20204191-20206742(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr01G000501 Chr01 NC_080387.1:10169408-10169415promoter 内 515-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 10172894-10175787(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr03G001796 Chr03 NC_080389.1:24569369-24569376promoter 内 515-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 24572855-24575792(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr06G000538 Chr06 NC_080392.1:4504372-4504379promoter 内 515-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4499035-4500893(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr01G004064 Chr01 NC_080387.1:59061344-59061351promoter 内 511-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 59050577-59057861(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr08G002201 Chr08 NC_080394.1:19946328-19946335promoter 内 511-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 19939413-19942845(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr02G002252 Chr02 NC_080388.1:39958191-39958198promoter 内 508-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 39961684-39964990(+) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 TACGTAAT
SmilChr06G002919 Chr06 NC_080392.1:42057497-42057504promoter 内 508-515 bp + 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 42053676-42054011(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
SmilChr07G003671 Chr07 NC_080393.1:44009802-44009809promoter 内 502-509 bp + 3492 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 44005524-44006310(-) SMil_00021489-RA_Salv MP00058 ATTACGTA
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