转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 92 / 164 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003638 Chr02 NC_080388.1:57746559-57746573promoter 内 628-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 57742456-57743200(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACTTCCAC
SmilChr03G000999 Chr03 NC_080389.1:11323557-11323571promoter 内 540-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 11318754-11320110(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACTAAAAA
SmilChr03G000377 Chr03 NC_080389.1:4210805-4210819promoter 内 487-501 bp + 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4206521-4207305(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCAACTACCAAGTT
SmilChr02G002773 Chr02 NC_080388.1:47801907-47801921promoter 内 455-469 bp + 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47805453-47823024(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGTTGAGTAGGTGGC
SmilChr07G003059 Chr07 NC_080393.1:31974181-31974195promoter 内 420-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 31977762-31979188(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTAACTCTTC
SmilChr02G000339 Chr02 NC_080388.1:4353889-4353903promoter 内 312-326 bp - 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4347520-4350214(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGTAGGTAGGTAAT
SmilChr06G003089 Chr06 NC_080392.1:43738326-43738340promoter 内 311-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 43742016-43747651(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACTAGCAC
SmilChr03G000146 Chr03 NC_080389.1:1611485-1611499promoter 内 283-297 bp + 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1602765-1607781(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTACCTACCTACTT
SmilChr08G002029 Chr08 NC_080394.1:18088660-18088674promoter 内 259-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18083981-18084932(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATGGTAGTAGGTGAT
SmilChr04G002593 Chr04 NC_080390.1:41347705-41347719promoter 内 229-243 bp - 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 41351477-41353220(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACAACTACCAAAAC
SmilChr02G005192 Chr02 NC_080388.1:73198757-73198771promoter 内 190-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73202568-73203346(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTAACTCACA
SmilChr08G002120 Chr08 NC_080394.1:19072711-19072725promoter 内 171-185 bp - 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19066956-19068895(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CAGTTGGTTGTTGGA
SmilChr01G000064 Chr01 NC_080387.1:1051252-1051266promoter 内 155-169 bp - 3832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1055098-1059171(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACTACCTACCAAATA
SmilChr03G001090 Chr03 NC_080389.1:12604119-12604133promoter 内 143-157 bp - 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12607977-12609094(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCAACTACCAAGTT
SmilChr06G001812 Chr06 NC_080392.1:21288910-21288924promoter 内 111-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21292800-21296245(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATAAAGTAGGTGAA
SmilChr07G003739 Chr07 NC_080393.1:45556291-45556305promoter 内 3918-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 45556374-45558124(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr03G002951 Chr03 NC_080389.1:46231638-46231652promoter 内 3917-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46228713-46231568(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr03G004713 Chr03 NC_080389.1:64386418-64386432promoter 内 3885-3899 bp + 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 64383621-64386316(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr03G004361 Chr03 NC_080389.1:61843935-61843949promoter 内 3766-3780 bp - 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 61844170-61845864(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr07G000517 Chr07 NC_080393.1:3634364-3634378promoter 内 3722-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 3631170-3634099(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr01G005920 Chr01 NC_080387.1:75032263-75032277promoter 内 3642-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 75030558-75031918(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr03G003876 Chr03 NC_080389.1:57877963-57877977promoter 内 3525-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 57873352-57877501(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCATGGTAGGTTAA
SmilChr05G000926 Chr05 NC_080391.1:7394106-7394120promoter 内 3466-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 7394641-7401660(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr01G002596 Chr01 NC_080387.1:44141839-44141853promoter 内 3212-3226 bp + 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 44142628-44144828(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGATGGGTAGGTTAA
SmilChr05G003026 Chr05 NC_080391.1:37880783-37880797promoter 内 2927-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 37881857-37885266(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGAAGGTAGGTTTG
SmilChr06G002526 Chr06 NC_080392.1:36250083-36250097promoter 内 2895-2909 bp - 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 36248397-36248991(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr07G001206 Chr07 NC_080393.1:9200961-9200975promoter 内 2805-2819 bp + 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 9196812-9199779(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACACCTACCAATTT
SmilChr03G002468 Chr03 NC_080389.1:39155451-39155465promoter 内 2631-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 39156821-39158471(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTCCCTT
SmilChr03G002248 Chr03 NC_080389.1:35409182-35409196promoter 内 2608-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 35410575-35412657(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr02G005127 Chr02 NC_080388.1:72742429-72742443promoter 内 2541-2555 bp + 1446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 72743889-72747425(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr08G002590 Chr08 NC_080394.1:25239159-25239173promoter 内 2470-2484 bp + 1517 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 25234431-25237642(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr01G005959 Chr01 NC_080387.1:75304006-75304020promoter 内 2364-2378 bp + 1623 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 75305643-75308359(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr01G000333 Chr01 NC_080387.1:6777820-6777834promoter 内 2235-2249 bp - 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 6779586-6783573(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCCTAAT
SmilChr07G000518 Chr07 NC_080393.1:3636102-3636116promoter 内 2217-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 3637886-3639731(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr07G002721 Chr07 NC_080393.1:26708193-26708207promoter 内 2117-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 26702168-26706323(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr03G004362 Chr03 NC_080389.1:61843935-61843949promoter 内 1972-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 61845964-61846782(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr02G002088 Chr02 NC_080388.1:37475651-37475665promoter 内 1656-1670 bp - 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 37477996-37482236(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCGACCTACCAACAA
SmilChr05G003823 Chr05 NC_080391.1:51621022-51621036promoter 内 1626-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 51623397-51631720(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTCACCTACCGAACC
SmilChr01G004803 Chr01 NC_080387.1:66243641-66243655promoter 内 1361-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 66237564-66241015(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACTTTGAT
SmilChr02G002727 Chr02 NC_080388.1:47200797-47200811promoter 内 954-968 bp - 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 47190273-47197764(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCAAAGTAGGTGGA
SmilChr03G003877 Chr03 NC_080389.1:57877963-57877977promoter 内 948-962 bp - 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 57881016-57883408(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAACCTACCATGCT
SmilChr06G001432 Chr06 NC_080392.1:15133896-15133910promoter 内 578-592 bp - 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 15137319-15143468(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCAACTACCAACCA
SmilChr02G000613 Chr02 NC_080388.1:8945764-8945778promoter 内 3980-3994 bp + 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 8944679-8945757(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCAACCTACCTTCCA
SmilChr07G002756 Chr07 NC_080393.1:27325157-27325171promoter 内 3914-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27323513-27325084(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTAACCAACC
SmilChr05G000078 Chr05 NC_080391.1:398117-398131promoter 内 3812-3826 bp - 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 397211-397942(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATGTGGTAGGTAAT
SmilChr05G002153 Chr05 NC_080391.1:22745834-22745848promoter 内 3754-3768 bp + 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22744894-22745601(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TATACCTACCAAAAA
SmilChr05G002360 Chr05 NC_080391.1:25640830-25640844promoter 内 3727-3741 bp - 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 25639558-25640570(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CATGTGTTAGGTGAA
SmilChr02G004019 Chr02 NC_080388.1:62500385-62500399promoter 内 3702-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 62498208-62500100(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAAATGTTAGGTGAA
SmilChr01G002893 Chr01 NC_080387.1:47616440-47616454promoter 内 3679-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 47615292-47616132(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAAACTACCAACAT
SmilChr06G002063 Chr06 NC_080392.1:27127202-27127216promoter 内 3613-3627 bp + 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27121943-27126828(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAAACTACCAACAT