转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 93 / 148 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002576 Chr06 NC_080392.1:37001406-37001419promoter 内 1704-1717 bp - 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36993356-36999122(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTCCTCACGTGA
SmilChr06G002578 Chr06 NC_080392.1:37022904-37022917promoter 内 1703-1716 bp - 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37014853-37020619(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTCCTCACGTGA
SmilChr02G000044 Chr02 NC_080388.1:599113-599126promoter 内 1618-1631 bp + 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 593910-596743(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACATA
SmilChr07G001889 Chr07 NC_080393.1:16324094-16324107promoter 内 1596-1609 bp + 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16326499-16329728(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGACTCACGTGT
SmilChr03G001537 Chr03 NC_080389.1:19282253-19282266promoter 内 1515-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19275888-19279780(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAAATATCACGTGG
SmilChr06G000256 Chr06 NC_080392.1:1688838-1688851promoter 内 1461-1474 bp - 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1691378-1694935(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACTTA
SmilChr06G000258 Chr06 NC_080392.1:1697376-1697389promoter 内 1460-1473 bp - 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1699917-1704303(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACTTA
SmilChr06G000257 Chr06 NC_080392.1:1693106-1693119promoter 内 1459-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1695648-1699202(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACTTA
SmilChr07G000071 Chr07 NC_080393.1:336428-336441promoter 内 1452-1465 bp + 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 331912-333892(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATATACA
SmilChr01G002234 Chr01 NC_080387.1:38851826-38851839promoter 内 1409-1422 bp + 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 38845130-38849247(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAATAC
SmilChr02G002499 Chr02 NC_080388.1:43430582-43430595promoter 内 1390-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43427181-43427984(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCATC
SmilChr08G000325 Chr08 NC_080394.1:2278862-2278875promoter 内 1266-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2274100-2276140(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACATTACACGTGG
SmilChr01G000222 Chr01 NC_080387.1:3930247-3930260promoter 内 1058-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3924057-3927317(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAACAC
SmilChr07G004066 Chr07 NC_080393.1:51957852-51957865promoter 内 1027-1040 bp + 2961 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 51960826-51961786(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr04G000421 Chr04 NC_080390.1:4471628-4471641promoter 内 1018-1031 bp - 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4474611-4480073(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCAGCG
SmilChr05G001046 Chr05 NC_080391.1:8627885-8627898promoter 内 983-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8623771-8624880(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG
SmilChr06G002351 Chr06 NC_080392.1:34207601-34207614promoter 内 960-973 bp + 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34210642-34215757(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGCTCACGTGC
SmilChr06G002195 Chr06 NC_080392.1:30488506-30488519promoter 内 954-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 30483934-30485472(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCATTC
SmilChr06G000523 Chr06 NC_080392.1:4305787-4305800promoter 内 900-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4308888-4313104(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr01G005061 Chr01 NC_080387.1:68523773-68523786promoter 内 773-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 68527001-68528110(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTTTA
SmilChr01G001179 Chr01 NC_080387.1:23846910-23846923promoter 内 764-777 bp + 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23836130-23843686(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGAACCG
SmilChr02G004215 Chr02 NC_080388.1:64394855-64394868promoter 内 760-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64388940-64391627(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTGGCTCACGTGT
SmilChr06G002350 Chr06 NC_080392.1:34207601-34207614promoter 内 676-689 bp + 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34198111-34204289(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCAACA
SmilChr04G001054 Chr04 NC_080390.1:15011232-15011245promoter 内 485-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15001703-15007729(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGTTTCA
SmilChr08G001123 Chr08 NC_080394.1:8742731-8742744promoter 内 467-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8737008-8739210(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAAAGATCACGTGC
SmilChr03G001015 Chr03 NC_080389.1:11665559-11665572promoter 内 458-471 bp + 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11669102-11672581(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAATGCTCACGTGC
SmilChr05G003854 Chr05 NC_080391.1:52087403-52087416promoter 内 429-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52090975-52095282(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTACCACGTGG
SmilChr05G003883 Chr05 NC_080391.1:52589934-52589947promoter 内 423-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52593512-52597822(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTACCACGTGG
SmilChr08G000559 Chr08 NC_080394.1:4070119-4070132promoter 内 420-433 bp - 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4064707-4066551(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAAAGTCACGTGT
SmilChr05G001653 Chr05 NC_080391.1:15606479-15606492promoter 内 417-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15610063-15611712(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACATTACACGTGG
SmilChr05G001476 Chr05 NC_080391.1:13535371-13535384promoter 内 416-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13521324-13531799(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATGAC
SmilChr04G001182 Chr04 NC_080390.1:17915111-17915124promoter 内 281-294 bp + 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 17918831-17919376(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCCATCACGTGG
SmilChr04G000362 Chr04 NC_080390.1:3598545-3598558promoter 内 269-282 bp - 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3602277-3605317(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr06G003021 Chr06 NC_080392.1:43067778-43067791promoter 内 109-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43071670-43075188(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACGTAC
SmilChr04G000781 Chr04 NC_080390.1:9578310-9578323promoter 内 65-78 bp + 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9582246-9584636(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGAGTCACGTGT
SmilChr03G001706 Chr03 NC_080389.1:22650324-22650337promoter 内 1687-1700 bp - 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 22652638-22657573(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAGAC
SmilChr08G000651 Chr08 NC_080394.1:4841925-4841938promoter 内 3926-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 4842000-4846180(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTTTGACACGTGG
SmilChr03G003347 Chr03 NC_080389.1:51787385-51787398promoter 内 3668-3681 bp - 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 51787718-51798385(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGCTAT
SmilChr03G001962 Chr03 NC_080389.1:28111183-28111196promoter 内 3564-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 28111620-28116633(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCTCAGCACGTGG
SmilChr04G003974 Chr04 NC_080390.1:55215582-55215595promoter 内 3430-3443 bp - 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 55216153-55218288(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAGTTTA
SmilChr07G004192 Chr07 NC_080393.1:53951127-53951140promoter 内 3394-3407 bp + 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 53947162-53950533(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGGTCA
SmilChr01G003018 Chr01 NC_080387.1:49207831-49207844promoter 内 3280-3293 bp - 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 49203621-49207123(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACTGTCCACGTGG
SmilChr06G000118 Chr06 NC_080392.1:828099-828112promoter 内 2821-2834 bp - 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 824868-826932(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAAGTTCACGTGC
SmilChr05G001505 Chr05 NC_080391.1:13796746-13796759promoter 内 2774-2787 bp - 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 13797973-13803947(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAAGCCAA
SmilChr08G000480 Chr08 NC_080394.1:3444044-3444057promoter 内 2684-2697 bp - 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 3439265-3442740(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAATGGTCACGTGA
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SmilChr01G002781 Chr01 NC_080387.1:46268736-46268749promoter 内 2492-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 46270245-46272496(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATAGTACACGTGG
SmilChr04G001846 Chr04 NC_080390.1:30071150-30071163promoter 内 2182-2195 bp + 1806 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 30067678-30069344(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGTCCAG
SmilChr01G000828 Chr01 NC_080387.1:17830968-17830981promoter 内 2175-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 17832794-17833947(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATCTCACGTGA
SmilChr04G001845 Chr04 NC_080390.1:30071150-30071163promoter 内 484-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 30057955-30067646(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGTCCAG