转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 94 / 149 下载 TSV

上一页 94 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000785 Chr03 NC_080389.1:8947025-8947035promoter 内 1896-1906 bp + 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8941038-8944930(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr05G000612 Chr05 NC_080391.1:4605404-4605414promoter 内 1887-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4607518-4608783(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr02G005231 Chr02 NC_080388.1:73510424-73510434promoter 内 1842-1852 bp + 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73504800-73508275(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAC
SmilChr03G004690 Chr03 NC_080389.1:64284808-64284818promoter 内 1569-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64280804-64282386(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr02G000694 Chr02 NC_080388.1:11030482-11030492promoter 内 1542-1552 bp + 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11032941-11043944(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr04G000880 Chr04 NC_080390.1:11197034-11197044promoter 内 1492-1502 bp + 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11199543-11203389(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr07G003027 Chr07 NC_080393.1:31301902-31301912promoter 内 1478-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31304425-31307019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr07G003034 Chr07 NC_080393.1:31371560-31371570promoter 内 1462-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 31374099-31375480(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr01G004885 Chr01 NC_080387.1:66913237-66913247promoter 内 1406-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66915832-66919325(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr02G005336 Chr02 NC_080388.1:74218295-74218305promoter 内 1266-1276 bp + 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74204023-74215570(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr02G004969 Chr02 NC_080388.1:71596619-71596629promoter 内 1192-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71591669-71593820(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr05G002223 Chr05 NC_080391.1:23751977-23751987promoter 内 1187-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 23754791-23754863(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G001067 Chr04 NC_080390.1:15275208-15275218promoter 内 1139-1149 bp - 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15278070-15289778(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr03G002036 Chr03 NC_080389.1:30718351-30718361promoter 内 1057-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30721295-30721639(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr07G000232 Chr07 NC_080393.1:1503105-1503115promoter 内 1029-1039 bp + 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1506077-1509292(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr01G005726 Chr01 NC_080387.1:73405963-73405973promoter 内 841-851 bp + 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73409123-73409703(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr03G001104 Chr03 NC_080389.1:12718000-12718010promoter 内 686-696 bp + 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12721315-12723204(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr06G001284 Chr06 NC_080392.1:13419835-13419845promoter 内 669-679 bp - 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13423167-13425705(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr01G003150 Chr01 NC_080387.1:50299946-50299956promoter 内 665-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50303282-50306067(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGC
SmilChr04G000869 Chr04 NC_080390.1:11197034-11197044promoter 内 645-655 bp + 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10980515-11193688(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGA
SmilChr05G002317 Chr05 NC_080391.1:24996658-24996668promoter 内 607-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24991817-24993274(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr05G000990 Chr05 NC_080391.1:8048347-8048357promoter 内 559-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8042929-8044915(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G000280 Chr04 NC_080390.1:2580320-2580330promoter 内 519-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 2583802-2584549(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr05G000993 Chr05 NC_080391.1:8048347-8048357promoter 内 492-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8051856-8053764(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr03G003188 Chr03 NC_080389.1:49345417-49345427promoter 内 459-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 49340636-49341885(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr02G000260 Chr02 NC_080388.1:3333070-3333080promoter 内 155-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3336916-3346337(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGA
SmilChr02G005108 Chr02 NC_080388.1:72598832-72598842promoter 内 123-133 bp - 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72591050-72594964(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G002396 Chr04 NC_080390.1:38473030-38473040promoter 内 85-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38476946-38483560(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAC
SmilChr01G002294 Chr01 NC_080387.1:39780890-39780900promoter 内 69-79 bp - 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39776189-39776968(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G000042 Chr04 NC_080390.1:409943-409953promoter 内 3975-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 409969-412055(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr04G000041 Chr04 NC_080390.1:409943-409953promoter 内 3821-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 397358-409773(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr02G001549 Chr02 NC_080388.1:28785563-28785573promoter 内 3666-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 28779199-28785238(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr03G001058 Chr03 NC_080389.1:12290835-12290845promoter 内 3506-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 12287789-12290350(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr03G004223 Chr03 NC_080389.1:60789179-60789189promoter 内 3254-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 60786613-60788442(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTAA
SmilChr04G002072 Chr04 NC_080390.1:33473619-33473629promoter 内 3158-3168 bp - 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 33467828-33472786(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTAA
SmilChr02G004445 Chr02 NC_080388.1:66807363-66807373promoter 内 2338-2348 bp - 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 66804618-66805710(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr06G000442 Chr06 NC_080392.1:3614289-3614299promoter 内 2330-2340 bp - 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3610290-3612628(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr02G002677 Chr02 NC_080388.1:46353669-46353679promoter 内 2073-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 46349234-46351751(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAC
SmilChr06G000444 Chr06 NC_080392.1:3614289-3614299promoter 内 1803-1813 bp - 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3616487-3616558(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr06G000445 Chr06 NC_080392.1:3614289-3614299promoter 内 1618-1628 bp - 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3616672-3616743(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr04G000043 Chr04 NC_080390.1:409943-409953promoter 内 1108-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 412836-414785(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr01G004343 Chr01 NC_080387.1:61595204-61595214promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 61598473-61602049(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTAA
SmilChr07G002442 Chr07 NC_080393.1:22868152-22868162promoter 内 3983-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22868170-22869894(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr05G002082 Chr05 NC_080391.1:21751711-21751721promoter 内 3932-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21746217-21751652(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr05G000626 Chr05 NC_080391.1:4730123-4730133promoter 内 3926-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4728857-4730058(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAGGCTGTCA
SmilChr07G002296 Chr07 NC_080393.1:21251981-21251991promoter 内 3907-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21250101-21251897(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAA
SmilChr03G001519 Chr03 NC_080389.1:18642524-18642534promoter 内 3861-3871 bp - 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18642664-18643384(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAA
SmilChr04G002459 Chr04 NC_080390.1:39413118-39413128promoter 内 3840-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39412281-39412967(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr02G004350 Chr02 NC_080388.1:65760895-65760905promoter 内 3821-3831 bp - 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65761075-65764167(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGT
SmilChr07G001185 Chr07 NC_080393.1:9011988-9011998promoter 内 3686-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9012303-9018089(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCC