Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G000943; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008897-RA_Salv SmilChr01G000943 MIKC_MADS XP_057790035.1 MP00508 CTTTCCTTTTTTGGAAAGT

可能结合的靶基因

7481 个结合位点 5979 个候选靶基因 第 96 / 120 下载 TSV

上一页 96 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003007 Chr03 NC_080389.1:46897390-46897408promoter 内 1250-1268 bp + 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 46900141-46909143(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTCCTTTCTAGGAAATA
SmilChr07G000448 Chr07 NC_080393.1:3165329-3165347promoter 内 1244-1262 bp - 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3159616-3162590(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTACTTATTTTGGAAAAG
SmilChr04G000890 Chr04 NC_080390.1:11416381-11416399promoter 内 1243-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 11419139-11424440(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GGTTTCCAAAAGAAGAGAG
SmilChr06G001965 Chr06 NC_080392.1:24672706-24672724promoter 内 1231-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24667499-24669954(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATTCCGATTTTGGAAAAT
SmilChr02G005326 Chr02 NC_080388.1:74124168-74124186promoter 内 1114-1132 bp + 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 74118531-74121299(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GACATCCCAATAAGGAAAG
SmilChr07G002137 Chr07 NC_080393.1:19513874-19513892promoter 内 1080-1098 bp + 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19516795-19517657(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTCAAGTAATT
SmilChr01G001872 Chr01 NC_080387.1:33747660-33747678promoter 内 1050-1068 bp + 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 33750611-33755923(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTGCCATTTTTGGACACT
SmilChr03G001797 Chr03 NC_080389.1:24587553-24587571promoter 内 1020-1038 bp - 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24590534-24591657(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr02G001595 Chr02 NC_080388.1:29773670-29773688promoter 内 997-1015 bp + 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 29768588-29770684(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr05G004084 Chr05 NC_080391.1:54699450-54699468promoter 内 939-957 bp - 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 54694122-54696406(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTTCTTTTTTGGCAACT
SmilChr08G004200 Chr08 NC_080394.1:51382627-51382645promoter 内 926-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 51376938-51379570(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACTTTCCCAACATGGAAGT
SmilChr04G002158 Chr04 NC_080390.1:34646111-34646129promoter 内 910-928 bp + 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 34641264-34643038(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GACAACCCAAAAAGGAAAC
SmilChr04G001865 Chr04 NC_080390.1:30392682-30392700promoter 内 901-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 30395782-30397510(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTTCCAAAAAAAGAATT
SmilChr03G000168 Chr03 NC_080389.1:1836108-1836126promoter 内 875-893 bp + 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1839234-1840592(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTACTAGATTTGGAAACC
SmilChr02G005274 Chr02 NC_080388.1:73821365-73821383promoter 内 845-863 bp - 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73813951-73818227(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTCCCAATTTTGGAAAGA
SmilChr02G000681 Chr02 NC_080388.1:10745440-10745458promoter 内 842-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10718197-10742299(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr07G000724 Chr07 NC_080393.1:5042424-5042442promoter 内 801-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 5037956-5039242(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACATCCAAAAAAGGAAAA
SmilChr07G003964 Chr07 NC_080393.1:50442513-50442531promoter 内 755-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50437842-50439285(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTCCCCTTTTTGGCAACA
SmilChr01G005780 Chr01 NC_080387.1:73913583-73913601promoter 内 627-645 bp - 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73906457-73910227(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TCTACCTTTTTGGGCAAAT
SmilChr05G003094 Chr05 NC_080391.1:39269664-39269682promoter 内 586-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 39264198-39266267(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr05G003034 Chr05 NC_080391.1:38016433-38016451promoter 内 515-533 bp + 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 38019919-38020756(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTGCCATTTTTGGACACT
SmilChr04G003717 Chr04 NC_080390.1:53474184-53474202promoter 内 472-490 bp + 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 53477713-53481957(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACTTCCAATTCTGGAAAGA
SmilChr02G000885 Chr02 NC_080388.1:15261059-15261077promoter 内 426-444 bp + 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 15256490-15257502(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr01G004290 Chr01 NC_080387.1:61095055-61095073promoter 内 392-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 61098664-61100306(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AGTTTCCAAAATGGGTAGA
SmilChr02G005276 Chr02 NC_080388.1:73821365-73821383promoter 内 287-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73825079-73825676(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TCTTTCCAAAATTGGGAAA
SmilChr08G002196 Chr08 NC_080394.1:19855120-19855138promoter 内 159-177 bp - 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19858962-19860237(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTGCCGAAAAAGGAATA
SmilChr04G001257 Chr04 NC_080390.1:19828071-19828089promoter 内 147-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 19831925-19836797(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAGGGGAAA
SmilChr08G003622 Chr08 NC_080394.1:39400963-39400981promoter 内 21-39 bp + 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 39404943-39407804(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTCCCCTTTTTGGCAACA
SmilChr08G001003 Chr08 NC_080394.1:7552408-7552426promoter 内 1-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 7556408-7562059(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATGTCTCAAAAAGGAAAA
SmilChr04G003248 Chr04 NC_080390.1:49239098-49239116promoter 内 3702-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 49239397-49240589(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTGGGACGTT
SmilChr07G003192 Chr07 NC_080393.1:34063513-34063531promoter 内 3690-3708 bp - 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 34063824-34065612(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GATACCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr07G003193 Chr07 NC_080393.1:34063513-34063531promoter 内 2978-2996 bp - 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 34064536-34064667(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GATACCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr08G002147 Chr08 NC_080394.1:19330411-19330429promoter 内 2180-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 19332232-19336673(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTTAAGCATTA
SmilChr04G003249 Chr04 NC_080390.1:49239098-49239116promoter 内 2090-2108 bp + 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 49241009-49241649(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTGGGACGTT
SmilChr08G000658 Chr08 NC_080394.1:4888244-4888262promoter 内 1120-1138 bp + 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 4891125-4892281(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTTTGGACCCC
SmilChr07G000464 Chr07 NC_080393.1:3273099-3273117promoter 内 1003-1021 bp + 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 3268767-3270119(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACGTCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr07G000465 Chr07 NC_080393.1:3273099-3273117promoter 内 3690-3708 bp + 293 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3271460-3272806(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACGTCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G003870 Chr02 NC_080388.1:60709900-60709918promoter 内 3676-3694 bp - 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60710225-60712683(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACGTCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr07G003195 Chr07 NC_080393.1:34114667-34114685promoter 内 3661-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34115007-34116790(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GATACCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr08G000721 Chr08 NC_080394.1:5343183-5343201promoter 内 3525-3543 bp - 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5343659-5347469(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TATTCCCAAAAATAGTAAG
SmilChr08G000702 Chr08 NC_080394.1:5222848-5222866promoter 内 3516-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5223333-5227220(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TATTCCCAAAAATAGTAAG
SmilChr06G001760 Chr06 NC_080392.1:20587955-20587973promoter 内 3474-3492 bp + 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20588482-20591157(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTGGGACGTT
SmilChr04G004088 Chr04 NC_080390.1:55903762-55903780promoter 内 3470-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55904293-55905948(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTGGGATTAC
SmilChr02G004863 Chr02 NC_080388.1:70756759-70756777promoter 内 3439-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70757321-70760043(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTGTCCAAAAATGGAAGG
SmilChr01G005512 Chr01 NC_080387.1:71962231-71962249promoter 内 3315-3333 bp + 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 71959914-71961563(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACGTCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr04G000241 Chr04 NC_080390.1:2154693-2154711promoter 内 3294-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2152602-2154004(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTTAGAAGTC
SmilChr05G003543 Chr05 NC_080391.1:47301495-47301513promoter 内 3248-3266 bp - 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47302248-47304332(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTACTAAAAAGGAAAG
SmilChr03G000921 Chr03 NC_080389.1:10530921-10530939promoter 内 3164-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10531758-10532970(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCTTTTTTTGGTTTCC
SmilChr02G000822 Chr02 NC_080388.1:13850188-13850206promoter 内 3105-3123 bp - 878 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 13837220-13849310(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTCTATTTTTGGCAATA
SmilChr02G000437 Chr02 NC_080388.1:5702402-5702420promoter 内 3027-3045 bp - 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5699949-5701446(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTGCTGTTTTTGGTAAAT