转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005298; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002362-RA_Salv SmilChr01G005298 ARR-B XP_057788621.1 MP00010 AAAGATACGG

可能结合的靶基因

9778 个结合位点 8344 个候选靶基因 第 97 / 167 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G004031 Chr04 NC_080390.1:55568482-55568491promoter 内 2887-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 55563115-55567377(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr01G001736 Chr01 NC_080387.1:31958202-31958211promoter 内 2884-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31955859-31957094(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr01G005014 Chr01 NC_080387.1:68154817-68154826promoter 内 2879-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 68147387-68153704(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr02G001654 Chr02 NC_080388.1:30694592-30694601promoter 内 2879-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 30689682-30693479(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr06G002107 Chr06 NC_080392.1:28149778-28149787promoter 内 2855-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28147321-28148641(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr06G002108 Chr06 NC_080392.1:28159159-28159168promoter 内 2855-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28156702-28158022(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr06G003097 Chr06 NC_080392.1:43817699-43817708promoter 内 2842-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43818858-43822167(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr08G001128 Chr08 NC_080394.1:8814596-8814605promoter 内 2841-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8815756-8817858(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr01G000420 Chr01 NC_080387.1:8462458-8462467promoter 内 2838-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8458063-8461304(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr06G000269 Chr06 NC_080392.1:1822994-1823003promoter 内 2831-2840 bp + 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1824164-1824278(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr08G003702 Chr08 NC_080394.1:41463237-41463246promoter 内 2823-2832 bp - 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41460873-41462068(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G003087 Chr07 NC_080393.1:32605194-32605203promoter 内 2814-2823 bp - 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32602907-32604016(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr05G001653 Chr05 NC_080391.1:15608875-15608884promoter 内 2813-2822 bp - 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15610063-15611712(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr01G000349 Chr01 NC_080387.1:7166524-7166533promoter 内 2811-2820 bp + 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7167714-7170836(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G003297 Chr07 NC_080393.1:34786002-34786011promoter 内 2806-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34777694-34784816(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr07G001324 Chr07 NC_080393.1:10185187-10185196promoter 内 2800-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 10180925-10183995(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr05G002118 Chr05 NC_080391.1:22254823-22254832promoter 内 2799-2808 bp - 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 22252551-22253630(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G003718 Chr07 NC_080393.1:44998657-44998666promoter 内 2791-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 44999867-45005975(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr03G002261 Chr03 NC_080389.1:35620348-35620357promoter 内 2777-2786 bp - 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 35615352-35619133(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr04G003657 Chr04 NC_080390.1:53049828-53049837promoter 内 2774-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53051055-53061009(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G004016 Chr07 NC_080393.1:51239167-51239176promoter 内 2771-2780 bp + 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51240397-51241537(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr01G003578 Chr01 NC_080387.1:54364541-54364550promoter 内 2769-2778 bp + 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54365773-54368215(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr08G004828 Chr08 NC_080394.1:57532434-57532443promoter 内 2766-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 57527798-57531208(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G002869 Chr07 NC_080393.1:28900825-28900834promoter 内 2750-2759 bp + 1242 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28895037-28899583(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr02G004573 Chr02 NC_080388.1:68233269-68233278promoter 内 2747-2756 bp + 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 68234523-68238842(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr04G003304 Chr04 NC_080390.1:49772588-49772597promoter 内 2720-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49773869-49777293(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr04G000201 Chr04 NC_080390.1:1791389-1791398promoter 内 2719-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1792671-1795130(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr02G005547 Chr02 NC_080388.1:75458797-75458806promoter 内 2712-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 75460086-75462745(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr01G002773 Chr01 NC_080387.1:46186830-46186839promoter 内 2710-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 46179891-46185548(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr04G002969 Chr04 NC_080390.1:46048743-46048752promoter 内 2703-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 46050041-46055518(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G003104 Chr07 NC_080393.1:32869331-32869340promoter 内 2702-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32870630-32872973(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr03G002849 Chr03 NC_080389.1:45040224-45040233promoter 内 2694-2703 bp - 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45041531-45047348(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr02G001112 Chr02 NC_080388.1:20027160-20027169promoter 内 2683-2692 bp + 1309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20022826-20025851(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr04G003281 Chr04 NC_080390.1:49479283-49479292promoter 内 2680-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49480604-49483137(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr07G000411 Chr07 NC_080393.1:2835888-2835897promoter 内 2679-2688 bp - 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2837210-2848285(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr06G002106 Chr06 NC_080392.1:28140395-28140404promoter 内 2677-2686 bp + 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28137937-28139080(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr01G001305 Chr01 NC_080387.1:25999568-25999577promoter 内 2669-2678 bp - 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 26000900-26005209(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr05G002781 Chr05 NC_080391.1:32497574-32497583promoter 内 2663-2672 bp - 1329 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 32498912-32501073(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr07G004358 Chr07 NC_080393.1:56134712-56134721promoter 内 2628-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56136085-56138029(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr06G002817 Chr06 NC_080392.1:40871284-40871293promoter 内 2622-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40872663-40881508(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G001711 Chr07 NC_080393.1:14493902-14493911promoter 内 2604-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14495299-14496084(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr01G005914 Chr01 NC_080387.1:74977817-74977826promoter 内 2593-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 74979225-74984711(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr02G005325 Chr02 NC_080388.1:74116080-74116089promoter 内 2582-2591 bp + 1410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 74117499-74118391(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr05G003671 Chr05 NC_080391.1:49656884-49656893promoter 内 2576-2585 bp + 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49658309-49660403(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr07G000972 Chr07 NC_080393.1:7044279-7044288promoter 内 2574-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7045706-7048433(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr02G000952 Chr02 NC_080388.1:16561302-16561311promoter 内 2572-2581 bp + 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 16562731-16563586(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr02G001609 Chr02 NC_080388.1:29955407-29955416promoter 内 2548-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 29956860-29957405(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT
SmilChr05G003946 Chr05 NC_080391.1:53228503-53228512promoter 内 2545-2554 bp + 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53229959-53230754(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr02G003377 Chr02 NC_080388.1:54910549-54910558promoter 内 2533-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54912017-54912922(+) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 AAAGATATGC
SmilChr05G003670 Chr05 NC_080391.1:49656884-49656893promoter 内 2512-2521 bp + 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49647291-49655404(-) SMil_00002362-RA_Salv MP00010 GCATATCTTT