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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 97 / 138 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000477 Chr02 NC_080388.1:6568327-6568339promoter 内 88-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6563890-6564426(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGATTTGACTATG
SmilChr01G000315 Chr01 NC_080387.1:6075475-6075487promoter 内 3-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6069699-6071489(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAAGTCAACAAT
SmilChr03G003001 Chr03 NC_080389.1:46820511-46820523promoter 内 2107-2119 bp - 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 46822405-46828848(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAAGGCC
SmilChr01G004771 Chr01 NC_080387.1:65888853-65888865promoter 内 3755-3767 bp - 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 65882451-65888619(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTAAT
SmilChr03G002347 Chr03 NC_080389.1:37020517-37020529promoter 内 2353-2365 bp - 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 37015279-37018881(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTTTTGACTAAT
SmilChr01G003571 Chr01 NC_080387.1:54286781-54286793promoter 内 2167-2179 bp - 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 54283439-54284959(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTAAT
SmilChr03G000817 Chr03 NC_080389.1:9341190-9341202promoter 内 2083-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 9336319-9339284(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGTTGACTTTG
SmilChr01G005478 Chr01 NC_080387.1:71764909-71764921promoter 内 1764-1776 bp + 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 71767146-71770548(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTGTA
SmilChr01G003572 Chr01 NC_080387.1:54286781-54286793promoter 内 1718-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 54289064-54290069(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACTAT
SmilChr03G003222 Chr03 NC_080389.1:49892511-49892523promoter 内 1430-1442 bp - 2559 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 49888345-49889952(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCTG
SmilChr01G002662 Chr01 NC_080387.1:44867851-44867863promoter 内 3512-3524 bp + 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 44868340-44870608(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGTGTTGACTACC
SmilChr01G001282 Chr01 NC_080387.1:25603159-25603171promoter 内 3272-3284 bp - 717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 25600152-25602442(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTAAT
SmilChr03G003892 Chr03 NC_080389.1:58011765-58011777promoter 内 2900-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 58012866-58013804(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAGTTGACTGTA
SmilChr01G000339 Chr01 NC_080387.1:6937137-6937149promoter 内 2265-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 6938873-6941858(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCTG
SmilChr02G003832 Chr02 NC_080388.1:59964762-59964774promoter 内 2254-2266 bp - 1735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 59958803-59963027(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAGTTTGACTAGC
SmilChr02G005308 Chr02 NC_080388.1:73995551-73995563promoter 内 1986-1998 bp - 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 73991125-73993548(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGGTTGACTCAT
SmilChr01G002804 Chr01 NC_080387.1:46577005-46577017promoter 内 1911-1923 bp + 2078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 46579095-46593636(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTTTTTGACTAGT
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SmilChr02G004091 Chr02 NC_080388.1:63181281-63181293promoter 内 1678-1690 bp - 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 63178134-63178970(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCTG
SmilChr01G001517 Chr01 NC_080387.1:29046330-29046342promoter 内 1337-1349 bp + 2652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 29048994-29051927(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCTG
SmilChr02G003231 Chr02 NC_080388.1:53586991-53587003promoter 内 1149-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 53579680-53584151(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACATA
SmilChr02G002396 Chr02 NC_080388.1:41857195-41857207promoter 内 985-997 bp - 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 41860211-41863413(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTAAGTCAACTAT
SmilChr03G000857 Chr03 NC_080389.1:9799713-9799725promoter 内 881-893 bp - 3108 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 9789202-9796605(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGAGTTGACTGCA
SmilChr02G005310 Chr02 NC_080388.1:73995551-73995563promoter 内 824-836 bp - 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 73998728-74000883(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATGAGTCAACCAA
SmilChr03G002539 Chr03 NC_080389.1:40546039-40546051promoter 内 820-832 bp - 3169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 40549220-40551276(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACTTC
SmilChr02G004090 Chr02 NC_080388.1:63181281-63181293promoter 内 298-310 bp - 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 63172916-63177590(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCTG
SmilChr01G005286 Chr01 NC_080387.1:70219222-70219234promoter 内 3938-3950 bp - 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70219285-70220126(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACCAA
SmilChr01G005268 Chr01 NC_080387.1:70124375-70124387promoter 内 3909-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70124467-70125279(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACCAA
SmilChr02G005528 Chr02 NC_080388.1:75346903-75346915promoter 内 3888-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75347016-75350583(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGTTGACTTGT
SmilChr02G001685 Chr02 NC_080388.1:31092772-31092784promoter 内 3856-3868 bp + 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31091839-31092639(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAAACAA
SmilChr01G005450 Chr01 NC_080387.1:71561928-71561940promoter 内 3791-3803 bp + 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 71561439-71561730(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACAGA
SmilChr01G003346 Chr01 NC_080387.1:52227896-52227908promoter 内 3567-3579 bp + 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52228330-52230730(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TATGTTGACTCGT
SmilChr01G000053 Chr01 NC_080387.1:848156-848168promoter 内 3532-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 848625-850513(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAAGTCAACTTG
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SmilChr01G002355 Chr01 NC_080387.1:40738141-40738153promoter 内 3314-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40738828-40740898(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACTTG
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SmilChr01G001283 Chr01 NC_080387.1:25603159-25603171promoter 内 3310-3322 bp - 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 25603850-25605025(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAACTAT
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SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43604934-43604946promoter 内 3183-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 43605752-43610948(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATAAGTCAACAAG
SmilChr01G001906 Chr01 NC_080387.1:34151304-34151316promoter 内 3061-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34149806-34150376(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CTGAGTCAACCAA
SmilChr03G000688 Chr03 NC_080389.1:7683313-7683325promoter 内 2897-2909 bp + 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 7680743-7682221(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAGAGTCAACATA
SmilChr01G005117 Chr01 NC_080387.1:68948381-68948393promoter 内 2894-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68949488-68952268(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATGTTGACTCGA
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SmilChr02G001435 Chr02 NC_080388.1:27048486-27048498promoter 内 2805-2817 bp + 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27049682-27054230(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTTTTGACTAAT
SmilChr02G002061 Chr02 NC_080388.1:37129307-37129319promoter 内 2760-2772 bp - 1229 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37130548-37136485(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTAGTCAAAAGT
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SmilChr01G004388 Chr01 NC_080387.1:62055511-62055523promoter 内 2612-2624 bp + 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62048214-62054134(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATCAGTCAACAAG
SmilChr02G002974 Chr02 NC_080388.1:50275815-50275827promoter 内 2462-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50272572-50274288(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAGAGTCAACCAA