转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 99 / 134 下载 TSV

上一页 99 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002161 Chr03 NC_080389.1:33646027-33646039promoter 内 1466-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33648562-33653721(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTGTT
SmilChr01G002666 Chr01 NC_080387.1:44886713-44886725promoter 内 1402-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44883300-44884126(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTGCGGATAAGC
SmilChr01G002091 Chr01 NC_080387.1:36935038-36935050promoter 内 1211-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36937828-36939277(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACACA
SmilChr02G003273 Chr02 NC_080388.1:54007605-54007617promoter 内 1143-1155 bp + 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54010463-54013641(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr02G001886 Chr02 NC_080388.1:34172157-34172169promoter 内 1092-1104 bp - 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 34175066-34177047(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCATCTC
SmilChr01G004356 Chr01 NC_080387.1:61746609-61746621promoter 内 1067-1079 bp - 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 61749543-61754619(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCGTTCT
SmilChr02G001696 Chr02 NC_080388.1:31236286-31236298promoter 内 1067-1079 bp + 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 31239220-31241502(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr03G002313 Chr03 NC_080389.1:36389311-36389323promoter 内 866-878 bp - 3123 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36383127-36386188(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTATGGATAAGT
SmilChr03G001265 Chr03 NC_080389.1:14649664-14649676promoter 内 849-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14645299-14646524(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAATA
SmilChr02G001922 Chr02 NC_080388.1:34640936-34640948promoter 内 802-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 34637186-34637749(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCGTGT
SmilChr02G000420 Chr02 NC_080388.1:5321787-5321799promoter 内 779-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5325009-5328111(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATATATGATAAGG
SmilChr02G005361 Chr02 NC_080388.1:74326340-74326352promoter 内 662-674 bp - 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 74329679-74332328(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATAAT
SmilChr02G001406 Chr02 NC_080388.1:26656487-26656499promoter 内 592-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26650290-26653090(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACGCC
SmilChr03G002329 Chr03 NC_080389.1:36652290-36652302promoter 内 582-594 bp - 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36646086-36648883(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTATGGATAAGT
SmilChr02G000427 Chr02 NC_080388.1:5462735-5462747promoter 内 569-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5458164-5459315(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTTGGATAACC
SmilChr03G002095 Chr03 NC_080389.1:32385386-32385398promoter 内 557-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 32388830-32389744(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCGGACT
SmilChr03G002126 Chr03 NC_080389.1:33112151-33112163promoter 内 407-419 bp + 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33115745-33116689(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAGGGATAAGA
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27633880-27633892promoter 内 365-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 27621750-27630256(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTATCCAAATT
SmilChr01G001451 Chr01 NC_080387.1:28212445-28212457promoter 内 321-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28205401-28208777(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTGTT
SmilChr03G000353 Chr03 NC_080389.1:3960331-3960343promoter 内 197-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3953502-3956539(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATATAT
SmilChr02G001568 Chr02 NC_080388.1:29090579-29090591promoter 内 164-176 bp + 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29094416-29100266(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATATGGATAATA
SmilChr01G002018 Chr01 NC_080387.1:35758335-35758347promoter 内 50-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35762286-35763974(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCGTT
SmilChr02G001983 Chr02 NC_080388.1:35778980-35778992promoter 内 3974-3986 bp - 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 35777989-35778965(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAATA
SmilChr02G004121 Chr02 NC_080388.1:63483402-63483414promoter 内 3953-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 63483450-63491767(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACCTA
SmilChr02G002720 Chr02 NC_080388.1:47039277-47039289promoter 内 3852-3864 bp + 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 47031540-47039140(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTTA
SmilChr01G003226 Chr01 NC_080387.1:51033770-51033782promoter 内 3609-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 51030576-51033390(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAATA
SmilChr03G002139 Chr03 NC_080389.1:33327569-33327581promoter 内 3064-3076 bp - 925 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 33324204-33326644(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGACAGATAAGG
SmilChr03G000373 Chr03 NC_080389.1:4168615-4168627promoter 内 2954-2966 bp + 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4164639-4167580(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCACCACC
SmilChr01G004959 Chr01 NC_080387.1:67686431-67686443promoter 内 2785-2797 bp + 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 67687647-67692378(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAATA
SmilChr03G001064 Chr03 NC_080389.1:12359782-12359794promoter 内 2115-2127 bp + 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 12356058-12357908(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCACCATA
SmilChr02G003339 Chr02 NC_080388.1:54603514-54603526promoter 内 1689-1701 bp + 2300 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 54605826-54606361(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTATCTGATAAGG
SmilChr03G000419 Chr03 NC_080389.1:4522258-4522270promoter 内 1596-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 4524663-4526345(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCACCATA
SmilChr01G001379 Chr01 NC_080387.1:27190645-27190657promoter 内 1404-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27187377-27188060(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATTATCCATATC
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73209060-73209072promoter 内 1199-1211 bp + 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 73211862-73215804(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGGGGGGATAAGA
SmilChr02G004988 Chr02 NC_080388.1:71756390-71756402promoter 内 1145-1157 bp + 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 71752724-71753546(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAGATC
SmilChr02G005545 Chr02 NC_080388.1:75455951-75455963promoter 内 777-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 75446144-75452739(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAAACC
SmilChr02G000232 Chr02 NC_080388.1:3001506-3001518promoter 内 466-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 2992261-2997983(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACACAAGATAAGG
SmilChr01G005009 Chr01 NC_080387.1:68118259-68118271promoter 内 3981-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 68118279-68120350(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAACTGATAAGG
SmilChr02G004327 Chr02 NC_080388.1:65555354-65555366promoter 内 3940-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 65555415-65558922(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTCATCCATACG
SmilChr03G000045 Chr03 NC_080389.1:497205-497217promoter 内 3916-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 493017-497132(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTTA
SmilChr01G005542 Chr01 NC_080387.1:72239948-72239960promoter 内 3738-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 72239299-72239697(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTTGGATAATA
SmilChr03G000042 Chr03 NC_080389.1:486254-486266promoter 内 3682-3694 bp + 307 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 481805-485947(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAGGTA
SmilChr02G005024 Chr02 NC_080388.1:71988217-71988229promoter 内 3618-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71985741-71987846(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTTA
SmilChr01G001326 Chr01 NC_080387.1:26372112-26372124promoter 内 3601-3613 bp - 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26372512-26378022(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCCAATA
SmilChr02G003828 Chr02 NC_080388.1:59940429-59940441promoter 内 3468-3480 bp + 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 59940962-59943265(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTATTTGATAAGG
SmilChr02G000244 Chr02 NC_080388.1:3148271-3148283promoter 内 3444-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3148828-3151320(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATCCTGGATAAGA
SmilChr01G000528 Chr01 NC_080387.1:10748922-10748934promoter 内 3350-3362 bp + 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 10749573-10851771(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGTTGGATAAGC
SmilChr01G004348 Chr01 NC_080387.1:61643518-61643530promoter 内 3217-3229 bp + 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61644302-61653705(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTGGGATAAGT
SmilChr01G003915 Chr01 NC_080387.1:57429340-57429352promoter 内 3205-3217 bp - 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57430136-57434206(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTTA
SmilChr01G001299 Chr01 NC_080387.1:25858657-25858669promoter 内 3146-3158 bp - 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 25859512-25865599(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAAATA