转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004179; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012156-RA_Salv SmilChr03G004179 WRKY XP_057799230.1 MP00464 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9864 个结合位点 7299 个候选靶基因 第 100 / 146 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002330 Chr02 NC_080388.1:40999412-40999425promoter 内 1234-1247 bp - 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41002179-41007005(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAGTGTCAACGCT
SmilChr03G002272 Chr03 NC_080389.1:35863597-35863610promoter 内 1162-1175 bp - 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35866436-35868613(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GCAGAGTCAACACT
SmilChr03G000831 Chr03 NC_080389.1:9527352-9527365promoter 内 1128-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 9523425-9524492(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTGGTTGACTGTTG
SmilChr03G002734 Chr03 NC_080389.1:43438772-43438785promoter 内 1096-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43441677-43449727(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAAAGTCAAACAT
SmilChr01G002092 Chr01 NC_080387.1:36936405-36936418promoter 内 1061-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36939345-36943434(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAGTTGACTTCAA
SmilChr03G000650 Chr03 NC_080389.1:7241271-7241284promoter 内 1061-1074 bp - 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 7237817-7238344(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GAATTTGACTTTGA
SmilChr02G003151 Chr02 NC_080388.1:52538877-52538890promoter 内 1041-1054 bp + 2947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52541837-52543643(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAATTTGACTTTCG
SmilChr04G003696 Chr04 NC_080390.1:53329202-53329215promoter 内 962-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 53332241-53333104(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCAAGTCAACAAC
SmilChr02G002956 Chr02 NC_080388.1:50098067-50098080promoter 内 828-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50093535-50094907(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTGGTTGACTGTTG
SmilChr01G004428 Chr01 NC_080387.1:62387721-62387734promoter 内 815-828 bp + 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62382121-62384548(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAAAAGTCAAAATT
SmilChr02G003861 Chr02 NC_080388.1:60528374-60528387promoter 内 811-824 bp + 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60531564-60532579(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATAGTTGACTATAT
SmilChr01G000577 Chr01 NC_080387.1:11988748-11988761promoter 内 802-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11991947-11992411(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAAAGTCAAATAC
SmilChr03G001009 Chr03 NC_080389.1:11569062-11569075promoter 内 711-724 bp - 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11572352-11573228(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GACGAGTCAACCCT
SmilChr03G004185 Chr03 NC_080389.1:60550268-60550281promoter 内 704-717 bp + 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60553565-60555593(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AGATTTGACTTTAC
SmilChr02G003834 Chr02 NC_080388.1:60026420-60026433promoter 内 687-700 bp + 3301 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 60029734-60031099(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AATTTTGACTTTTG
SmilChr03G003122 Chr03 NC_080389.1:48384959-48384972promoter 内 636-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48379685-48381607(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCCGTTGACCTGAC
SmilChr01G006192 Chr01 NC_080387.1:77532873-77532886promoter 内 623-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 77523699-77529508(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGAGTTGACTGTCC
SmilChr04G000828 Chr04 NC_080390.1:10433556-10433569promoter 内 596-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10436961-10437734(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACCTTTGACTTGCC
SmilChr02G002195 Chr02 NC_080388.1:39166163-39166176promoter 内 576-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39161798-39162751(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CCGGAGTCAACCGC
SmilChr01G003015 Chr01 NC_080387.1:49183068-49183081promoter 内 566-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49178327-49179646(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATATAGTCAACACT
SmilChr04G002796 Chr04 NC_080390.1:43824772-43824785promoter 内 553-566 bp + 3435 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43820057-43821337(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 AAAAAGTCAATCGC
SmilChr02G002957 Chr02 NC_080388.1:50098067-50098080promoter 内 487-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50101581-50105146(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAACAGTCAACCAA
SmilChr03G003831 Chr03 NC_080389.1:57406880-57406893promoter 内 463-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 57410418-57417373(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TCATTTGACTTTTA
SmilChr01G000593 Chr01 NC_080387.1:12925371-12925384promoter 内 460-473 bp + 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12914528-12921843(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTAGGTCAACGGA
SmilChr01G002882 Chr01 NC_080387.1:47435286-47435299promoter 内 447-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47438840-47442897(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTAAGTCAAAGCT
SmilChr01G006125 Chr01 NC_080387.1:76758739-76758752promoter 内 406-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 76762334-76763963(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTATGGTCAACGCA
SmilChr04G000212 Chr04 NC_080390.1:1888063-1888076promoter 内 396-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1878878-1884471(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATGTTTGACTTTAT
SmilChr01G003425 Chr01 NC_080387.1:52927511-52927524promoter 内 352-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52917001-52923875(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CATGTTGACTTCTC
SmilChr01G002602 Chr01 NC_080387.1:44224058-44224071promoter 内 241-254 bp + 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 44219221-44220311(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTATGGTCAACGCA
SmilChr02G005537 Chr02 NC_080388.1:75411979-75411992promoter 内 200-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 75404654-75408191(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGACAGTCAACTCC
SmilChr01G005291 Chr01 NC_080387.1:70228077-70228090promoter 内 197-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70231881-70234315(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACCGTGG
SmilChr04G002173 Chr04 NC_080390.1:35123082-35123095promoter 内 193-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35126890-35132312(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTCATTGACTTTAT
SmilChr01G005270 Chr01 NC_080387.1:70128175-70128188promoter 内 113-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70132063-70133235(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACCGTGG
SmilChr01G001960 Chr01 NC_080387.1:34863333-34863346promoter 内 112-125 bp - 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34853780-34859457(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ACTGTTGACTTCCC
SmilChr01G002582 Chr01 NC_080387.1:43959923-43959936promoter 内 58-71 bp - 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43953659-43955993(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACTAACA
SmilChr01G000632 Chr01 NC_080387.1:14213169-14213182promoter 内 38-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 14206604-14209219(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CAATAGTCAACAAA
SmilChr03G004281 Chr03 NC_080389.1:61232028-61232041promoter 内 38-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 61235991-61239443(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 CGCGTTGACTAACA
SmilChr04G003177 Chr04 NC_080390.1:48450868-48450881promoter 内 6-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48454863-48455896(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TGTTAGTCAACGCG
SmilChr02G003185 Chr02 NC_080388.1:52995501-52995514promoter 内 710-723 bp - 3278 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 52998792-53001288(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TATAAGTCAAAGTT
SmilChr02G001594 Chr02 NC_080388.1:29710046-29710059promoter 内 3665-3678 bp - 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 29710382-29711865(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 TTGAAGTCAACTTT
SmilChr04G000095 Chr04 NC_080390.1:867730-867743promoter 内 3651-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 868080-869279(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GTGTTTGACTTTAA
SmilChr04G001142 Chr04 NC_080390.1:16822539-16822552promoter 内 3585-3598 bp + 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 16822955-16825859(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTTTTGACTTTTT
SmilChr03G002595 Chr03 NC_080389.1:41248692-41248705promoter 内 3565-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 41249128-41252082(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTTTTGACTTTTT
SmilChr01G003574 Chr01 NC_080387.1:54299374-54299387promoter 内 3223-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 54300152-54302260(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATCTTTGACTTGCT
SmilChr04G001808 Chr04 NC_080390.1:29565195-29565208promoter 内 3185-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 29566011-29569111(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTGTTGACTATTA
SmilChr03G000560 Chr03 NC_080389.1:6091502-6091515promoter 内 3080-3093 bp + 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 6092423-6094576(+) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 ATTTTTGACTTTTT
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SmilChr02G003949 Chr02 NC_080388.1:61651812-61651825promoter 内 2973-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 61650183-61650797(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GATTTTGACTTTGG
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SmilChr01G004553 Chr01 NC_080387.1:63639176-63639189promoter 内 2582-2595 bp - 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 63635851-63637770(-) SMil_00012156-RA_Salv MP00464 GGTTTTGACTTTAT