转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 100 / 153 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004333 Chr02 NC_080388.1:65599134-65599143promoter 内 289-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 65593541-65595431(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr04G001846 Chr04 NC_080390.1:30073217-30073226promoter 内 119-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 30067678-30069344(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGTCGGAGG
SmilChr03G002940 Chr03 NC_080389.1:46124284-46124293promoter 内 3990-3999 bp + 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 46123485-46124282(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTACCGACAA
SmilChr04G003032 Chr04 NC_080390.1:46772598-46772607promoter 内 3970-3979 bp - 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 46772629-46773650(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCTCCGACAG
SmilChr04G003191 Chr04 NC_080390.1:48633504-48633513promoter 内 3970-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48632178-48633482(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCTCCGACAG
SmilChr05G001476 Chr05 NC_080391.1:13531840-13531849promoter 内 3951-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 13521324-13531799(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr04G000195 Chr04 NC_080390.1:1725188-1725197promoter 内 3947-3956 bp + 45 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 1724233-1725143(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCA
SmilChr01G000991 Chr01 NC_080387.1:20931124-20931133promoter 内 3945-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 20931180-20931512(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTACCGACAA
SmilChr03G004667 Chr03 NC_080389.1:64136921-64136930promoter 内 3943-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 64135070-64136872(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr01G005116 Chr01 NC_080387.1:68947677-68947686promoter 内 3935-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68947743-68949016(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr03G001560 Chr03 NC_080389.1:19673859-19673868promoter 内 3935-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 19672668-19673802(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr01G002428 Chr01 NC_080387.1:41818089-41818098promoter 内 3933-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 41818157-41820576(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTACCGACAA
SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31013217-31013226promoter 内 3927-3936 bp + 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 31013291-31016406(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr01G005114 Chr01 NC_080387.1:68914420-68914429promoter 内 3922-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68914499-68919240(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr03G003119 Chr03 NC_080389.1:48353775-48353784promoter 内 3902-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48353874-48354685(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr03G002816 Chr03 NC_080389.1:44645788-44645797promoter 内 3871-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44645918-44650101(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9632756-9632765promoter 内 3854-3863 bp + 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9631854-9632618(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr05G000910 Chr05 NC_080391.1:7222263-7222272promoter 内 3853-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7222411-7228531(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCTCCGACAG
SmilChr03G000779 Chr03 NC_080389.1:8880532-8880541promoter 内 3841-3850 bp - 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8876744-8880381(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr04G000450 Chr04 NC_080390.1:4771822-4771831promoter 内 3818-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4769472-4771648(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCTCCGACAG
SmilChr02G005535 Chr02 NC_080388.1:75398971-75398980promoter 内 3798-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 75395535-75398777(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr05G002015 Chr05 NC_080391.1:20899916-20899925promoter 内 3788-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 20900129-20900494(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr02G002849 Chr02 NC_080388.1:48668759-48668768promoter 内 3786-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48668974-48673486(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr03G000030 Chr03 NC_080389.1:377940-377949promoter 内 3786-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 378155-379450(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAT
SmilChr01G002496 Chr01 NC_080387.1:42761622-42761631promoter 内 3776-3785 bp - 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42756988-42761406(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr01G005143 Chr01 NC_080387.1:69223477-69223486promoter 内 3776-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 69223702-69225549(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAT
SmilChr05G000494 Chr05 NC_080391.1:3853633-3853642promoter 内 3754-3763 bp - 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3853880-3854869(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCA
SmilChr01G004061 Chr01 NC_080387.1:59033716-59033725promoter 内 3731-3740 bp + 261 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59033060-59033455(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr01G003711 Chr01 NC_080387.1:55458801-55458810promoter 内 3700-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55459102-55462477(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCA
SmilChr01G002560 Chr01 NC_080387.1:43739983-43739992promoter 内 3684-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 43740300-43741517(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr03G004037 Chr03 NC_080389.1:59379642-59379651promoter 内 3682-3691 bp + 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59379961-59382963(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr04G001419 Chr04 NC_080390.1:23048117-23048126promoter 内 3667-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23040339-23047792(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr01G004045 Chr01 NC_080387.1:58877424-58877433promoter 内 3655-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58877770-58889743(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr03G003284 Chr03 NC_080389.1:50873797-50873806promoter 内 3631-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 50874167-50874983(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACCA
SmilChr01G001861 Chr01 NC_080387.1:33569905-33569914promoter 内 3627-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 33570279-33572198(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr03G004156 Chr03 NC_080389.1:60346112-60346121promoter 内 3614-3623 bp - 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60337502-60345734(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr05G001486 Chr05 NC_080391.1:13625184-13625193promoter 内 3614-3623 bp - 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 13620632-13624806(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr03G002303 Chr03 NC_080389.1:36264715-36264724promoter 内 3612-3621 bp + 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 36265104-36267631(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAT
SmilChr04G003120 Chr04 NC_080390.1:47767902-47767911promoter 内 3603-3612 bp + 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47759909-47767513(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCTCCGACAG
SmilChr04G002301 Chr04 NC_080390.1:37255361-37255370promoter 内 3583-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37255779-37260849(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATTCCGACAT
SmilChr04G002776 Chr04 NC_080390.1:43570753-43570762promoter 内 3555-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 43571199-43574763(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr02G005154 Chr02 NC_080388.1:72906628-72906637promoter 内 3522-3531 bp + 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 72907107-72915812(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGTCGGAGG
SmilChr01G001378 Chr01 NC_080387.1:27152191-27152200promoter 内 3511-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27147069-27151710(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr02G001293 Chr02 NC_080388.1:23818220-23818229promoter 内 3508-3517 bp - 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23815193-23817736(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr04G004012 Chr04 NC_080390.1:55420891-55420900promoter 内 3506-3515 bp - 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55421386-55423157(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr04G004109 Chr04 NC_080390.1:56034273-56034282promoter 内 3470-3479 bp + 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56031789-56033751(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTACCGACAA
SmilChr01G005474 Chr01 NC_080387.1:71731470-71731479promoter 内 3463-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71722317-71730941(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AACCCGACAA
SmilChr03G004219 Chr03 NC_080389.1:60760819-60760828promoter 内 3454-3463 bp - 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60759102-60760281(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTT
SmilChr01G003529 Chr01 NC_080387.1:53921860-53921869promoter 内 3446-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53922415-53926705(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT
SmilChr01G001714 Chr01 NC_080387.1:31609000-31609009promoter 内 3439-3448 bp - 553 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 31605432-31608447(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAT