转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 101 / 143 下载 TSV

上一页 101 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003273 Chr06 NC_080392.1:45319789-45319800promoter 内 3523-3534 bp + 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45320267-45321049(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAC
SmilChr07G002095 Chr07 NC_080393.1:19078114-19078125promoter 内 3477-3488 bp + 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 19078638-19080561(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGA
SmilChr03G002352 Chr03 NC_080389.1:37158393-37158404promoter 内 3426-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 37158968-37164609(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCACCTGTCAA
SmilChr08G000305 Chr08 NC_080394.1:2129347-2129358promoter 内 3393-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2128346-2128750(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr06G001650 Chr06 NC_080392.1:18704709-18704720promoter 内 3312-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 18705398-18709013(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr01G002647 Chr01 NC_080387.1:44792558-44792569promoter 内 3139-3150 bp + 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 44793420-44798415(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGTT
SmilChr08G002859 Chr08 NC_080394.1:28430211-28430222promoter 内 2937-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28425021-28429158(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr07G003490 Chr07 NC_080393.1:39486298-39486309promoter 内 2922-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 39487377-39489796(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr07G001979 Chr07 NC_080393.1:17395237-17395248promoter 内 2856-2867 bp - 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 17396382-17401184(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCCA
SmilChr04G000165 Chr04 NC_080390.1:1484066-1484077promoter 内 2839-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1485228-1486956(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr01G005534 Chr01 NC_080387.1:72176848-72176859promoter 内 2811-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 72178038-72180187(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr03G000181 Chr03 NC_080389.1:1945474-1945485promoter 内 2746-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1938732-1944230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr01G002572 Chr01 NC_080387.1:43820284-43820295promoter 内 2736-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43815300-43819030(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr02G003513 Chr02 NC_080388.1:56322791-56322802promoter 内 2727-2738 bp + 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56324065-56326253(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr01G005495 Chr01 NC_080387.1:71857580-71857591promoter 内 2695-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71858886-71862240(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr01G000987 Chr01 NC_080387.1:20873005-20873016promoter 内 2676-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20874330-20876202(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAG
SmilChr05G003096 Chr05 NC_080391.1:39384040-39384051promoter 内 2590-2601 bp - 1400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 39385451-39387158(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr04G001068 Chr04 NC_080390.1:15311529-15311540promoter 内 2543-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15312987-15315580(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr06G002041 Chr06 NC_080392.1:26694245-26694256promoter 内 2531-2542 bp - 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 26695715-26697224(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr05G000034 Chr05 NC_080391.1:158134-158145promoter 内 2363-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 159772-162850(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTG
SmilChr01G002535 Chr01 NC_080387.1:43372726-43372737promoter 内 2345-2356 bp - 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43374382-43379875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAT
SmilChr03G000458 Chr03 NC_080389.1:4883724-4883735promoter 内 2274-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 4885451-4887397(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAC
SmilChr06G001073 Chr06 NC_080392.1:10641149-10641160promoter 内 2273-2284 bp - 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 10642877-10648034(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr06G001264 Chr06 NC_080392.1:13188992-13189003promoter 内 2266-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13190727-13193457(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAA
SmilChr01G000282 Chr01 NC_080387.1:5535045-5535056promoter 内 2213-2224 bp - 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 5531763-5533268(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCT
SmilChr03G003147 Chr03 NC_080389.1:48775923-48775934promoter 内 2175-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 48777749-48779189(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr01G002490 Chr01 NC_080387.1:42621332-42621343promoter 内 2143-2154 bp + 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 42615577-42619485(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAT
SmilChr02G005458 Chr02 NC_080388.1:74895905-74895916promoter 内 2142-2153 bp - 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 74897764-74901278(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr04G000200 Chr04 NC_080390.1:1794041-1794052promoter 内 2116-2127 bp + 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1790354-1792167(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAT
SmilChr02G000473 Chr02 NC_080388.1:6471636-6471647promoter 内 2100-2111 bp + 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6467041-6469746(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr05G001550 Chr05 NC_080391.1:14236469-14236480promoter 内 1891-1902 bp - 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14232927-14234370(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr04G003520 Chr04 NC_080390.1:51580409-51580420promoter 内 1788-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51576554-51578207(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr04G003781 Chr04 NC_080390.1:53988913-53988924promoter 内 1786-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53991128-53993662(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr01G003767 Chr01 NC_080387.1:56035884-56035895promoter 内 1655-1666 bp - 2335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56038230-56041649(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGACG
SmilChr02G002769 Chr02 NC_080388.1:47754512-47754523promoter 内 1627-1638 bp + 2363 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47750368-47752149(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGACG
SmilChr03G000074 Chr03 NC_080389.1:912256-912267promoter 内 1626-1637 bp - 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 914631-920110(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr02G003069 Chr02 NC_080388.1:51552553-51552564promoter 内 1487-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51555067-51558637(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAG
SmilChr08G001063 Chr08 NC_080394.1:8206956-8206967promoter 内 1487-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8209470-8213149(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGAC
SmilChr01G003765 Chr01 NC_080387.1:56035884-56035895promoter 内 1482-1493 bp - 2508 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56029544-56033376(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTCCAGCTGTT
SmilChr02G003348 Chr02 NC_080388.1:54682831-54682842promoter 内 1472-1483 bp - 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54685360-54688297(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAT
SmilChr05G001280 Chr05 NC_080391.1:10956882-10956893promoter 内 1394-1405 bp + 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 10959489-10962672(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
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SmilChr05G000514 Chr05 NC_080391.1:3961870-3961881promoter 内 1362-1373 bp + 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3956303-3959242(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCCC
SmilChr06G001649 Chr06 NC_080392.1:18704709-18704720promoter 内 1343-1354 bp + 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 18699239-18702062(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr08G002554 Chr08 NC_080394.1:24838200-24838211promoter 内 1324-1335 bp + 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24832088-24835534(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr05G000809 Chr05 NC_080391.1:6319798-6319809promoter 内 1232-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6311172-6317040(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr05G000388 Chr05 NC_080391.1:2922088-2922099promoter 内 1049-1060 bp - 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2915053-2919147(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr05G001506 Chr05 NC_080391.1:13804355-13804366promoter 内 1037-1048 bp - 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13807319-13814489(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
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