转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 101 / 149 下载 TSV

上一页 101 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001152 Chr05 NC_080391.1:9673739-9673749promoter 内 945-955 bp - 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9676795-9679167(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr01G002833 Chr01 NC_080387.1:46944224-46944234promoter 内 931-941 bp - 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 46941093-46941164(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G003051 Chr03 NC_080389.1:47414644-47414654promoter 内 888-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 47410249-47411541(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr05G003016 Chr05 NC_080391.1:37548036-37548046promoter 内 872-882 bp + 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37541804-37544917(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTT
SmilChr07G001973 Chr07 NC_080393.1:17300121-17300131promoter 内 872-882 bp - 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 17303250-17303770(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr01G001037 Chr01 NC_080387.1:21568996-21569006promoter 内 851-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21558355-21565856(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr06G000223 Chr06 NC_080392.1:1492272-1492282promoter 内 842-852 bp - 3149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1484076-1489123(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G003116 Chr03 NC_080389.1:48286251-48286261promoter 内 840-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48289412-48291694(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGG
SmilChr05G000705 Chr05 NC_080391.1:5299431-5299441promoter 内 830-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5302602-5307623(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTA
SmilChr06G001849 Chr06 NC_080392.1:21810308-21810318promoter 内 813-823 bp + 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21813496-21814016(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr02G001743 Chr02 NC_080388.1:32025628-32025638promoter 内 804-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32018425-32022441(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr06G001955 Chr06 NC_080392.1:24244398-24244408promoter 内 795-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 24237541-24241202(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr02G000607 Chr02 NC_080388.1:8836264-8836274promoter 内 794-804 bp - 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8839471-8846778(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr02G004451 Chr02 NC_080388.1:66870327-66870337promoter 内 792-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66864139-66867128(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G006049 Chr01 NC_080387.1:76009269-76009279promoter 内 766-776 bp - 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 76005655-76006044(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCT
SmilChr06G001558 Chr06 NC_080392.1:16989988-16989998promoter 内 764-774 bp + 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16984911-16986761(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAC
SmilChr01G003780 Chr01 NC_080387.1:56188879-56188889promoter 内 710-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 56192170-56195736(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TAAAGCTGTCG
SmilChr01G003674 Chr01 NC_080387.1:55178144-55178154promoter 内 695-705 bp - 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55172598-55174848(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr05G000740 Chr05 NC_080391.1:5636101-5636111promoter 内 682-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5639420-5641091(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr04G001344 Chr04 NC_080390.1:21814846-21814856promoter 内 668-678 bp + 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21810830-21811523(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr04G001233 Chr04 NC_080390.1:19345810-19345820promoter 内 650-660 bp - 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19349161-19349845(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr01G006176 Chr01 NC_080387.1:77290839-77290849promoter 内 649-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 77283353-77287497(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr05G000225 Chr05 NC_080391.1:1765138-1765148promoter 内 639-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1758643-1761786(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr07G002322 Chr07 NC_080393.1:21482077-21482087promoter 内 630-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21485448-21487293(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr04G003182 Chr04 NC_080390.1:48528183-48528193promoter 内 621-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48524221-48524813(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr02G002150 Chr02 NC_080388.1:38712167-38712177promoter 内 550-560 bp - 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38705392-38708726(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G003023 Chr01 NC_080387.1:49284663-49284673promoter 内 542-552 bp - 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49276093-49281214(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr01G004164 Chr01 NC_080387.1:60129579-60129589promoter 内 512-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 60133068-60134915(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr01G006051 Chr01 NC_080387.1:76009269-76009279promoter 内 485-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 76012785-76016993(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr06G001848 Chr06 NC_080392.1:21810308-21810318promoter 内 457-467 bp + 3534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21805974-21806774(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr03G001835 Chr03 NC_080389.1:25184495-25184505promoter 内 435-445 bp + 3556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 25179806-25180939(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr01G003045 Chr01 NC_080387.1:49434269-49434279promoter 内 413-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49429575-49430691(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTT
SmilChr04G002306 Chr04 NC_080390.1:37333361-37333371promoter 内 409-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 37336953-37339538(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTA
SmilChr01G001021 Chr01 NC_080387.1:21382230-21382240promoter 内 377-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21385854-21388451(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr02G003288 Chr02 NC_080388.1:54166375-54166385promoter 内 353-363 bp + 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 54154374-54162737(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTT
SmilChr06G002839 Chr06 NC_080392.1:41154866-41154876promoter 内 322-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41158545-41159776(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr01G003277 Chr01 NC_080387.1:51477126-51477136promoter 内 266-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 51472673-51473401(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr06G001674 Chr06 NC_080392.1:18994048-18994058promoter 内 259-269 bp - 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18997790-18998995(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr03G000908 Chr03 NC_080389.1:10402119-10402129promoter 内 242-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 10405878-10409933(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr02G003227 Chr02 NC_080388.1:53530423-53530433promoter 内 240-250 bp + 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53534184-53541115(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr03G004304 Chr03 NC_080389.1:61397280-61397290promoter 内 236-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 61401045-61403557(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr02G001251 Chr02 NC_080388.1:22995214-22995224promoter 内 226-236 bp - 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22989090-22991449(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr06G002302 Chr06 NC_080392.1:33264581-33264591promoter 内 216-226 bp + 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 33268366-33274230(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCC
SmilChr05G001490 Chr05 NC_080391.1:13664046-13664056promoter 内 122-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 13667925-13674438(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr05G000463 Chr05 NC_080391.1:3503753-3503763promoter 内 112-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3507642-3508662(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G003977 Chr01 NC_080387.1:58225375-58225385promoter 内 92-102 bp + 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58229284-58236430(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G003389 Chr03 NC_080389.1:52289190-52289200promoter 内 91-101 bp + 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 52283491-52285290(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr07G002338 Chr07 NC_080393.1:21717095-21717105promoter 内 83-93 bp - 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 21705692-21713187(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G005561 Chr01 NC_080387.1:72421683-72421693promoter 内 81-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72425603-72428599(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G000356 Chr03 NC_080389.1:3997085-3997095promoter 内 75-85 bp - 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3992108-3993169(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA