转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 102 / 142 下载 TSV

上一页 102 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000258 Chr07 NC_080393.1:1661295-1661309promoter 内 435-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1664861-1665588(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr03G000056 Chr03 NC_080389.1:536937-536951promoter 内 406-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 532326-533356(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr08G002289 Chr08 NC_080394.1:21337642-21337656promoter 内 397-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 21341246-21342261(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCGAGGTAGGTAGC
SmilChr06G002359 Chr06 NC_080392.1:34383150-34383164promoter 内 385-399 bp - 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 34386766-34388912(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGCCAGTAGGTGAG
SmilChr08G002422 Chr08 NC_080394.1:23005450-23005464promoter 内 373-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23009078-23016751(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G001456 Chr02 NC_080388.1:27242054-27242068promoter 内 372-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 27237585-27238439(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGCAACTACCACATT
SmilChr05G001970 Chr05 NC_080391.1:20327398-20327412promoter 内 343-357 bp + 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20331056-20333011(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G001594 Chr01 NC_080387.1:30005282-30005296promoter 内 316-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30008967-30010165(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGAGAGTAGGTGGG
SmilChr08G001039 Chr08 NC_080394.1:7914212-7914226promoter 内 311-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7917902-7921344(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGTTAGTAGGTGAA
SmilChr06G003179 Chr06 NC_080392.1:44726337-44726351promoter 内 285-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 44719337-44722635(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGTTACC
SmilChr02G000482 Chr02 NC_080388.1:6614063-6614077promoter 内 281-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6599753-6610357(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTTAGTTAGGTGGA
SmilChr08G004084 Chr08 NC_080394.1:49475138-49475152promoter 内 265-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49468558-49471416(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G004990 Chr02 NC_080388.1:71778512-71778526promoter 内 253-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 71767723-71774778(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGAAGTAGGTGAT
SmilChr02G001288 Chr02 NC_080388.1:23725197-23725211promoter 内 217-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23720890-23721427(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTAATCT
SmilChr05G003312 Chr05 NC_080391.1:43392117-43392131promoter 内 212-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 43386744-43388342(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr01G005844 Chr01 NC_080387.1:74427001-74427015promoter 内 201-215 bp + 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 74421859-74423215(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTGTAGTAGGTGAT
SmilChr08G001327 Chr08 NC_080394.1:10606839-10606853promoter 内 181-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10610659-10612305(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CAGCAGGTAGGTAGC
SmilChr05G003867 Chr05 NC_080391.1:52275649-52275663promoter 内 176-190 bp + 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52270079-52271838(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G003568 Chr03 NC_080389.1:54339331-54339345promoter 内 153-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54334338-54335497(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACTAATCT
SmilChr02G002701 Chr02 NC_080388.1:46842122-46842136promoter 内 144-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 46845979-46850611(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTGTAGTAGGTGAT
SmilChr05G002486 Chr05 NC_080391.1:27526339-27526353promoter 内 114-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 27530226-27535460(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGACCAGTAGGTGTG
SmilChr08G000508 Chr08 NC_080394.1:3706617-3706631promoter 内 91-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3710527-3711457(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr07G001509 Chr07 NC_080393.1:12044582-12044596promoter 内 80-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12038522-12040675(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G002549 Chr03 NC_080389.1:40674770-40674784promoter 内 37-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 40668849-40670820(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G001971 Chr04 NC_080390.1:31931803-31931817promoter 内 31-45 bp - 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31925539-31927847(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCTAAAT
SmilChr08G002739 Chr08 NC_080394.1:27006251-27006265promoter 内 3869-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 27004195-27006133(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCATTCA
SmilChr03G002695 Chr03 NC_080389.1:42938594-42938608promoter 内 3637-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 42936360-42938244(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTACG
SmilChr08G003943 Chr08 NC_080394.1:47179592-47179606promoter 内 3048-3062 bp - 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 47175800-47178653(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACTATCCA
SmilChr05G002400 Chr05 NC_080391.1:26488867-26488881promoter 内 765-779 bp - 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 26492103-26496935(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGGAGGG
SmilChr01G003542 Chr01 NC_080387.1:54007964-54007978promoter 内 3977-3991 bp - 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54005005-54007954(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACTTCTCT
SmilChr01G003543 Chr01 NC_080387.1:54017350-54017364promoter 内 3977-3991 bp - 10 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54014397-54017340(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACTTCTCT
SmilChr08G004910 Chr08 NC_080394.1:58076666-58076680promoter 内 3976-3990 bp + 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58076691-58079589(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACTTCTCT
SmilChr08G004911 Chr08 NC_080394.1:58086055-58086069promoter 内 3976-3990 bp + 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 58086080-58089015(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACTTCTCT
SmilChr06G000988 Chr06 NC_080392.1:9678123-9678137promoter 内 3912-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9676576-9678048(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCCATGG
SmilChr02G005173 Chr02 NC_080388.1:73035893-73035907promoter 内 3888-3902 bp + 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 73031943-73035794(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTAATAGTAGGTGGG
SmilChr05G002782 Chr05 NC_080391.1:32532326-32532340promoter 内 3870-3884 bp - 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 32523170-32532209(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTACCTACCAACTT
SmilChr05G000829 Chr05 NC_080391.1:6502774-6502788promoter 内 3806-3820 bp + 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6496019-6502593(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAATTAGTAGGTGGG
SmilChr02G000207 Chr02 NC_080388.1:2733312-2733326promoter 内 3767-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2733546-2736218(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTAAAGTAGGTGGG
SmilChr06G000144 Chr06 NC_080392.1:1010766-1010780promoter 内 3727-3741 bp - 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1008096-1010506(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTACCTACCGTTGA
SmilChr08G002097 Chr08 NC_080394.1:18848686-18848700promoter 内 3581-3595 bp - 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18848207-18848280(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTAACGATAA
SmilChr05G002175 Chr05 NC_080391.1:23184306-23184320promoter 内 3573-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23184734-23187820(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTACCTACCGAATA
SmilChr08G002112 Chr08 NC_080394.1:18965635-18965649promoter 内 3490-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18963423-18965138(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTTACCTACCATATT
SmilChr07G003134 Chr07 NC_080393.1:33263448-33263462promoter 内 3386-3400 bp - 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33261810-33262847(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTACCTACCTAAAT
SmilChr07G003137 Chr07 NC_080393.1:33268961-33268975promoter 内 3384-3398 bp - 603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33267321-33268358(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTACCTACCTAAAT
SmilChr05G001344 Chr05 NC_080391.1:11873090-11873104promoter 内 3367-3381 bp - 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 11873724-11877614(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GACGGAGTAGGTGAG
SmilChr01G000841 Chr01 NC_080387.1:18272605-18272619promoter 内 3092-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18267989-18271710(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGATAGTAGGTGAA
SmilChr04G002494 Chr04 NC_080390.1:39837558-39837572promoter 内 3052-3066 bp - 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 39835092-39836623(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCAGATG
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55305845-55305859promoter 内 3049-3063 bp - 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55292135-55304907(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCCCCTACCACCGC
SmilChr07G003138 Chr07 NC_080393.1:33268961-33268975promoter 内 3021-3035 bp - 966 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33269941-33271474(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTACG
SmilChr07G003135 Chr07 NC_080393.1:33263448-33263462promoter 内 3020-3034 bp - 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 33264429-33266002(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATTTAGGTAGGTACG