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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 103 / 134 下载 TSV

上一页 103 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003690 Chr07 NC_080393.1:44427196-44427210promoter 内 1379-1393 bp - 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 44429818-44429923(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACGTGTCGGCACCAA
SmilChr03G003938 Chr03 NC_080389.1:58462346-58462360promoter 内 1378-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 58464969-58467897(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTGAACCGACATTG
SmilChr01G000138 Chr01 NC_080387.1:2328740-2328754promoter 内 1273-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2331468-2335218(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTTTTGCCGACAATC
SmilChr05G002201 Chr05 NC_080391.1:23467554-23467568promoter 内 1177-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 23461395-23464744(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCAGGCCGACAAGG
SmilChr06G002744 Chr06 NC_080392.1:39848557-39848571promoter 内 1127-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39842685-39845697(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCCCTGCCGACTCCA
SmilChr04G003289 Chr04 NC_080390.1:49577002-49577016promoter 内 1104-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49571951-49574119(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAGCGCCGACAAGA
SmilChr01G005122 Chr01 NC_080387.1:69023086-69023100promoter 内 1047-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 69026040-69028747(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAGGTGCCGACACCT
SmilChr07G000071 Chr07 NC_080393.1:336854-336868promoter 内 1025-1039 bp - 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 331912-333892(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TATCTGCCGACAAGT
SmilChr08G004084 Chr08 NC_080394.1:49474379-49474393promoter 内 1024-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49468558-49471416(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCTTGTCGGCACATG
SmilChr08G004090 Chr08 NC_080394.1:49601835-49601849promoter 内 997-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49579959-49598845(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGTAGCCGACAAAG
SmilChr07G001089 Chr07 NC_080393.1:8013872-8013886promoter 内 943-957 bp + 3044 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 8016930-8022919(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGCCTGCCGACGCCC
SmilChr06G002513 Chr06 NC_080392.1:36025875-36025889promoter 内 942-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 36018022-36022830(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTTAAGCCGACATCT
SmilChr01G004022 Chr01 NC_080387.1:58629050-58629064promoter 内 847-861 bp + 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 58632204-58636130(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CATGTGCCGACTTCA
SmilChr08G003741 Chr08 NC_080394.1:42364407-42364421promoter 内 846-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 42367562-42370656(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCTGTTA
SmilChr05G000139 Chr05 NC_080391.1:1126901-1126915promoter 内 795-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1115565-1123709(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGAGTCGGCAATGG
SmilChr01G003694 Chr01 NC_080387.1:55306094-55306108promoter 内 774-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55300022-55302881(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTCTTGCCGACTTCT
SmilChr01G000766 Chr01 NC_080387.1:16794230-16794244promoter 内 728-742 bp - 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16797503-16798633(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGTATGCA
SmilChr03G001584 Chr03 NC_080389.1:20039662-20039676promoter 内 713-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20042950-20045827(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCAGTGCCGACGCCG
SmilChr07G003899 Chr07 NC_080393.1:49033220-49033234promoter 内 635-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49036586-49042506(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCCTGCA
SmilChr02G005286 Chr02 NC_080388.1:73883625-73883639promoter 内 575-589 bp + 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 73887051-73890068(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TACACGCCGACAAGA
SmilChr05G003798 Chr05 NC_080391.1:51304567-51304581promoter 内 563-577 bp + 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51298542-51301143(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGCGTCGGCAATGA
SmilChr05G003806 Chr05 NC_080391.1:51370257-51370271promoter 内 560-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51364232-51366830(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGCGTCGGCAATGA
SmilChr02G004888 Chr02 NC_080388.1:70941193-70941207promoter 内 532-546 bp - 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 70944662-70944734(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAAAGTCGGCAGAGC
SmilChr02G003442 Chr02 NC_080388.1:55703081-55703095promoter 内 499-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55696078-55699593(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCAGGCCGACAAGG
SmilChr02G004706 Chr02 NC_080388.1:69356788-69356802promoter 内 341-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 69351219-69353142(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCTTGTCGGCACATG
SmilChr07G001996 Chr07 NC_080393.1:17659403-17659417promoter 内 311-325 bp - 3676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17663093-17666671(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCTTGTCGGCACATG
SmilChr08G002895 Chr08 NC_080394.1:28835764-28835778promoter 内 307-321 bp - 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 28839458-28849566(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGTTGTCGGCGCGTT
SmilChr02G003150 Chr02 NC_080388.1:52528061-52528075promoter 内 295-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52531767-52533896(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAAGTCGGCAATCC
SmilChr06G003089 Chr06 NC_080392.1:43738294-43738308promoter 内 279-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43742016-43747651(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAGCGCCGACAAGA
SmilChr06G001601 Chr06 NC_080392.1:17794207-17794221promoter 内 251-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 17797957-17800112(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAAGTCGGCACTGC
SmilChr01G001631 Chr01 NC_080387.1:30374353-30374367promoter 内 186-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 30369106-30370552(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAATGTCGGCCTTTG
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SmilChr08G000053 Chr08 NC_080394.1:315410-315424promoter 内 68-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 319343-326729(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGGTGTCGGCACACA
SmilChr02G003331 Chr02 NC_080388.1:54558313-54558327promoter 内 3535-3549 bp + 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 54556216-54557861(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATGTGTCGGCCAAAT
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SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72842538-72842552promoter 内 3912-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 72840117-72842463(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACGCAGCCGACAAAA
SmilChr04G001549 Chr04 NC_080390.1:25586483-25586497promoter 内 3867-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 25585530-25586363(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GAACGTCGGCACGAG
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SmilChr01G004147 Chr01 NC_080387.1:59993951-59993965promoter 内 3767-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 59990548-59993731(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTCTGCCGACGCCC