转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 104 / 149 下载 TSV

上一页 104 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002170 Chr07 NC_080393.1:19876980-19876990promoter 内 790-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19870751-19873779(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr02G000274 Chr02 NC_080388.1:3527896-3527906promoter 内 721-731 bp + 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3518093-3524626(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr01G002295 Chr01 NC_080387.1:39775391-39775401promoter 内 678-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 39778714-39782298(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr03G000703 Chr03 NC_080389.1:7849699-7849709promoter 内 676-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 7841878-7846384(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr05G001311 Chr05 NC_080391.1:11298621-11298631promoter 内 667-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11301955-11304810(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr03G003625 Chr03 NC_080389.1:54919035-54919045promoter 内 600-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54922436-54923545(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr05G002916 Chr05 NC_080391.1:35127578-35127588promoter 内 582-592 bp - 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35121746-35124169(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr03G001318 Chr03 NC_080389.1:15457093-15457103promoter 内 489-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15452950-15453591(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G002293 Chr01 NC_080387.1:39775391-39775401promoter 内 429-439 bp + 3562 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 39762061-39771829(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr04G000234 Chr04 NC_080390.1:2083560-2083570promoter 内 323-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2074561-2079892(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTC
SmilChr01G003231 Chr01 NC_080387.1:51077509-51077519promoter 内 305-315 bp - 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51081205-51081873(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAA
SmilChr04G003740 Chr04 NC_080390.1:53719336-53719346promoter 内 285-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53712512-53715630(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr02G000986 Chr02 NC_080388.1:17340176-17340186promoter 内 119-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 17344058-17346016(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAG
SmilChr07G000353 Chr07 NC_080393.1:2423084-2423094promoter 内 58-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 2418256-2419151(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCT
SmilChr05G002695 Chr05 NC_080391.1:30785072-30785082promoter 内 48-58 bp - 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30789025-30790187(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTA
SmilChr01G002073 Chr01 NC_080387.1:36637588-36637598promoter 内 45-55 bp - 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36630279-36633642(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAA
SmilChr01G000745 Chr01 NC_080387.1:16468367-16468377promoter 内 14-24 bp + 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16472354-16473132(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGGGCTGTCA
SmilChr02G000275 Chr02 NC_080388.1:3527896-3527906promoter 内 1-11 bp + 3990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3519795-3523906(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTG
SmilChr06G002907 Chr06 NC_080392.1:41868308-41868318promoter 内 2150-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 41870159-41872040(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr01G000485 Chr01 NC_080387.1:9924163-9924173promoter 内 3249-3259 bp + 742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 9924915-9928587(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr06G001627 Chr06 NC_080392.1:18194406-18194416promoter 内 1366-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 18197041-18204258(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr03G002436 Chr03 NC_080389.1:38686062-38686072promoter 内 3824-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 38684669-38685895(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr04G000148 Chr04 NC_080390.1:1297007-1297017promoter 内 3756-3766 bp + 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 1297252-1299763(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr02G003160 Chr02 NC_080388.1:52650361-52650371promoter 内 3549-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 52650813-52654043(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr03G001196 Chr03 NC_080389.1:13781477-13781487promoter 内 3420-3430 bp + 571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 13777504-13780906(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr07G001690 Chr07 NC_080393.1:14315889-14315899promoter 内 2752-2762 bp + 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14317138-14319754(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr05G000475 Chr05 NC_080391.1:3653754-3653764promoter 内 2694-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 3650708-3652457(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr02G000955 Chr02 NC_080388.1:16593882-16593892promoter 内 2490-2500 bp + 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16595393-16597882(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr05G004310 Chr05 NC_080391.1:56788393-56788403promoter 内 2467-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56789927-56791321(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr02G001273 Chr02 NC_080388.1:23300535-23300545promoter 内 2079-2089 bp - 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 23295339-23298623(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr07G002512 Chr07 NC_080393.1:23809313-23809323promoter 内 1400-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 23811914-23811985(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTT
SmilChr07G002051 Chr07 NC_080393.1:18620110-18620120promoter 内 916-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 18623195-18627578(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr07G002510 Chr07 NC_080393.1:23809313-23809323promoter 内 504-514 bp - 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 23801937-23805826(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr01G001417 Chr01 NC_080387.1:27759550-27759560promoter 内 484-494 bp + 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 27755515-27756043(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr05G002209 Chr05 NC_080391.1:23554866-23554876promoter 内 3979-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23554888-23560180(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr05G000633 Chr05 NC_080391.1:4771960-4771970promoter 内 3960-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4772001-4773993(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr04G000676 Chr04 NC_080390.1:7727952-7727962promoter 内 3929-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7728024-7730147(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr06G001521 Chr06 NC_080392.1:16389962-16389972promoter 内 3922-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 16389787-16389893(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr06G000968 Chr06 NC_080392.1:9404988-9404998promoter 内 3880-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9405109-9419673(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr05G002792 Chr05 NC_080391.1:32647332-32647342promoter 内 3866-3876 bp + 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 32646212-32647207(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr02G003833 Chr02 NC_080388.1:59976091-59976101promoter 内 3728-3738 bp + 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59974151-59975828(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr02G003689 Chr02 NC_080388.1:58283448-58283458promoter 内 3680-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58283769-58293795(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr02G003026 Chr02 NC_080388.1:50929341-50929351promoter 内 3582-3592 bp + 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50925664-50928932(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr06G000906 Chr06 NC_080392.1:8538769-8538779promoter 内 3573-3583 bp - 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8537858-8538351(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr06G002787 Chr06 NC_080392.1:40553027-40553037promoter 内 3556-3566 bp - 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40547991-40552592(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr03G000796 Chr03 NC_080389.1:9105688-9105698promoter 内 3533-3543 bp + 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9106156-9111638(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr03G000214 Chr03 NC_080389.1:2500721-2500731promoter 内 3296-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2496980-2500026(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr05G002972 Chr05 NC_080391.1:36156097-36156107promoter 内 3282-3292 bp - 709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36156816-36160134(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr02G003396 Chr02 NC_080388.1:55084345-55084355promoter 内 3173-3183 bp - 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55085173-55089489(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr07G002967 Chr07 NC_080393.1:30166723-30166733promoter 内 3145-3155 bp - 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 30167579-30170008(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTT