转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 106 / 143 下载 TSV

上一页 106 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004745 Chr02 NC_080388.1:69660039-69660050promoter 内 981-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 69663059-69666520(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr02G000461 Chr02 NC_080388.1:6199531-6199542promoter 内 975-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6202557-6203829(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr06G001626 Chr06 NC_080392.1:18116779-18116790promoter 内 973-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18119807-18123232(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr01G002603 Chr01 NC_080387.1:44235879-44235890promoter 内 972-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44231924-44232861(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCGT
SmilChr03G001011 Chr03 NC_080389.1:11624870-11624881promoter 内 936-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11618468-11621816(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr03G000329 Chr03 NC_080389.1:3746686-3746697promoter 内 931-942 bp - 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3742962-3743627(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAA
SmilChr04G002607 Chr04 NC_080390.1:41464795-41464806promoter 内 926-937 bp + 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41467870-41471207(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr01G002879 Chr01 NC_080387.1:47399262-47399273promoter 内 924-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47394962-47396196(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGC
SmilChr08G003356 Chr08 NC_080394.1:34970771-34970782promoter 内 903-914 bp - 3087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34964453-34967684(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr01G000709 Chr01 NC_080387.1:15854062-15854073promoter 内 892-903 bp + 3098 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15857171-15857893(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr03G003424 Chr03 NC_080389.1:52574755-52574766promoter 内 891-902 bp - 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52560603-52571656(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr06G001152 Chr06 NC_080392.1:11659024-11659035promoter 内 794-805 bp + 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11662231-11664586(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTACCAGCTGTG
SmilChr08G002154 Chr08 NC_080394.1:19428127-19428138promoter 内 785-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19431343-19433245(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAG
SmilChr03G002232 Chr03 NC_080389.1:35222312-35222323promoter 内 737-748 bp + 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35216607-35219059(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCTC
SmilChr03G001966 Chr03 NC_080389.1:28242686-28242697promoter 内 671-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 28246016-28249148(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr05G000950 Chr05 NC_080391.1:7673315-7673326promoter 内 645-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7676671-7677216(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr04G001539 Chr04 NC_080390.1:25352709-25352720promoter 内 506-517 bp + 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 25346518-25349225(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTATG
SmilChr08G003624 Chr08 NC_080394.1:39447102-39447113promoter 内 449-460 bp + 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 39450654-39453589(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr08G002296 Chr08 NC_080394.1:21465660-21465671promoter 内 379-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 21459883-21462049(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr02G000679 Chr02 NC_080388.1:10630950-10630961promoter 内 353-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10634598-10635767(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAACTGTCAA
SmilChr07G001826 Chr07 NC_080393.1:15758557-15758568promoter 内 282-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15748621-15754849(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCGT
SmilChr01G001139 Chr01 NC_080387.1:23184603-23184614promoter 内 252-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23188352-23191802(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr06G002432 Chr06 NC_080392.1:35086480-35086491promoter 内 240-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35081542-35082730(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGC
SmilChr04G000225 Chr04 NC_080390.1:1998782-1998793promoter 内 149-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2002634-2014761(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAA
SmilChr06G001520 Chr06 NC_080392.1:16387410-16387421promoter 内 129-140 bp - 3861 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16380360-16383549(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTG
SmilChr07G003089 Chr07 NC_080393.1:32625724-32625735promoter 内 24-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32615688-32621758(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAG
SmilChr01G005362 Chr01 NC_080387.1:70861645-70861656promoter 内 3614-3625 bp - 376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 70858342-70861269(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr01G002180 Chr01 NC_080387.1:37909006-37909017promoter 内 2673-2684 bp + 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 37910334-37911358(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTT
SmilChr02G004738 Chr02 NC_080388.1:69591942-69591953promoter 内 2536-2547 bp - 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 69587773-69590488(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr06G001382 Chr06 NC_080392.1:14471846-14471857promoter 内 2530-2541 bp - 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 14469235-14470386(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGTT
SmilChr01G003536 Chr01 NC_080387.1:53982596-53982607promoter 内 2484-2495 bp + 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 53984113-53988903(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGTT
SmilChr04G004001 Chr04 NC_080390.1:55359827-55359838promoter 内 2034-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 55361794-55365671(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTT
SmilChr04G003999 Chr04 NC_080390.1:55359827-55359838promoter 内 1769-1780 bp + 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 55356537-55357606(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGC
SmilChr02G002878 Chr02 NC_080388.1:49043247-49043258promoter 内 1507-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 49045741-49047734(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTT
SmilChr06G001768 Chr06 NC_080392.1:20652882-20652893promoter 内 1106-1117 bp - 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 20645950-20649998(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTATT
SmilChr01G001039 Chr01 NC_080387.1:21640170-21640181promoter 内 1055-1066 bp - 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 21635892-21637235(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGTT
SmilChr04G000189 Chr04 NC_080390.1:1689301-1689312promoter 内 944-955 bp + 3046 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 1677559-1686255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATG
SmilChr02G002982 Chr02 NC_080388.1:50382499-50382510promoter 内 529-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 50377939-50379038(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTT
SmilChr03G002920 Chr03 NC_080389.1:45945505-45945516promoter 内 471-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 45949035-45951510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCACCAGCTGTT
SmilChr08G003260 Chr08 NC_080394.1:33588905-33588916promoter 内 2-13 bp - 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 33582202-33584917(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTACCAGCTGTT
SmilChr08G003033 Chr08 NC_080394.1:30494640-30494651promoter 内 3935-3946 bp + 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30486463-30494585(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAACTGTCAA
SmilChr01G005363 Chr01 NC_080387.1:70861645-70861656promoter 内 3910-3921 bp - 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70861736-70865267(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAACTGTCAA
SmilChr08G002234 Chr08 NC_080394.1:20463232-20463243promoter 内 3693-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 20462150-20462935(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAA
SmilChr01G003169 Chr01 NC_080387.1:50478136-50478147promoter 内 3691-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50478446-50479200(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAA
SmilChr03G003702 Chr03 NC_080389.1:55968129-55968140promoter 内 3638-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55968492-55972000(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTATT
SmilChr07G000920 Chr07 NC_080393.1:6564507-6564518promoter 内 3611-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6563116-6564128(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr06G001297 Chr06 NC_080392.1:13521970-13521981promoter 内 3601-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 13504616-13521581(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAA
SmilChr05G001327 Chr05 NC_080391.1:11495609-11495620promoter 内 3599-3610 bp - 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 11494396-11495218(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAT
SmilChr05G002758 Chr05 NC_080391.1:31918679-31918690promoter 内 3514-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31919166-31927142(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATA
SmilChr02G004426 Chr02 NC_080388.1:66593705-66593716promoter 内 3401-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66590778-66593116(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGCAAGCTGTA