转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 108 / 143 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002966 Chr03 NC_080389.1:46411339-46411350promoter 内 1134-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 46399994-46408483(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTG
SmilChr08G000068 Chr08 NC_080394.1:389781-389792promoter 内 3989-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 389793-394717(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGAA
SmilChr07G000622 Chr07 NC_080393.1:4209142-4209153promoter 内 3710-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4209433-4209628(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTC
SmilChr07G001408 Chr07 NC_080393.1:10963685-10963696promoter 内 3479-3490 bp - 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10954274-10963174(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTG
SmilChr06G001864 Chr06 NC_080392.1:22062841-22062852promoter 内 3402-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22063440-22065926(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr05G001839 Chr05 NC_080391.1:18417638-18417649promoter 内 3344-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18418295-18419363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGC
SmilChr06G001869 Chr06 NC_080392.1:22096859-22096870promoter 内 3326-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22097534-22098529(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr03G002805 Chr03 NC_080389.1:44517529-44517540promoter 内 3287-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44518243-44519190(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTG
SmilChr03G000385 Chr03 NC_080389.1:4282182-4282193promoter 内 3283-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4282900-4291525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGC
SmilChr07G001409 Chr07 NC_080393.1:10963685-10963696promoter 内 3276-3287 bp - 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10959849-10962971(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTG
SmilChr01G001312 Chr01 NC_080387.1:26099634-26099645promoter 内 3099-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 26100536-26102539(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAA
SmilChr08G003365 Chr08 NC_080394.1:35215538-35215549promoter 内 3081-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35216458-35219685(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGAA
SmilChr02G001528 Chr02 NC_080388.1:28475996-28476007promoter 内 3077-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28476920-28477391(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGAA
SmilChr05G001900 Chr05 NC_080391.1:19276650-19276661promoter 内 3075-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19277576-19287440(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCGG
SmilChr08G000123 Chr08 NC_080394.1:779470-779481promoter 内 3048-3059 bp - 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 774580-778528(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGAA
SmilChr07G000591 Chr07 NC_080393.1:4032646-4032657promoter 内 2957-2968 bp - 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4029489-4031613(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGCA
SmilChr06G000640 Chr06 NC_080392.1:5656126-5656137promoter 内 2948-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5657179-5660413(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr05G001930 Chr05 NC_080391.1:19639868-19639879promoter 内 2931-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19635051-19638809(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAA
SmilChr03G002172 Chr03 NC_080389.1:33775902-33775913promoter 内 2886-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 33777017-33780060(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAA
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9015128-9015139promoter 内 2864-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTC
SmilChr01G000694 Chr01 NC_080387.1:15570180-15570191promoter 内 2845-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15568054-15569035(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCAAGCTGTA
SmilChr05G001316 Chr05 NC_080391.1:11324977-11324988promoter 内 2816-2827 bp + 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11323731-11323803(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTATC
SmilChr02G003715 Chr02 NC_080388.1:58756078-58756089promoter 内 2785-2796 bp - 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58752554-58754873(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCA
SmilChr02G000446 Chr02 NC_080388.1:5843492-5843503promoter 内 2726-2737 bp - 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5841578-5842228(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGCA
SmilChr02G000934 Chr02 NC_080388.1:16266015-16266026promoter 内 2533-2544 bp - 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16267483-16270555(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGC
SmilChr03G000791 Chr03 NC_080389.1:9015128-9015139promoter 内 2523-2534 bp - 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9008587-9013661(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAG
SmilChr08G001822 Chr08 NC_080394.1:15565317-15565328promoter 内 2444-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15566874-15569528(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCACCAGCTGTG
SmilChr06G000869 Chr06 NC_080392.1:8231870-8231881promoter 内 2428-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8230236-8230308(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGG
SmilChr03G002487 Chr03 NC_080389.1:39546504-39546515promoter 内 2381-2392 bp - 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 39548124-39549504(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGC
SmilChr05G000092 Chr05 NC_080391.1:524020-524031promoter 内 2086-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 521443-522116(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAT
SmilChr04G004180 Chr04 NC_080390.1:56387072-56387083promoter 内 1990-2001 bp - 2000 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56383202-56385072(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTAGT
SmilChr06G003253 Chr06 NC_080392.1:45202186-45202197promoter 内 1967-1978 bp - 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45194662-45200163(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAG
SmilChr08G002696 Chr08 NC_080394.1:26555955-26555966promoter 内 1956-1967 bp + 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 26551670-26553921(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr04G003063 Chr04 NC_080390.1:47186558-47186569promoter 内 1947-1958 bp - 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47182047-47184515(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAG
SmilChr03G002803 Chr03 NC_080389.1:44517529-44517540promoter 内 1930-1941 bp - 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44513519-44515469(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAA
SmilChr02G001525 Chr02 NC_080388.1:28379017-28379028promoter 内 1926-1937 bp - 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28381092-28381587(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGC
SmilChr03G000497 Chr03 NC_080389.1:5314550-5314561promoter 内 1922-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5316629-5320251(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAG
SmilChr08G002624 Chr08 NC_080394.1:25612129-25612140promoter 内 1910-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25614220-25617207(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAA
SmilChr07G003203 Chr07 NC_080393.1:34229215-34229226promoter 内 1905-1916 bp - 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34225399-34227130(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGAA
SmilChr07G000531 Chr07 NC_080393.1:3685658-3685669promoter 内 1849-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3687810-3689693(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTATT
SmilChr01G004261 Chr01 NC_080387.1:60876534-60876545promoter 内 1778-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 60878757-60879745(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCACCTGTCAA
SmilChr05G002131 Chr05 NC_080391.1:22409220-22409231promoter 内 1778-1789 bp - 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22411443-22414041(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTG
SmilChr06G000871 Chr06 NC_080392.1:8231870-8231881promoter 内 1732-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8234139-8237204(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAT
SmilChr03G000496 Chr03 NC_080389.1:5314550-5314561promoter 内 1730-1741 bp + 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5308165-5312290(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTC
SmilChr04G001637 Chr04 NC_080390.1:27177334-27177345promoter 内 1654-1665 bp - 2336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27174147-27174998(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCA
SmilChr08G003364 Chr08 NC_080394.1:35208394-35208405promoter 内 1626-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35205072-35206030(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCACCTGTCAA
SmilChr05G004288 Chr05 NC_080391.1:56659929-56659940promoter 内 1610-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56662320-56668544(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCAAGCTGTA
SmilChr01G003608 Chr01 NC_080387.1:54639847-54639858promoter 内 1501-1512 bp - 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54633004-54637358(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGC
SmilChr02G000613 Chr02 NC_080388.1:8948269-8948280promoter 内 1478-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8944679-8945757(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTATG
SmilChr01G002723 Chr01 NC_080387.1:45573698-45573709promoter 内 1473-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45576226-45578866(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCACCTGTCAA