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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G004136; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000866-RA_Salv SmilChr04G004136 MYB XP_057806072.1 MP00627 TTACCTACCG

可能结合的靶基因

9835 个结合位点 8075 个候选靶基因 第 108 / 162 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000475 Chr02 NC_080388.1:6517381-6517390promoter 内 25-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 3 6509284-6513414(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G003056 Chr03 NC_080389.1:47454837-47454846promoter 内 3871-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 47454967-47455613(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr02G001569 Chr02 NC_080388.1:29104773-29104782promoter 内 3727-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 29100652-29104508(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr02G005426 Chr02 NC_080388.1:74722495-74722504promoter 内 3350-3359 bp - 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 74721224-74721853(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G000616 Chr03 NC_080389.1:6812529-6812538promoter 内 2559-2568 bp + 1433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 6809784-6811096(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr02G004865 Chr02 NC_080388.1:70762198-70762207promoter 内 2384-2393 bp - 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 70763815-70766556(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr07G000831 Chr07 NC_080393.1:5901922-5901931promoter 内 665-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 5896102-5898595(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr02G001647 Chr02 NC_080388.1:30573077-30573086promoter 内 477-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 30568957-30569562(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr05G002762 Chr05 NC_080391.1:31960829-31960838promoter 内 258-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 31964572-31966382(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr01G000697 Chr01 NC_080387.1:15672067-15672076promoter 内 3973-3982 bp + 19 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15672095-15672531(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr06G000368 Chr06 NC_080392.1:2849329-2849338promoter 内 3913-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2846631-2849250(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G001490 Chr03 NC_080389.1:17955729-17955738promoter 内 3888-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17955842-17956975(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr04G000745 Chr04 NC_080390.1:9140902-9140911promoter 内 3886-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9135609-9140796(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G002035 Chr03 NC_080389.1:30713136-30713145promoter 内 3850-3859 bp - 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30713287-30715139(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr06G000369 Chr06 NC_080392.1:2849329-2849338promoter 内 3766-3775 bp - 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2849564-2851024(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr02G004771 Chr02 NC_080388.1:69888395-69888404promoter 内 3729-3738 bp - 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 69880677-69888132(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr07G002359 Chr07 NC_080393.1:21918997-21919006promoter 内 3726-3735 bp + 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21919272-21921321(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr05G004154 Chr05 NC_080391.1:55464359-55464368promoter 内 3680-3689 bp - 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55462250-55464047(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G002029 Chr03 NC_080389.1:30425936-30425945promoter 内 3676-3685 bp + 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30424361-30425620(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
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SmilChr07G002541 Chr07 NC_080393.1:24113237-24113246promoter 内 3665-3674 bp + 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24109220-24112910(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr05G002515 Chr05 NC_080391.1:27915305-27915314promoter 内 3602-3611 bp + 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27915704-27918856(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
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SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64166048-64166057promoter 内 3490-3499 bp + 502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64166559-64168856(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G000537 Chr03 NC_080389.1:5835557-5835566promoter 内 3466-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5836092-5836901(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G000522 Chr03 NC_080389.1:5610441-5610450promoter 内 3452-3461 bp + 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5610990-5611799(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
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SmilChr03G001489 Chr03 NC_080389.1:17955729-17955738promoter 内 3361-3370 bp - 631 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17953517-17955098(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr05G000966 Chr05 NC_080391.1:7802517-7802526promoter 内 3356-3365 bp + 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7803162-7805218(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr05G003755 Chr05 NC_080391.1:50720571-50720580promoter 内 3356-3365 bp - 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50721216-50722174(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr05G000902 Chr05 NC_080391.1:7147687-7147696promoter 内 3325-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7148363-7150360(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G003612 Chr03 NC_080389.1:54780109-54780118promoter 内 3226-3235 bp - 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54777917-54779343(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr06G002427 Chr06 NC_080392.1:35030757-35030766promoter 内 3144-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35031614-35033056(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr01G004232 Chr01 NC_080387.1:60692432-60692441promoter 内 3068-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 60693365-60694407(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr01G005119 Chr01 NC_080387.1:68988044-68988053promoter 内 2933-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68989112-68990596(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr05G003026 Chr05 NC_080391.1:37880787-37880796promoter 内 2931-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37881857-37885266(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr01G005100 Chr01 NC_080387.1:68811304-68811313promoter 内 2908-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68808004-68810220(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr03G000345 Chr03 NC_080389.1:3895745-3895754promoter 内 2907-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3896839-3897761(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr07G003181 Chr07 NC_080393.1:33892985-33892994promoter 内 2898-2907 bp - 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 33884572-33891891(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
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SmilChr07G001352 Chr07 NC_080393.1:10472091-10472100promoter 内 2822-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10473270-10476355(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
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SmilChr05G003369 Chr05 NC_080391.1:44569656-44569665promoter 内 2687-2696 bp + 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44564739-44568351(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr04G000740 Chr04 NC_080390.1:9000885-9000894promoter 内 2658-2667 bp - 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9002228-9002334(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AGGTAGGTTT
SmilChr07G003617 Chr07 NC_080393.1:42542458-42542467promoter 内 2650-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42543809-42544160(+) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
SmilChr03G001062 Chr03 NC_080389.1:12333363-12333372promoter 内 2649-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12331670-12332020(-) SMil_00000866-RA_Salv MP00627 AAACCTACCT
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