转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 11 / 139 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004855 Chr02 NC_080388.1:70707947-70707958promoter 内 2285-2296 bp - 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 70702516-70706242(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCCGACGTGGG
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27633600-27633611promoter 内 646-657 bp + 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 27621750-27630256(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr01G002102 Chr01 NC_080387.1:37058115-37058126promoter 内 3832-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 37055186-37057957(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr01G006062 Chr01 NC_080387.1:76052769-76052780promoter 内 3452-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 76053318-76053403(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGA
SmilChr02G004899 Chr02 NC_080388.1:71004850-71004861promoter 内 3190-3201 bp + 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 71005661-71008497(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGT
SmilChr02G003062 Chr02 NC_080388.1:51456610-51456621promoter 内 2907-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 51457704-51459502(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr01G006063 Chr01 NC_080387.1:76052769-76052780promoter 内 2764-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 76054006-76058197(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGA
SmilChr02G003124 Chr02 NC_080388.1:52244074-52244085promoter 内 2608-2619 bp + 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 52241325-52242692(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr01G004202 Chr01 NC_080387.1:60486220-60486231promoter 内 2204-2215 bp - 1786 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 60483973-60484434(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGT
SmilChr01G000424 Chr01 NC_080387.1:8506298-8506309promoter 内 1797-1808 bp + 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 8508502-8511369(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCCGACGTGGG
SmilChr03G004682 Chr03 NC_080389.1:64236029-64236040promoter 内 1199-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 64238831-64239774(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr01G002103 Chr01 NC_080387.1:37058115-37058126promoter 内 692-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 37061424-37062479(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGA
SmilChr04G000632 Chr04 NC_080390.1:7201359-7201370promoter 内 541-552 bp + 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 7195472-7197910(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGGGC
SmilChr01G005889 Chr01 NC_080387.1:74818034-74818045promoter 内 534-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 74811662-74814578(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr03G001793 Chr03 NC_080389.1:24490381-24490392promoter 内 211-222 bp + 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 24485892-24486602(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGCT
SmilChr02G000812 Chr02 NC_080388.1:13605298-13605309promoter 内 19-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 13609280-13609351(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGGA
SmilChr03G002837 Chr03 NC_080389.1:44912306-44912317promoter 内 3936-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 9 44912371-44919831(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGCA
SmilChr01G002480 Chr01 NC_080387.1:42536297-42536308promoter 内 3025-3036 bp - 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 6 42534282-42535332(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G002668 Chr02 NC_080388.1:46183846-46183857promoter 内 922-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 6 46186925-46187875(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G000124 Chr02 NC_080388.1:1693332-1693343promoter 内 1995-2006 bp + 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 1695338-1700632(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr03G000475 Chr03 NC_080389.1:5052527-5052538promoter 内 1581-1592 bp - 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 5 5046979-5050118(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G004853 Chr02 NC_080388.1:70681300-70681311promoter 内 3775-3786 bp + 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 70681526-70683890(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G003099 Chr02 NC_080388.1:51887945-51887956promoter 内 2707-2718 bp + 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 51889239-51889311(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G004852 Chr02 NC_080388.1:70681300-70681311promoter 内 2404-2415 bp + 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 70678035-70679714(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGCA
SmilChr01G000136 Chr01 NC_080387.1:2294478-2294489promoter 内 3535-3546 bp - 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 2288363-2294023(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr03G001960 Chr03 NC_080389.1:28085217-28085228promoter 内 2529-2540 bp + 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 28086689-28096713(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10212019-10212030promoter 内 2120-2131 bp - 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 10208037-10210149(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr02G000009 Chr02 NC_080388.1:68191-68202promoter 内 1773-1784 bp + 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 70419-73585(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTGTC
SmilChr01G005895 Chr01 NC_080387.1:74871595-74871606promoter 内 1705-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 74873891-74875517(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCAGACGTGGC
SmilChr04G000234 Chr04 NC_080390.1:2082798-2082809promoter 内 1084-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 2074561-2079892(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGCA
SmilChr03G001959 Chr03 NC_080389.1:28085217-28085228promoter 内 552-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 28080979-28081779(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGCA
SmilChr01G004699 Chr01 NC_080387.1:65099841-65099852promoter 内 29-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 65094038-65095880(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTGTC
SmilChr02G004865 Chr02 NC_080388.1:70763795-70763806promoter 内 3981-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 70763815-70766556(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGGC
SmilChr02G004925 Chr02 NC_080388.1:71267268-71267279promoter 内 3698-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 71267571-71269699(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
SmilChr04G002627 Chr04 NC_080390.1:41692267-41692278promoter 内 3567-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 41689656-41691844(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCC
SmilChr02G004864 Chr02 NC_080388.1:70763795-70763806promoter 内 3279-3290 bp + 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 70761104-70763084(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAGAA
SmilChr01G002067 Chr01 NC_080387.1:36525102-36525113promoter 内 3271-3282 bp - 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 36522430-36524383(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGGC
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SmilChr01G002068 Chr01 NC_080387.1:36525102-36525113promoter 内 2813-2824 bp - 1177 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 36526290-36527839(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAGAA
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SmilChr04G000767 Chr04 NC_080390.1:9385217-9385228promoter 内 1877-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 9387341-9389181(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCCCACGTGGC
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SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53895675-53895686promoter 内 1100-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 53898576-53900830(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGGCA
SmilChr04G001388 Chr04 NC_080390.1:22558693-22558704promoter 内 849-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 22551800-22555552(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAGCC
SmilChr01G006125 Chr01 NC_080387.1:76758695-76758706promoter 内 362-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 76762334-76763963(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTGCA
SmilChr04G002900 Chr04 NC_080390.1:45269706-45269717promoter 内 329-340 bp - 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 45273378-45273800(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAGAA