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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 114 / 164 下载 TSV

上一页 114 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000288 Chr04 NC_080390.1:2689082-2689096promoter 内 16-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 2685038-2685111(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAGAGGTAGGTAGT
SmilChr03G001376 Chr03 NC_080389.1:16248960-16248974promoter 内 3972-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 16248989-16250404(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTTGTTAGGTGAC
SmilChr08G000429 Chr08 NC_080394.1:3077407-3077421promoter 内 3924-3938 bp - 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 3077484-3083077(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCAACCTACCACTGA
SmilChr03G003333 Chr03 NC_080389.1:51599592-51599606promoter 内 3576-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 51600017-51606714(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTAACTACCAATCA
SmilChr04G000301 Chr04 NC_080390.1:2787951-2787965promoter 内 3536-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 2785965-2787500(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGTTTAGTAGGTGTA
SmilChr08G001213 Chr08 NC_080394.1:9801315-9801329promoter 内 3029-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 9802287-9805250(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATATAGGTAGGTTGC
SmilChr02G001937 Chr02 NC_080388.1:34776959-34776973promoter 内 2360-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 34774139-34775332(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCAATGGTAGGTAGC
SmilChr02G003340 Chr02 NC_080388.1:54618062-54618076promoter 内 1486-1500 bp + 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 54613186-54615561(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATACCTACCAAAAT
SmilChr07G004213 Chr07 NC_080393.1:54318584-54318598promoter 内 1475-1489 bp - 2512 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 54321110-54323657(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAATTACTT
SmilChr08G001211 Chr08 NC_080394.1:9801315-9801329promoter 内 1043-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 9789896-9798371(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCAACCTACCTATAT
SmilChr02G001359 Chr02 NC_080388.1:25419747-25419761promoter 内 654-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 25413893-25416414(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACTTTGCT
SmilChr08G000854 Chr08 NC_080394.1:6337080-6337094promoter 内 477-491 bp - 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 6331377-6333570(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTTTTGGTAGGTACC
SmilChr06G000183 Chr06 NC_080392.1:1270672-1270686promoter 内 3941-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1270732-1272241(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTGTCTA
SmilChr06G001769 Chr06 NC_080392.1:20660680-20660694promoter 内 3934-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20651722-20660627(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCTAGTTAGGTGAA
SmilChr05G004025 Chr05 NC_080391.1:54248540-54248554promoter 内 3919-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54248622-54251715(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTTGGGTAGGTTAA
SmilChr01G004478 Chr01 NC_080387.1:62884156-62884170promoter 内 3917-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 62878340-62884086(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTTGGGTAGGTTAA
SmilChr06G000214 Chr06 NC_080392.1:1430935-1430949promoter 内 3781-3795 bp - 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 1431155-1434387(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCGACTA
SmilChr05G001191 Chr05 NC_080391.1:9984183-9984197promoter 内 3764-3778 bp + 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9984420-9989062(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGAGAGTAGGTGCA
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SmilChr01G001067 Chr01 NC_080387.1:22019133-22019147promoter 内 3593-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22019541-22023684(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATATGGTAGGTAAT
SmilChr05G001880 Chr05 NC_080391.1:19070854-19070868promoter 内 3515-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 19071340-19072628(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GAGAGAGTAGGTGGT
SmilChr02G003652 Chr02 NC_080388.1:57913279-57913293promoter 内 3493-3507 bp + 494 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 57908011-57912785(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TACACCTACTTACTG
SmilChr08G000029 Chr08 NC_080394.1:189385-189399promoter 内 3486-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 189900-192536(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATGTAGTAGGTGAT
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SmilChr02G000436 Chr02 NC_080388.1:5700255-5700269promoter 内 3360-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5697018-5699628(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATACCTACCAAAAT
SmilChr02G001525 Chr02 NC_080388.1:28380442-28380456promoter 内 3351-3365 bp + 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28381092-28381587(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GACGTGGTAGGTCGA
SmilChr02G000531 Chr02 NC_080388.1:7308885-7308899promoter 内 3336-3350 bp + 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 7309550-7325735(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTAAAAGTAGGTGGC
SmilChr03G002631 Chr03 NC_080389.1:41779464-41779478promoter 内 3318-3332 bp - 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41777927-41778795(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGGAAAGTAGGTGAT
SmilChr06G002772 Chr06 NC_080392.1:40319905-40319919promoter 内 3242-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40307238-40319160(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTTAACTACCAAACG
SmilChr01G005287 Chr01 NC_080387.1:70220298-70220312promoter 内 3212-3226 bp - 775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 70221087-70222094(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTACCTACCATATT
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SmilChr03G004036 Chr03 NC_080389.1:59373841-59373855promoter 内 3057-3071 bp + 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59374785-59375569(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGTTTGGTAGTTAAG
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SmilChr03G002276 Chr03 NC_080389.1:35913829-35913843promoter 内 2899-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35914931-35915398(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTTTGGTAGGTATC
SmilChr03G003566 Chr03 NC_080389.1:54298843-54298857promoter 内 2834-2848 bp - 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54296681-54297690(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTGAAGGTAGGTACA
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SmilChr05G001780 Chr05 NC_080391.1:17530603-17530617promoter 内 2699-2713 bp + 1288 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 17527514-17529315(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTAACTACCAACAA
SmilChr02G001126 Chr02 NC_080388.1:20409903-20409917promoter 内 2653-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20403583-20408569(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTACCTACCATATT
SmilChr02G005232 Chr02 NC_080388.1:73513652-73513666promoter 内 2598-2612 bp + 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 73515055-73516164(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTAAGGTAGGTAGC
SmilChr02G002826 Chr02 NC_080388.1:48366287-48366301promoter 内 2562-2576 bp - 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48358381-48364862(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCATTGGTAGGTACA
SmilChr08G001215 Chr08 NC_080394.1:9808219-9808233promoter 内 2536-2550 bp + 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9809684-9817763(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGATAGTTAGGTGAA
SmilChr01G003187 Chr01 NC_080387.1:50622217-50622231promoter 内 2496-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50614422-50620726(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGAACCTACCCCCAT
SmilChr07G004314 Chr07 NC_080393.1:55706109-55706123promoter 内 2473-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55701722-55704595(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGCAGGTAGGTACA
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SmilChr05G004392 Chr05 NC_080391.1:57366240-57366254promoter 内 2425-2439 bp - 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 57363760-57364678(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GATATAGTAGGTGGT
SmilChr06G002781 Chr06 NC_080392.1:40501997-40502011promoter 内 2424-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40499076-40500434(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCTCCTACCAACCC