转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 115 / 167 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000890 Chr01 NC_080387.1:18941985-18941996promoter 内 3693-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18941142-18941688(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGACAAA
SmilChr02G001972 Chr02 NC_080388.1:35694364-35694375promoter 内 3547-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35694818-35697027(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGCCACGCCAAT
SmilChr04G001864 Chr04 NC_080390.1:30391726-30391737promoter 内 3506-3517 bp + 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30389043-30391242(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTTGTCGTGTTA
SmilChr04G000431 Chr04 NC_080390.1:4588703-4588714promoter 内 3469-3480 bp - 521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4589235-4596068(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGAC
SmilChr08G001478 Chr08 NC_080394.1:11922104-11922115promoter 内 3388-3399 bp + 602 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11922717-11923530(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCTACA
SmilChr04G001103 Chr04 NC_080390.1:15788922-15788933promoter 内 3331-3342 bp - 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15785082-15788263(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTCCACGCCAAT
SmilChr04G001017 Chr04 NC_080390.1:14171481-14171492promoter 内 3321-3332 bp - 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14172161-14173707(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGAAC
SmilChr07G000980 Chr07 NC_080393.1:7126195-7126206promoter 内 3321-3332 bp - 669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7126875-7132382(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGGAT
SmilChr06G003258 Chr06 NC_080392.1:45241590-45241601promoter 内 3269-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45238160-45240869(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTTGGCGTGGAT
SmilChr03G002865 Chr03 NC_080389.1:45263169-45263180promoter 内 3207-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45263963-45264747(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATCCACGCCAAC
SmilChr02G005193 Chr02 NC_080388.1:73207587-73207598promoter 内 3121-3132 bp - 869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73203421-73206718(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGACAAA
SmilChr01G001344 Chr01 NC_080387.1:26700386-26700397promoter 内 3083-3094 bp + 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 26701304-26704417(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTCCACGCCAAT
SmilChr01G000218 Chr01 NC_080387.1:3793583-3793594promoter 内 3073-3084 bp - 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3794511-3799399(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTTGTCGTGTTA
SmilChr01G003207 Chr01 NC_080387.1:50855886-50855897promoter 内 3054-3065 bp - 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 50856833-50858826(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGGT
SmilChr03G002541 Chr03 NC_080389.1:40574545-40574556promoter 内 3020-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40575526-40577406(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGGT
SmilChr01G001343 Chr01 NC_080387.1:26700386-26700397promoter 内 3000-3011 bp + 990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 26698517-26699396(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGAG
SmilChr01G002223 Chr01 NC_080387.1:38662018-38662029promoter 内 2999-3010 bp - 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 38663020-38663538(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGAG
SmilChr01G000584 Chr01 NC_080387.1:12602396-12602407promoter 内 2980-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12599471-12601386(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTCACGCCAAT
SmilChr07G003310 Chr07 NC_080393.1:35111611-35111622promoter 内 2961-2972 bp + 1029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35107084-35110582(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTTGGCGTGACT
SmilChr01G001695 Chr01 NC_080387.1:31203824-31203835promoter 内 2901-2912 bp - 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31201668-31202735(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTCACGCCAAC
SmilChr03G002158 Chr03 NC_080389.1:33604966-33604977promoter 内 2895-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 33606072-33607171(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCTACA
SmilChr01G001255 Chr01 NC_080387.1:25191429-25191440promoter 内 2893-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25192537-25198619(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGCCACGCCAAT
SmilChr08G001225 Chr08 NC_080394.1:9894746-9894757promoter 内 2889-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9892300-9893645(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTCACGCCAAC
SmilChr07G002645 Chr07 NC_080393.1:25591994-25592005promoter 内 2846-2857 bp + 1144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 25588789-25590850(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGAGC
SmilChr05G001883 Chr05 NC_080391.1:19112116-19112127promoter 内 2831-2842 bp - 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 19096454-19110957(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTCACGCCAAT
SmilChr06G001176 Chr06 NC_080392.1:11969203-11969214promoter 内 2829-2840 bp + 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11966853-11968042(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTTGTCGTGTTA
SmilChr08G001589 Chr08 NC_080394.1:13137290-13137301promoter 内 2828-2839 bp - 1162 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 13131642-13136128(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTCACGCCAAC
SmilChr08G001601 Chr08 NC_080394.1:13257493-13257504promoter 内 2792-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 13251846-13256295(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGTCACGCCAAC
SmilChr01G005842 Chr01 NC_080387.1:74416775-74416786promoter 内 2785-2796 bp + 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74411756-74415570(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTTGTCGTGTTA
SmilChr04G002249 Chr04 NC_080390.1:36378412-36378423promoter 内 2765-2776 bp - 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36371399-36377187(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGACAAA
SmilChr07G000885 Chr07 NC_080393.1:6343805-6343816promoter 内 2751-2762 bp - 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6345055-6348080(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGAGC
SmilChr05G002806 Chr05 NC_080391.1:32857940-32857951promoter 内 2537-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32854115-32856487(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TTTGTCGTGTTA
SmilChr01G005322 Chr01 NC_080387.1:70446591-70446602promoter 内 2536-2547 bp - 1454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70442007-70445137(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGCCACGCCAAT
SmilChr04G003818 Chr04 NC_080390.1:54334663-54334674promoter 内 2534-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54329480-54333207(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CTTCACGCCAAC
SmilChr02G003180 Chr02 NC_080388.1:52963219-52963230promoter 内 2391-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52957826-52961620(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATCCACGCCAAG
SmilChr07G000760 Chr07 NC_080393.1:5344332-5344343promoter 内 2383-2394 bp + 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5342012-5342725(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ATTGGCGTGGAG
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