转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000157; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006890-RA_Salv SmilChr04G000157 bHLH XP_057807462.1 MP00081 AGCCACGTGA

可能结合的靶基因

9942 个结合位点 6729 个候选靶基因 第 116 / 135 下载 TSV

上一页 116 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004278 Chr01 NC_080387.1:61008452-61008461promoter 内 3965-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61005525-61008425(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr02G004049 Chr02 NC_080388.1:62822894-62822903promoter 内 3924-3933 bp - 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 62818193-62822826(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCTCACGTGA
SmilChr03G001536 Chr03 NC_080389.1:19265851-19265860promoter 内 3816-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19261872-19265675(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAGA
SmilChr01G000439 Chr01 NC_080387.1:8801157-8801166promoter 内 3722-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8800797-8800887(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G001788 Chr01 NC_080387.1:32748448-32748457promoter 内 3223-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32747541-32747679(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G003647 Chr01 NC_080387.1:54948813-54948822promoter 内 3171-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54949643-54949781(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G005798 Chr01 NC_080387.1:74057710-74057719promoter 内 3127-3136 bp + 865 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 74058584-74062104(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr02G002913 Chr02 NC_080388.1:49434572-49434581promoter 内 3047-3056 bp - 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49428195-49433627(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G003648 Chr01 NC_080387.1:54953644-54953653promoter 内 2850-2859 bp + 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54954795-54957194(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr03G000555 Chr03 NC_080389.1:6011275-6011284promoter 内 2733-2742 bp - 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6006474-6010016(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr05G001592 Chr05 NC_080391.1:14621849-14621858promoter 内 2721-2730 bp + 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14623129-14623551(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCTCACGTGA
SmilChr03G003129 Chr03 NC_080389.1:48458338-48458347promoter 内 2618-2627 bp - 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48459721-48465168(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAGA
SmilChr02G001293 Chr02 NC_080388.1:23819149-23819158promoter 内 2579-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23815193-23817736(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCTCACGTGA
SmilChr01G001998 Chr01 NC_080387.1:35477911-35477920promoter 内 2542-2551 bp + 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35470632-35476461(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr03G000437 Chr03 NC_080389.1:4726700-4726709promoter 内 2535-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 4724393-4725243(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAGA
SmilChr01G005339 Chr01 NC_080387.1:70622402-70622411promoter 内 2494-2503 bp + 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 70623909-70625403(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr02G003760 Chr02 NC_080388.1:59291563-59291572promoter 内 2418-2427 bp + 1574 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 59263956-59289989(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAGA
SmilChr01G004265 Chr01 NC_080387.1:60914637-60914646promoter 内 2245-2254 bp - 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 60911850-60912890(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCTCACGTGA
SmilChr01G005800 Chr01 NC_080387.1:74072244-74072253promoter 内 2206-2215 bp + 1786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 74074039-74077240(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G003853 Chr01 NC_080387.1:56808041-56808050promoter 内 2205-2214 bp + 1787 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56802521-56806254(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr01G003813 Chr01 NC_080387.1:56515410-56515419promoter 内 2162-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56517249-56520956(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr02G003966 Chr02 NC_080388.1:61801890-61801899promoter 内 2139-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61798581-61800037(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr05G001799 Chr05 NC_080391.1:17746204-17746213promoter 内 2047-2056 bp - 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 17739206-17744259(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr02G003324 Chr02 NC_080388.1:54520251-54520260promoter 内 1918-1927 bp - 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54514246-54518177(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G000488 Chr01 NC_080387.1:9954093-9954102promoter 内 1890-1899 bp + 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9950355-9951991(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr02G003967 Chr02 NC_080388.1:61801890-61801899promoter 内 1889-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 61804002-61804074(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr03G004249 Chr03 NC_080389.1:60969215-60969224promoter 内 1699-1708 bp - 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 60971517-60975668(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr05G000700 Chr05 NC_080391.1:5282591-5282600promoter 内 1681-1690 bp + 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5275291-5280280(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr02G001951 Chr02 NC_080388.1:35215138-35215147promoter 内 1640-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 35211877-35212786(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAGA
SmilChr03G003453 Chr03 NC_080389.1:52893768-52893777promoter 内 1490-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52896279-52899417(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr03G003366 Chr03 NC_080389.1:52009049-52009058promoter 内 1482-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52005138-52006539(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G003817 Chr01 NC_080387.1:56531904-56531913promoter 内 1367-1376 bp + 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56527129-56529279(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr02G000075 Chr02 NC_080388.1:972279-972288promoter 内 1324-1333 bp + 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 967593-969611(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr04G000364 Chr04 NC_080390.1:3657535-3657544promoter 内 1188-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3654240-3654731(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G004673 Chr01 NC_080387.1:64811112-64811121promoter 内 809-818 bp - 3183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64814304-64815109(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr04G003765 Chr04 NC_080390.1:53886539-53886548promoter 内 781-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53889759-53893102(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr02G002553 Chr02 NC_080388.1:44422161-44422170promoter 内 591-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44425571-44436481(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCTCACGTGA
SmilChr02G000077 Chr02 NC_080388.1:972279-972288promoter 内 494-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 975786-976583(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr04G000655 Chr04 NC_080390.1:7431760-7431769promoter 内 485-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7425185-7428253(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CAGCACGTGA
SmilChr01G003351 Chr01 NC_080387.1:52268208-52268217promoter 内 477-486 bp + 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 52261010-52264693(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr01G001789 Chr01 NC_080387.1:32748448-32748457promoter 内 464-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32751985-32754320(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr01G001525 Chr01 NC_080387.1:29215443-29215452promoter 内 408-417 bp + 3584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 29209008-29211859(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
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SmilChr01G001210 Chr01 NC_080387.1:24330455-24330464promoter 内 377-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 24334079-24334794(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
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SmilChr01G002512 Chr01 NC_080387.1:43022182-43022191promoter 内 256-265 bp - 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43025927-43027437(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr03G002638 Chr03 NC_080389.1:41968588-41968597promoter 内 216-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 41963633-41964812(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGCTG
SmilChr02G000516 Chr02 NC_080388.1:7123831-7123840promoter 内 2909-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 5 7120527-7122748(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 GTTCACGTGA
SmilChr03G002225 Chr03 NC_080389.1:35072044-35072053promoter 内 3260-3269 bp - 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 4 35068704-35071312(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 GTTCACGTGA
SmilChr03G002226 Chr03 NC_080389.1:35072044-35072053promoter 内 1449-1458 bp - 2543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 4 35074596-35075645(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 TCACGTGAAC