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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003833; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013392-RA_Salv SmilChr02G003833 MYB XP_057794421.1 MP00476 TAACCGTAATA

可能结合的靶基因

9904 个结合位点 7981 个候选靶基因 第 13 / 160 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000260 Chr03 NC_080389.1:3044925-3044935promoter 内 1267-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 3038683-3042201(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr03G003390 Chr03 NC_080389.1:52298718-52298728promoter 内 1251-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 52294179-52295978(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr04G001843 Chr04 NC_080390.1:29969980-29969990promoter 内 1234-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 29965336-29967223(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGATACGGTTA
SmilChr05G003932 Chr05 NC_080391.1:53083438-53083448promoter 内 1169-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 53086270-53087226(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr03G002862 Chr03 NC_080389.1:45238585-45238595promoter 内 1134-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 45233810-45235728(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATTACGGTTA
SmilChr01G005157 Chr01 NC_080387.1:69337600-69337610promoter 内 1084-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 69340517-69346912(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr08G000004 Chr08 NC_080394.1:62512-62522promoter 内 1083-1093 bp - 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 65430-69058(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATTACGGTTA
SmilChr01G003730 Chr01 NC_080387.1:55606185-55606195promoter 内 1022-1032 bp + 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 55602590-55603216(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 ATTTACGGTTA
SmilChr07G003032 Chr07 NC_080393.1:31357483-31357493promoter 内 962-972 bp + 3029 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 31360522-31370000(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAATT
SmilChr01G004412 Chr01 NC_080387.1:62240732-62240742promoter 内 926-936 bp - 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 62243807-62244992(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATTACGGTTA
SmilChr07G001450 Chr07 NC_080393.1:11262714-11262724promoter 内 888-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 11265827-11265950(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAA
SmilChr03G003584 Chr03 NC_080389.1:54481100-54481110promoter 内 867-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 54476504-54477976(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATTACGGTTA
SmilChr01G002040 Chr01 NC_080387.1:36068058-36068068promoter 内 857-867 bp + 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 36071202-36076483(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr06G001763 Chr06 NC_080392.1:20603387-20603397promoter 内 840-850 bp - 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 20598312-20600236(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAA
SmilChr08G000548 Chr08 NC_080394.1:3995205-3995215promoter 内 763-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 3990043-3991977(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTTA
SmilChr05G000968 Chr05 NC_080391.1:7809032-7809042promoter 内 735-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 7812298-7813413(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAAGACGGTTA
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SmilChr03G001160 Chr03 NC_080389.1:13380220-13380230promoter 内 682-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 13376123-13376911(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 ATTTACGGTTA
SmilChr01G002783 Chr01 NC_080387.1:46291270-46291280promoter 内 638-648 bp - 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 46280234-46287917(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr06G002717 Chr06 NC_080392.1:39245600-39245610promoter 内 593-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 39249008-39251026(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
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SmilChr07G000495 Chr07 NC_080393.1:3452590-3452600promoter 内 495-505 bp + 3496 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 3446894-3449094(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 ATTTACGGTTA
SmilChr01G003563 Chr01 NC_080387.1:54230198-54230208promoter 内 494-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 54224244-54226701(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATTACGGTTA
SmilChr03G003722 Chr03 NC_080389.1:56238032-56238042promoter 内 467-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 56241566-56245128(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAA
SmilChr02G002075 Chr02 NC_080388.1:37329835-37329845promoter 内 459-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 37333377-37345311(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 ATTTACGGTTA
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SmilChr07G001452 Chr07 NC_080393.1:11262714-11262724promoter 内 369-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 11266346-11266432(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAA
SmilChr07G002935 Chr07 NC_080393.1:29726808-29726818promoter 内 347-357 bp - 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 29721969-29723164(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAATT
SmilChr01G005654 Chr01 NC_080387.1:72906870-72906880promoter 内 333-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 72902302-72903212(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTAA
SmilChr06G001734 Chr06 NC_080392.1:19999727-19999737promoter 内 266-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 19982534-19996002(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAAAT
SmilChr07G000451 Chr07 NC_080393.1:3192905-3192915promoter 内 247-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 3186255-3189161(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGATACGGTTA
SmilChr02G000286 Chr02 NC_080388.1:3667394-3667404promoter 内 103-113 bp + 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 3656537-3663506(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGATACGGTTA
SmilChr05G003868 Chr05 NC_080391.1:52278653-52278663promoter 内 55-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 52272332-52274717(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTAATT
SmilChr05G002661 Chr05 NC_080391.1:30118756-30118766promoter 内 46-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 30122711-30123816(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCTTA
SmilChr06G003223 Chr06 NC_080392.1:45001006-45001016promoter 内 1-11 bp + 3990 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 44994120-44997016(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 ATTTACGGTTA
SmilChr04G004123 Chr04 NC_080390.1:56083695-56083705promoter 内 2287-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 5 56085409-56088068(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr03G003782 Chr03 NC_080389.1:56944515-56944525promoter 内 1040-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 5 56938455-56941564(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
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SmilChr01G000618 Chr01 NC_080387.1:13614832-13614842promoter 内 3574-3584 bp - 417 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 13615259-13616095(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr07G003982 Chr07 NC_080393.1:50803252-50803262promoter 内 3262-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 50803991-50806953(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr02G003875 Chr02 NC_080388.1:60803023-60803033promoter 内 2688-2698 bp - 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 60804336-60805807(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGAGACGGTTA
SmilChr08G001427 Chr08 NC_080394.1:11428871-11428881promoter 内 1592-1602 bp + 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 11425558-11426472(-) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr05G002960 Chr05 NC_080391.1:35796438-35796448promoter 内 1551-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 35798888-35799673(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGAGACGGTTA
SmilChr01G002205 Chr01 NC_080387.1:38370756-38370766promoter 内 403-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 38374354-38376882(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr08G000354 Chr08 NC_080394.1:2429508-2429518promoter 内 3925-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 2429584-2436644(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 TAACCGTCATT
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SmilChr07G002236 Chr07 NC_080393.1:20552801-20552811promoter 内 3617-3627 bp - 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 20553185-20556732(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGAGACGGTTA
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SmilChr05G002854 Chr05 NC_080391.1:34042639-34042649promoter 内 3193-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 34043447-34045370(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AATGACGGTTA
SmilChr01G002755 Chr01 NC_080387.1:45860271-45860281promoter 内 3188-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 45861084-45862112(+) SMil_00013392-RA_Salv MP00476 AGAGACGGTTA