Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID 家族 基序 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000593; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族蛋白基序共识序列
SMil_00001545-RA_Salv SmilChr05G000593 MIKC_MADS XP_057764223.1 MP00609 TTTTTTCCATTTTTGGTAA

可能结合的靶基因

9941 个结合位点 7575 个候选靶基因 第 136 / 152 下载 TSV

上一页 136 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF 基序 匹配序列
SmilChr05G000532 Chr05 NC_080391.1:4076993-4077011promoter 内 519-537 bp - 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 4072232-4073529(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTCTACTTTTTTTGGAAT
SmilChr01G002551 Chr01 NC_080387.1:43609989-43610007promoter 内 447-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 43613543-43615559(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTACTTGAAATGGAAAGTG
SmilChr01G005588 Chr01 NC_080387.1:72559966-72559984promoter 内 444-462 bp + 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 72554953-72556427(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATGGCAAAAATGGCTAAGA
SmilChr05G003540 Chr05 NC_080391.1:47266848-47266866promoter 内 431-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 47270418-47271831(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCACTTCTCCTTTTGGTCA
SmilChr01G002360 Chr01 NC_080387.1:40773924-40773942promoter 内 418-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 40764308-40770359(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TAACCGCAAATGGAACGGC
SmilChr06G002648 Chr06 NC_080392.1:38260594-38260612promoter 内 375-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 38264220-38266544(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GATCTCAAAGTGGAAAAAC
SmilChr04G002170 Chr04 NC_080390.1:35047096-35047114promoter 内 368-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 35050729-35051337(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGAGTTCCATTTTTGGGGA
SmilChr02G002540 Chr02 NC_080388.1:44236434-44236452promoter 内 351-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 44229787-44232802(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTATGTCTTTTTTTGGCTG
SmilChr01G002712 Chr01 NC_080387.1:45364559-45364577promoter 内 349-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 45368211-45371658(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GGGCCGAAAATGGCCAAGC
SmilChr03G003398 Chr03 NC_080389.1:52375486-52375504promoter 内 335-353 bp + 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 52369776-52371838(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTATATATGGAAATAA
SmilChr01G002675 Chr01 NC_080387.1:44965129-44965147promoter 内 328-346 bp + 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 44960668-44961474(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGACCAAAAGGAGAAGTGG
SmilChr04G003440 Chr04 NC_080390.1:50925981-50925999promoter 内 327-345 bp - 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 50929655-50931651(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACTCCAAATAAAGAAAAAA
SmilChr03G003835 Chr03 NC_080389.1:57502004-57502022promoter 内 318-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 57494674-57498339(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATGCCAAAAAAAAAAAAAA
SmilChr01G001786 Chr01 NC_080387.1:32734452-32734470promoter 内 315-333 bp - 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 32738138-32740854(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTCAAAATGGCACGGC
SmilChr06G001297 Chr06 NC_080392.1:13525287-13525305promoter 内 277-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 13504616-13521581(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCACCAAAAATGGAACACT
SmilChr02G000790 Chr02 NC_080388.1:12987590-12987608promoter 内 238-256 bp - 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 12991353-12997293(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTATATATGGAAATAA
SmilChr06G001485 Chr06 NC_080392.1:15828301-15828319promoter 内 236-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 15818411-15824554(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AGCTTTCCATTTTGGCAAC
SmilChr03G001517 Chr03 NC_080389.1:18592415-18592433promoter 内 222-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 18596194-18596810(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCACTTCTCCTTTTGGTCA
SmilChr01G005584 Chr01 NC_080387.1:72524763-72524781promoter 内 219-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 72528545-72529494(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TCTTAGCCATTTTTGCCAT
SmilChr04G004013 Chr04 NC_080390.1:55421327-55421345promoter 内 179-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 55425149-55427025(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GAACTTCCATTTTTGTCAT
SmilChr03G001169 Chr03 NC_080389.1:13449351-13449369promoter 内 177-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 13453175-13453895(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACCCCCAAAATGGTAGGAA
SmilChr02G002411 Chr02 NC_080388.1:42088876-42088894promoter 内 172-190 bp + 3811 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 42084993-42085065(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATCCAAAAAAGAAAATGA
SmilChr05G002793 Chr05 NC_080391.1:32655616-32655634promoter 内 159-177 bp - 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 32647366-32651792(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACTCTACCATTTTTGCCAA
SmilChr03G002249 Chr03 NC_080389.1:35417923-35417941promoter 内 146-164 bp - 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 35421778-35425099(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGACCATATTTGGAAAAAA
SmilChr05G000414 Chr05 NC_080391.1:3129750-3129768promoter 内 50-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 3133701-3136439(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAACCAAAAAAGAAAAAAG
SmilChr01G004488 Chr01 NC_080387.1:63007382-63007400promoter 内 47-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 63011336-63014466(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTGCTGAAAAGGAAAAAA
SmilChr05G002061 Chr05 NC_080391.1:21484973-21484991promoter 内 32-50 bp + 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 21475153-21481022(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACACCTGAAGGGGAAAAAT
SmilChr05G001822 Chr05 NC_080391.1:18247528-18247546promoter 内 24-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 18238806-18243569(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTCTAAAAATGGTAGCAT
SmilChr02G003507 Chr02 NC_080388.1:56251477-56251495promoter 内 3732-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 56251746-56264745(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TACCCAAAAAAAGAATTAA
SmilChr06G001255 Chr06 NC_080392.1:13053638-13053656promoter 内 2846-2864 bp - 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 13054793-13056103(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAACTCAAAATAGAAAAAA
SmilChr02G005171 Chr02 NC_080388.1:73020385-73020403promoter 内 2002-2020 bp + 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 73022384-73027079(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GGTTGGCCATTTTAGGCTT
SmilChr01G000712 Chr01 NC_080387.1:15890170-15890188promoter 内 1412-1430 bp - 2571 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 15892759-15905581(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CTACTAAAAATGGAAGTGG
SmilChr06G001227 Chr06 NC_080392.1:12663523-12663541promoter 内 972-990 bp + 3011 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 12666552-12667605(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGCGTACTCTTTTTGGTAA
SmilChr02G004029 Chr02 NC_080388.1:62579762-62579780promoter 内 262-280 bp + 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 62571706-62576041(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATGGTAAAAATGGAAATAA
SmilChr02G004030 Chr02 NC_080388.1:62579762-62579780promoter 内 134-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 62583629-62586247(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTATTTCCATTTTTACCAT
SmilChr01G000701 Chr01 NC_080387.1:15736381-15736399promoter 内 57-75 bp - 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 2 15740325-15742184(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAGATAAAAAAGGAAAAAA
SmilChr01G004632 Chr01 NC_080387.1:64354380-64354398promoter 内 3979-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 64354402-64355717(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 GAGACAGAAAAGGAAAAAG
SmilChr05G002970 Chr05 NC_080391.1:36091029-36091047promoter 内 3908-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 36091122-36092295(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAACCAAAACGGGAATGAT
SmilChr03G001198 Chr03 NC_080389.1:13814333-13814351promoter 内 3890-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 13814444-13815013(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTTTTTCTCTTTGAGGTCA
SmilChr04G003278 Chr04 NC_080390.1:49472017-49472035promoter 内 3884-3902 bp + 99 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 49467144-49471918(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TATACAAAAATAGAAATAT
SmilChr05G002388 Chr05 NC_080391.1:26378350-26378368promoter 内 3883-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 26335330-26378250(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTCCAAAAAGGGCCGAAT
SmilChr02G000149 Chr02 NC_080388.1:1984139-1984157promoter 内 3829-3847 bp - 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 1982500-1983985(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 CCACTTCCATTTTTAGTAG
SmilChr04G003679 Chr04 NC_080390.1:53243551-53243569promoter 内 3797-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 53243755-53246436(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATTTTTCCATATTAAGGAA
SmilChr06G001017 Chr06 NC_080392.1:10077153-10077171promoter 内 3771-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 10072627-10076941(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AAAACCAAAATGGAAAACT
SmilChr02G002685 Chr02 NC_080388.1:46492708-46492726promoter 内 3756-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 46492953-46495890(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ATCCCTCCATTTTTGGTGT
SmilChr04G002846 Chr04 NC_080390.1:44578880-44578898promoter 内 3740-3758 bp + 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 44578040-44578637(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTACTAAAATGGAAATGT
SmilChr02G003559 Chr02 NC_080388.1:56754433-56754451promoter 内 3732-3750 bp - 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 56754702-56767587(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TACCCAAAAAAAGAATTAA
SmilChr02G002490 Chr02 NC_080388.1:43317407-43317425promoter 内 3713-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 43317695-43323564(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 AACCCAAAAAAGGAATTTG
SmilChr03G004737 Chr03 NC_080389.1:64503318-64503336promoter 内 3612-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 64495204-64502947(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTACTAAAATGGAAATGT
SmilChr03G001300 Chr03 NC_080389.1:15225250-15225268promoter 内 3548-3566 bp + 435 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.4/ 100 1 15222696-15224815(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 ACACCAAAAATGGAGGGAT