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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003399; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00009551-RA_Salv SmilChr02G003399 ERF XP_057793859.1 MP00240 CCACCTCCACCGCCA

可能结合的靶基因

9978 个结合位点 6368 个候选靶基因 第 14 / 128 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000430 Chr03 NC_080389.1:4671472-4671486promoter 内 778-792 bp + 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 4666578-4668263(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr05G000838 Chr05 NC_080391.1:6611565-6611579promoter 内 637-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 6614929-6633581(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr06G000220 Chr06 NC_080392.1:1476500-1476514promoter 内 481-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 1468124-1472994(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr01G001695 Chr01 NC_080387.1:31206316-31206330promoter 内 406-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 31201668-31202735(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr04G001347 Chr04 NC_080390.1:21836841-21836855promoter 内 303-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 21829499-21833157(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCAGCGG
SmilChr05G002374 Chr05 NC_080391.1:26011546-26011560promoter 内 114-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 26006380-26007673(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr04G002349 Chr04 NC_080390.1:37918510-37918524promoter 内 97-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 37922414-37923323(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr02G000376 Chr02 NC_080388.1:4748585-4748599promoter 内 88-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 4752498-4755998(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr02G000374 Chr02 NC_080388.1:4748585-4748599promoter 内 56-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 4741239-4744654(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr02G001773 Chr02 NC_080388.1:32492301-32492315promoter 内 8-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 32484108-32488322(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr03G000665 Chr03 NC_080389.1:7445636-7445650promoter 内 3602-3616 bp - 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 7444379-7445251(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCG
SmilChr08G002046 Chr08 NC_080394.1:18283510-18283524promoter 内 3197-3211 bp + 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18278013-18282720(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCAGCGG
SmilChr08G002051 Chr08 NC_080394.1:18344815-18344829promoter 内 3148-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18339316-18343976(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGCAGCGG
SmilChr07G003790 Chr07 NC_080393.1:46617140-46617154promoter 内 2019-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 46619122-46619972(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGCCGCCACCGCCT
SmilChr07G002757 Chr07 NC_080393.1:27388993-27389007promoter 内 1729-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 27385203-27386735(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCA
SmilChr05G000400 Chr05 NC_080391.1:3007848-3007862promoter 内 2941-2955 bp - 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 3008908-3013875(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCGGTGA
SmilChr02G003303 Chr02 NC_080388.1:54304776-54304790promoter 内 2832-2846 bp - 1155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 54300201-54303621(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCA
SmilChr06G000396 Chr06 NC_080392.1:3169759-3169773promoter 内 2591-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 3161647-3168363(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr04G000103 Chr04 NC_080390.1:920007-920021promoter 内 2430-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 921578-924923(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCATCGCCACCGCCG
SmilChr01G003817 Chr01 NC_080387.1:56531125-56531139promoter 内 2141-2155 bp + 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 56527129-56529279(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCGATGG
SmilChr06G000911 Chr06 NC_080392.1:8581932-8581946promoter 内 1031-1045 bp + 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 8584902-8585833(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCA
SmilChr02G003304 Chr02 NC_080388.1:54304776-54304790promoter 内 137-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 54308640-54311391(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr07G002183 Chr07 NC_080393.1:20045075-20045089promoter 内 3214-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 20043026-20044302(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GCGCCGCCACCGCCT
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SmilChr04G000116 Chr04 NC_080390.1:1006373-1006387promoter 内 2196-2210 bp + 1791 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 1008178-1014169(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCA
SmilChr01G002289 Chr01 NC_080387.1:39728589-39728603promoter 内 2058-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 39720915-39726660(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCGGTGA
SmilChr07G004410 Chr07 NC_080393.1:56723199-56723213promoter 内 1913-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 56725287-56727864(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCGCCGCCACCGCTT
SmilChr08G001620 Chr08 NC_080394.1:13418535-13418549promoter 内 1892-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 13420644-13423943(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 GGGCGGTGGCGGTGG
SmilChr08G000110 Chr08 NC_080394.1:696538-696552promoter 内 1828-1842 bp - 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 690721-694379(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCTCCACCACCGCCA
SmilChr08G000785 Chr08 NC_080394.1:5792945-5792959promoter 内 1810-1824 bp + 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 5789720-5790768(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr06G001051 Chr06 NC_080392.1:10369113-10369127promoter 内 1742-1756 bp + 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 10362673-10366868(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGCGGTGG
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SmilChr03G003005 Chr03 NC_080389.1:46885741-46885755promoter 内 1388-1402 bp - 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 46888354-46891150(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CAGCGGTGGCGGTGG
SmilChr07G003108 Chr07 NC_080393.1:32931843-32931857promoter 内 1353-1367 bp + 2634 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 32934491-32934570(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCACCGCCACCGCCG
SmilChr08G000849 Chr08 NC_080394.1:6300703-6300717promoter 内 1159-1173 bp + 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 6289574-6297875(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TGGCGGTGGTGGAGG
SmilChr05G000216 Chr05 NC_080391.1:1701704-1701718promoter 内 984-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 1695699-1698701(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCACCGCCACCGCTG
SmilChr08G002334 Chr08 NC_080394.1:21986283-21986297promoter 内 592-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 21976596-21982888(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCGGCGC
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SmilChr08G001521 Chr08 NC_080394.1:12366085-12366099promoter 内 3902-3916 bp + 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 12360556-12366000(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CGGCGGTGGCGATGG
SmilChr05G002105 Chr05 NC_080391.1:22062790-22062804promoter 内 3756-3770 bp - 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 22063035-22064258(+) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 AGGCGGTGGCGGCGC
SmilChr02G004974 Chr02 NC_080388.1:71631302-71631316promoter 内 3487-3501 bp - 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 71629200-71630802(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCACCGCCACCGCCG
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SmilChr01G001826 Chr01 NC_080387.1:33222817-33222831promoter 内 1737-1751 bp - 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 33201879-33220567(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCACCGCCACCGCCG
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SmilChr05G000076 Chr05 NC_080391.1:390089-390103promoter 内 1145-1159 bp - 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 384786-387247(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 CCACCGCCACCGCCC
SmilChr02G004137 Chr02 NC_080388.1:63637804-63637818promoter 内 354-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 63627924-63634171(-) SMil_00009551-RA_Salv MP00240 TCGCCGCCACCGCCT