转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 142 / 143 下载 TSV

上一页 142 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003945 Chr03 NC_080389.1:58515174-58515185promoter 内 1181-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 58517994-58598431(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGAACAGCTGTG
SmilChr05G000277 Chr05 NC_080391.1:2149008-2149019promoter 内 1174-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 2151835-2153768(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCAA
SmilChr02G000659 Chr02 NC_080388.1:9992334-9992345promoter 内 1138-1149 bp + 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 9988220-9989482(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr03G001214 Chr03 NC_080389.1:13962599-13962610promoter 内 1079-1090 bp + 2911 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 13949030-13959688(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr04G001060 Chr04 NC_080390.1:15162839-15162850promoter 内 1067-1078 bp - 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 15159314-15159916(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCAA
SmilChr02G003950 Chr02 NC_080388.1:61667916-61667927promoter 内 1051-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 61670866-61674951(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAAACAGCTGGG
SmilChr05G004102 Chr05 NC_080391.1:54881186-54881197promoter 内 1009-1020 bp - 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54875827-54878205(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGCC
SmilChr05G003251 Chr05 NC_080391.1:41905091-41905102promoter 内 1003-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 41908089-41913254(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr05G003801 Chr05 NC_080391.1:51343115-51343126promoter 内 982-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 51337824-51340107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr01G002608 Chr01 NC_080387.1:44273225-44273236promoter 内 976-987 bp + 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 44269414-44270211(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr02G001267 Chr02 NC_080388.1:23227556-23227567promoter 内 957-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 23223735-23224523(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr07G004637 Chr07 NC_080393.1:59233599-59233610promoter 内 870-881 bp - 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 59228857-59230479(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCAA
SmilChr03G002121 Chr03 NC_080389.1:32962916-32962927promoter 内 859-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 32966058-32966610(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACCTGTCAA
SmilChr05G000291 Chr05 NC_080391.1:2223976-2223987promoter 内 800-811 bp - 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 2227177-2232336(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACCTGTCAA
SmilChr02G003466 Chr02 NC_080388.1:55955907-55955918promoter 内 778-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 55959130-55961909(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr06G001704 Chr06 NC_080392.1:19582916-19582927promoter 内 725-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 19586192-19593453(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAAACAGCTGTG
SmilChr03G002714 Chr03 NC_080389.1:43103061-43103072promoter 内 692-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 43097783-43099763(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr05G004100 Chr05 NC_080391.1:54848011-54848022promoter 内 666-677 bp + 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54851346-54857304(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAAACAGCTGTG
SmilChr03G004672 Chr03 NC_080389.1:64167583-64167594promoter 内 647-658 bp - 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 64170937-64175344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTCA
SmilChr02G005483 Chr02 NC_080388.1:75039703-75039714promoter 内 641-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 75034610-75036354(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTGC
SmilChr01G001945 Chr01 NC_080387.1:34661138-34661149promoter 内 633-644 bp + 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 34653462-34657781(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr05G002286 Chr05 NC_080391.1:24633149-24633160promoter 内 602-613 bp + 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 24623679-24629761(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr01G001406 Chr01 NC_080387.1:27669016-27669027promoter 内 589-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 27664472-27665615(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACCTGTCAA
SmilChr02G004854 Chr02 NC_080388.1:70694085-70694096promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 70697507-70701326(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCAA
SmilChr07G003474 Chr07 NC_080393.1:38970850-38970861promoter 内 574-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 38965895-38967434(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr01G004240 Chr01 NC_080387.1:60722337-60722348promoter 内 556-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 60715424-60718903(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTCC
SmilChr01G001949 Chr01 NC_080387.1:34717066-34717077promoter 内 552-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 34720515-34720586(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTTT
SmilChr02G003316 Chr02 NC_080388.1:54415177-54415188promoter 内 539-550 bp + 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54408101-54411726(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr01G001925 Chr01 NC_080387.1:34400866-34400877promoter 内 524-535 bp - 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 34395602-34397400(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGCC
SmilChr01G001231 Chr01 NC_080387.1:24732364-24732375promoter 内 413-424 bp - 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 24727627-24728787(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGCT
SmilChr01G000173 Chr01 NC_080387.1:2832828-2832839promoter 内 392-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 2836437-2840730(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCAC
SmilChr01G005225 Chr01 NC_080387.1:69794408-69794419promoter 内 385-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 69786888-69790803(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr01G005226 Chr01 NC_080387.1:69805452-69805463promoter 内 379-390 bp - 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 69797931-69801841(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr03G000415 Chr03 NC_080389.1:4486077-4486088promoter 内 358-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4477123-4482445(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAAAGCTGTA
SmilChr04G001763 Chr04 NC_080390.1:28987610-28987621promoter 内 353-364 bp + 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 28991258-28992659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAAAGCTGTA
SmilChr01G003521 Chr01 NC_080387.1:53847937-53847948promoter 内 340-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 53851598-53855012(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAG
SmilChr02G001036 Chr02 NC_080388.1:18443833-18443844promoter 内 283-294 bp - 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 18436349-18440126(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr04G001359 Chr04 NC_080390.1:22059726-22059737promoter 内 270-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 22063457-22068584(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAAAGCTGTA
SmilChr01G002791 Chr01 NC_080387.1:46408184-46408195promoter 内 259-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 46403662-46404453(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAAACAGCTGGG
SmilChr02G003212 Chr02 NC_080388.1:53308195-53308206promoter 内 246-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 53302853-53304451(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr02G000447 Chr02 NC_080388.1:5857485-5857496promoter 内 211-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 5850595-5853706(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTATA
SmilChr02G002977 Chr02 NC_080388.1:50324638-50324649promoter 内 200-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 50328439-50330654(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr02G002883 Chr02 NC_080388.1:49105662-49105673promoter 内 147-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 49099623-49101819(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr02G003444 Chr02 NC_080388.1:55707683-55707694promoter 内 131-142 bp - 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 55711553-55713525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCTT
SmilChr02G000459 Chr02 NC_080388.1:6150030-6150041promoter 内 83-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 6153948-6155631(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAAACAGCTGGG
SmilChr08G003276 Chr08 NC_080394.1:33874907-33874918promoter 内 35-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 33867680-33870952(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAACTGTCAA
SmilChr07G004209 Chr07 NC_080393.1:54262834-54262845promoter 内 18-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54266817-54298710(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAAACAGCTGGG
SmilChr08G000097 Chr08 NC_080394.1:587236-587247promoter 内 15-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 591222-605169(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCTT
SmilChr06G002379 Chr06 NC_080392.1:34629095-34629106promoter 内 953-964 bp - 3037 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 2 34632143-34635268(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTCC
SmilChr03G000874 Chr03 NC_080389.1:9933554-9933565promoter 内 3901-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 9932378-9933465(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTCAAGCTGTA