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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 143 / 153 下载 TSV

上一页 143 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002417 Chr05 NC_080391.1:26689156-26689165promoter 内 52-61 bp + 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 26693105-26693223(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAT
SmilChr01G005089 Chr01 NC_080387.1:68759192-68759201promoter 内 15-24 bp + 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68763178-68764269(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGT
SmilChr02G000992 Chr02 NC_080388.1:17446497-17446506promoter 内 6-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 17438728-17442511(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr02G000531 Chr02 NC_080388.1:7305550-7305559promoter 内 1-10 bp - 3991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7309550-7325735(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ACACCGACAA
SmilChr01G000052 Chr01 NC_080387.1:834424-834433promoter 内 2224-2233 bp - 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 830932-832656(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr03G002533 Chr03 NC_080389.1:40395845-40395854promoter 内 1313-1322 bp - 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 40387035-40393166(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr02G002873 Chr02 NC_080388.1:48975382-48975391promoter 内 960-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 48969672-48972350(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr02G002987 Chr02 NC_080388.1:50499799-50499808promoter 内 472-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 50503328-50506990(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr02G003363 Chr02 NC_080388.1:54755509-54755518promoter 内 3957-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54753719-54755474(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64166486-64166495promoter 内 3928-3937 bp + 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64166559-64168856(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr02G001127 Chr02 NC_080388.1:20403429-20403438promoter 内 3792-3801 bp - 200 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 20403638-20404276(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G004670 Chr03 NC_080389.1:64166486-64166495promoter 内 3785-3794 bp + 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64163545-64166279(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr04G004163 Chr04 NC_080390.1:56300366-56300375promoter 内 3776-3785 bp + 216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56300591-56302912(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr05G002275 Chr05 NC_080391.1:24473740-24473749promoter 内 3542-3551 bp + 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24472206-24473290(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr05G000312 Chr05 NC_080391.1:2352229-2352238promoter 内 3538-3547 bp + 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2352692-2356102(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAG
SmilChr05G002493 Chr05 NC_080391.1:27609976-27609985promoter 内 3517-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27608457-27609501(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr02G003119 Chr02 NC_080388.1:52212536-52212545promoter 内 3458-3467 bp + 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52210869-52212002(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G003167 Chr03 NC_080389.1:49033607-49033616promoter 内 3428-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49027296-49033043(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr04G002640 Chr04 NC_080390.1:41801230-41801239promoter 内 3338-3347 bp + 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41799818-41800576(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G003294 Chr03 NC_080389.1:51044093-51044102promoter 内 3333-3342 bp - 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51044761-51045769(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G001286 Chr03 NC_080389.1:15060612-15060621promoter 内 3234-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15061379-15065070(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr01G003640 Chr01 NC_080387.1:54902089-54902098promoter 内 3171-3180 bp - 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54897961-54901268(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr01G004577 Chr01 NC_080387.1:63812526-63812535promoter 内 3164-3173 bp + 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63806068-63811698(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G001342 Chr03 NC_080389.1:15678131-15678140promoter 内 3099-3108 bp + 893 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15674776-15677238(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr01G002556 Chr01 NC_080387.1:43691776-43691785promoter 内 3094-3103 bp + 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43686050-43690878(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16670721-16670730promoter 内 3087-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr05G001079 Chr05 NC_080391.1:8976346-8976355promoter 内 3081-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8974888-8975435(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr03G000742 Chr03 NC_080389.1:8468046-8468055promoter 内 3052-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8466323-8467106(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCACCGACAA
SmilChr01G001993 Chr01 NC_080387.1:35327370-35327379promoter 内 3047-3056 bp + 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 35328324-35336128(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGGTCGGAAG
SmilChr03G003765 Chr03 NC_080389.1:56789237-56789246promoter 内 3006-3015 bp + 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56790232-56794537(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr02G000718 Chr02 NC_080388.1:11532506-11532515promoter 内 3001-3010 bp + 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11533506-11537729(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr01G004830 Chr01 NC_080387.1:66435201-66435210promoter 内 2997-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66436205-66438902(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
SmilChr01G005259 Chr01 NC_080387.1:70080958-70080967promoter 内 2984-2993 bp + 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70079283-70079950(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTTCCGACCG
SmilChr03G002159 Chr03 NC_080389.1:33619963-33619972promoter 内 2840-2849 bp + 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33621124-33622008(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
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SmilChr03G002716 Chr03 NC_080389.1:43119097-43119106promoter 内 2585-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43114938-43117690(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG
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SmilChr01G004915 Chr01 NC_080387.1:67178061-67178070promoter 内 1951-1960 bp + 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67180111-67184533(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGTGG