转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 17 / 126 下载 TSV

上一页 17 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000079 Chr02 NC_080388.1:1039095-1039109promoter 内 986-1000 bp + 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 1032482-1036094(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGACATAA
SmilChr04G003465 Chr04 NC_080390.1:51133637-51133651promoter 内 718-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 51136920-51144915(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGAGACGTGGCA
SmilChr08G000506 Chr08 NC_080394.1:3698689-3698703promoter 内 690-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 3702000-3704368(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATGGAGACGTGGCC
SmilChr07G001157 Chr07 NC_080393.1:8673911-8673925promoter 内 195-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 8668484-8670119(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCTCTAAC
SmilChr05G003320 Chr05 NC_080391.1:43492991-43493005promoter 内 3768-3782 bp - 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 43491793-43492772(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr08G004850 Chr08 NC_080394.1:57721327-57721341promoter 内 3654-3668 bp + 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 57721674-57723930(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr07G001017 Chr07 NC_080393.1:7385610-7385624promoter 内 3433-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 7386178-7389248(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr02G001684 Chr02 NC_080388.1:31074165-31074179promoter 内 2896-2910 bp - 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 31070324-31073074(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr07G000923 Chr07 NC_080393.1:6587477-6587491promoter 内 2293-2307 bp - 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 6582310-6585783(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr01G000996 Chr01 NC_080387.1:21004727-21004741promoter 内 2122-2136 bp - 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 4 21001451-21002862(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr02G002228 Chr02 NC_080388.1:39631037-39631051promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 39625323-39631003(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTCT
SmilChr08G004482 Chr08 NC_080394.1:54433496-54433510promoter 内 3903-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 54433594-54436689(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAAGGACACGTGTCG
SmilChr01G004984 Chr01 NC_080387.1:67890023-67890037promoter 内 3896-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 67888541-67889932(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTTC
SmilChr03G001629 Chr03 NC_080389.1:20992058-20992072promoter 内 3797-3811 bp - 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 20992262-20994544(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTTC
SmilChr03G001630 Chr03 NC_080389.1:20997690-20997704promoter 内 3797-3811 bp + 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 20995491-20997500(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTTC
SmilChr05G001846 Chr05 NC_080391.1:18489271-18489285promoter 内 3765-3779 bp - 222 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 18486971-18489049(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr02G004446 Chr02 NC_080388.1:66812581-66812595promoter 内 2763-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 66813819-66814358(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCCTC
SmilChr08G002227 Chr08 NC_080394.1:20332528-20332542promoter 内 2273-2287 bp - 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 20334256-20336754(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTCT
SmilChr01G004983 Chr01 NC_080387.1:67890023-67890037promoter 内 2067-2081 bp + 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 67882168-67888103(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTCCTTC
SmilChr07G002045 Chr07 NC_080393.1:18556539-18556553promoter 内 1929-1943 bp - 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 18545370-18554481(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr08G004849 Chr08 NC_080394.1:57720504-57720518promoter 内 797-811 bp - 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 57714611-57717314(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr08G002459 Chr08 NC_080394.1:23407533-23407547promoter 内 602-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 23410932-23411907(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr07G000774 Chr07 NC_080393.1:5421247-5421261promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 5421364-5422583(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCGTCA
SmilChr06G002516 Chr06 NC_080392.1:36058297-36058311promoter 内 3875-3889 bp - 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 36058423-36063499(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCACCGTT
SmilChr04G002101 Chr04 NC_080390.1:33900204-33900218promoter 内 3828-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 33895820-33900045(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGATGACGTGGCA
SmilChr04G001099 Chr04 NC_080390.1:15752682-15752696promoter 内 3709-3723 bp + 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 15752974-15757619(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATGAGACACGTGGCA
SmilChr02G002642 Chr02 NC_080388.1:45829011-45829025promoter 内 3661-3675 bp - 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 45826543-45828685(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGTGATGACGTGGCG
SmilChr02G003617 Chr02 NC_080388.1:57445489-57445503promoter 内 3643-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 57441488-57445145(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAATG
SmilChr03G003460 Chr03 NC_080389.1:52978414-52978428promoter 内 3304-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 52979111-52984837(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCAGT
SmilChr08G004200 Chr08 NC_080394.1:51380395-51380409promoter 内 3162-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 51376938-51379570(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCAGCAGT
SmilChr06G000630 Chr06 NC_080392.1:5576102-5576116promoter 内 3105-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 5576998-5577070(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGCCCA
SmilChr07G002757 Chr07 NC_080393.1:27388270-27388284promoter 内 2452-2466 bp + 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 27385203-27386735(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAATG
SmilChr08G000850 Chr08 NC_080394.1:6301420-6301434promoter 内 2122-2136 bp - 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 6303299-6305462(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGTCAATG
SmilChr08G004817 Chr08 NC_080394.1:57458219-57458233promoter 内 1825-1839 bp - 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 57448270-57456057(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATGAACACGTGGCG
SmilChr08G001619 Chr08 NC_080394.1:13412312-13412326promoter 内 1676-1690 bp + 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 13414637-13416081(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CATTGACACGTGGCA
SmilChr06G000631 Chr06 NC_080392.1:5576102-5576116promoter 内 1549-1563 bp - 2438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 5578554-5578892(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGGCCCA
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