转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 18 / 128 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002381 Chr02 NC_080388.1:41718294-41718305promoter 内 3950-3961 bp - 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 41718345-41719333(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr02G002527 Chr02 NC_080388.1:43974670-43974681promoter 内 3053-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 43975618-43981979(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr02G001797 Chr02 NC_080388.1:32759290-32759301promoter 内 2994-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 32760297-32763479(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGGA
SmilChr02G001476 Chr02 NC_080388.1:27621778-27621789promoter 内 2621-2632 bp - 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 27618339-27620409(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGGA
SmilChr02G001430 Chr02 NC_080388.1:27009524-27009535promoter 内 1098-1109 bp - 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 27005555-27006632(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGGA
SmilChr02G003471 Chr02 NC_080388.1:56014100-56014111promoter 内 685-696 bp - 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 56017416-56023072(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr01G005142 Chr01 NC_080387.1:69210031-69210042promoter 内 3095-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 69199702-69209136(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GACTCTGTTTTT
SmilChr01G004870 Chr01 NC_080387.1:66829058-66829069promoter 内 1876-1887 bp + 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 66825406-66826944(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GACTCTGTTTTT
SmilChr02G003787 Chr02 NC_080388.1:59528423-59528434promoter 内 1474-1485 bp + 2516 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 59522829-59525907(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr02G003629 Chr02 NC_080388.1:57625869-57625880promoter 内 1470-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 57622191-57623349(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr02G001434 Chr02 NC_080388.1:27035721-27035732promoter 内 1455-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 27038267-27040377(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTCTT
SmilChr02G003789 Chr02 NC_080388.1:59528423-59528434promoter 内 917-928 bp + 3073 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 59531507-59532062(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGGA
SmilChr01G005156 Chr01 NC_080387.1:69336289-69336300promoter 内 261-272 bp - 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 69327137-69332560(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGTC
SmilChr01G001214 Chr01 NC_080387.1:24376861-24376872promoter 内 61-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 24368871-24372932(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGGA
SmilChr01G004321 Chr01 NC_080387.1:61372604-61372615promoter 内 265-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 5 61376340-61390721(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGCG
SmilChr01G005040 Chr01 NC_080387.1:68341505-68341516promoter 内 2366-2377 bp + 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 68336672-68339881(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCCG
SmilChr01G002505 Chr01 NC_080387.1:42930257-42930268promoter 内 1219-1230 bp + 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 42933039-42935159(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGCA
SmilChr02G004916 Chr02 NC_080388.1:71178923-71178934promoter 内 670-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 71182254-71185423(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGCA
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71455142-71455153promoter 内 491-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 71458652-71461641(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTTTG
SmilChr02G002831 Chr02 NC_080388.1:48441313-48441324promoter 内 2808-2819 bp + 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 48438113-48440131(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCCG
SmilChr02G005000 Chr02 NC_080388.1:71812566-71812577promoter 内 2365-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 71814202-71816017(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCCG
SmilChr01G005359 Chr01 NC_080387.1:70814346-70814357promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 70809376-70810935(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTTTG
SmilChr02G003837 Chr02 NC_080388.1:60068550-60068561promoter 内 353-364 bp + 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 60064419-60064913(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTTTTG
SmilChr03G001845 Chr03 NC_080389.1:25347561-25347572promoter 内 2993-3004 bp - 997 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 8 25348569-25351888(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr01G000663 Chr01 NC_080387.1:14777637-14777648promoter 内 2555-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 7 14773813-14776202(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr01G000664 Chr01 NC_080387.1:14777831-14777842promoter 内 1972-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 7 14779860-14782457(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr02G003868 Chr02 NC_080388.1:60688534-60688545promoter 内 1403-1414 bp - 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 7 60691132-60696390(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr02G001879 Chr02 NC_080388.1:34099707-34099718promoter 内 641-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 7 34103067-34110484(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr02G002339 Chr02 NC_080388.1:41100439-41100450promoter 内 1570-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 41092098-41098019(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGAAGCAGAGCA
SmilChr02G001054 Chr02 NC_080388.1:18814942-18814953promoter 内 1142-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 18817801-18819608(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr03G000420 Chr03 NC_080389.1:4570071-4570082promoter 内 2224-2235 bp - 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 4567390-4568305(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr02G001307 Chr02 NC_080388.1:24316793-24316804promoter 内 2156-2167 bp - 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 24318638-24321474(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr03G000606 Chr03 NC_080389.1:6695519-6695530promoter 内 2132-2143 bp - 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 6692792-6693661(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr01G000582 Chr01 NC_080387.1:12592554-12592565promoter 内 1992-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 12588195-12590556(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr01G002685 Chr01 NC_080387.1:45053759-45053770promoter 内 725-736 bp - 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 45057035-45058846(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr02G001915 Chr02 NC_080388.1:34484501-34484512promoter 内 417-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 34473512-34480928(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr01G003307 Chr01 NC_080387.1:51763070-51763081promoter 内 3889-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 51763182-51768870(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGA
SmilChr01G002920 Chr01 NC_080387.1:47974736-47974747promoter 内 2107-2118 bp + 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 47970777-47972853(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTCT
SmilChr03G000599 Chr03 NC_080389.1:6653087-6653098promoter 内 1987-1998 bp - 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 6647610-6651084(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr03G000173 Chr03 NC_080389.1:1897116-1897127promoter 内 1161-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 1899956-1900505(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr02G001359 Chr02 NC_080388.1:25417085-25417096promoter 内 3319-3330 bp + 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 25413893-25416414(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCCC
SmilChr02G003576 Chr02 NC_080388.1:56935655-56935666promoter 内 2930-2941 bp - 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 56936726-56938115(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTA
SmilChr02G004979 Chr02 NC_080388.1:71665805-71665816promoter 内 2373-2384 bp - 1617 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 71667433-71676247(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCA
SmilChr02G001021 Chr02 NC_080388.1:18039047-18039058promoter 内 2324-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 18031757-18037381(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGT
SmilChr02G000711 Chr02 NC_080388.1:11455796-11455807promoter 内 2025-2036 bp + 1965 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 11457772-11472778(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGGC
SmilChr01G004568 Chr01 NC_080387.1:63740989-63741000promoter 内 1360-1371 bp - 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 63735680-63738359(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGGC
SmilChr02G003356 Chr02 NC_080388.1:54721533-54721544promoter 内 1275-1286 bp + 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 54724259-54726747(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCA
SmilChr01G001699 Chr01 NC_080387.1:31330472-31330483promoter 内 949-960 bp - 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 31333524-31337181(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCA
SmilChr01G002158 Chr01 NC_080387.1:37589541-37589552promoter 内 551-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 37592991-37593703(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAAACAGAGGC
SmilChr02G001497 Chr02 NC_080388.1:27907324-27907335promoter 内 168-179 bp + 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 27902189-27903502(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCA