转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 18 / 134 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000911 Chr01 NC_080387.1:19231910-19231922promoter 内 2997-3009 bp - 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 19229491-19230918(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTGAGGATAAGC
SmilChr03G001465 Chr03 NC_080389.1:17523050-17523062promoter 内 2848-2860 bp + 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 17524203-17528286(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTAGATAAGG
SmilChr02G003732 Chr02 NC_080388.1:58964703-58964715promoter 内 2277-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 58960737-58962991(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTCTGGATAAGG
SmilChr01G001657 Chr01 NC_080387.1:30637871-30637883promoter 内 2038-2050 bp - 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 30639834-30641550(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCTATT
SmilChr01G001281 Chr01 NC_080387.1:25594659-25594671promoter 内 1879-1891 bp + 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 25596781-25598648(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTAAGGATAAGA
SmilChr02G004580 Chr02 NC_080388.1:68299797-68299809promoter 内 1480-1492 bp - 2509 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 68296764-68297288(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTGAGGATAAGA
SmilChr02G002476 Chr02 NC_080388.1:43135468-43135480promoter 内 1325-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 43122815-43132804(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTGAGGATAAGA
SmilChr01G001907 Chr01 NC_080387.1:34150738-34150750promoter 内 797-809 bp - 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 34153942-34154646(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGAAAA
SmilChr01G005422 Chr01 NC_080387.1:71417186-71417198promoter 内 603-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 71407830-71413800(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATAAGGATAAGA
SmilChr02G001027 Chr02 NC_080388.1:18194586-18194598promoter 内 498-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 18190439-18191095(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAATGGATAAGA
SmilChr01G002918 Chr01 NC_080387.1:47908370-47908382promoter 内 343-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 47901901-47904724(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTGTTA
SmilChr02G002100 Chr02 NC_080388.1:37678348-37678360promoter 内 315-327 bp + 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 37670534-37674674(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCACTAC
SmilChr03G000927 Chr03 NC_080389.1:10606822-10606834promoter 内 248-260 bp - 3741 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10610575-10612075(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCTTAC
SmilChr01G003558 Chr01 NC_080387.1:54195919-54195931promoter 内 3865-3877 bp - 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 54196055-54198940(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTCT
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17462111-17462123promoter 内 3511-3523 bp + 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTAGTAGATAAGG
SmilChr01G000734 Chr01 NC_080387.1:16300270-16300282promoter 内 3408-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16299172-16299689(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAATAAGATAAGG
SmilChr03G002348 Chr03 NC_080389.1:37095834-37095846promoter 内 3328-3340 bp + 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 37096507-37097205(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTGAGGATAAGA
SmilChr02G002706 Chr02 NC_080388.1:46912117-46912129promoter 内 3030-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 46906815-46911158(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGAAAA
SmilChr03G002490 Chr03 NC_080389.1:39584088-39584100promoter 内 2841-2853 bp - 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 39585248-39588954(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTCACT
SmilChr01G000995 Chr01 NC_080387.1:20994513-20994525promoter 内 2440-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 20996074-20996887(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCAAA
SmilChr02G004673 Chr02 NC_080388.1:69097852-69097864promoter 内 1891-1903 bp - 2098 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 69091695-69095754(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTACGGATAAGG
SmilChr02G001014 Chr02 NC_080388.1:17884686-17884698promoter 内 1694-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 17886993-17888133(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAATGGATAAGA
SmilChr01G001677 Chr01 NC_080387.1:30966225-30966237promoter 内 1642-1654 bp + 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 30962534-30963878(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCATTGC
SmilChr01G002072 Chr01 NC_080387.1:36625966-36625978promoter 内 1382-1394 bp - 2607 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 36628585-36629689(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCACTGT
SmilChr01G005562 Chr01 NC_080387.1:72433809-72433821promoter 内 1213-1225 bp - 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 72428708-72431033(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCAATGGATAAGG
SmilChr02G005106 Chr02 NC_080388.1:72583217-72583229promoter 内 1068-1080 bp - 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 72586150-72586944(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCAAA
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43759179-43759191promoter 内 790-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTTA
SmilChr03G001293 Chr03 NC_080389.1:15130757-15130769promoter 内 782-794 bp - 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 15127478-15127550(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAATGGATAAGA
SmilChr01G004388 Chr01 NC_080387.1:62057425-62057437promoter 内 698-710 bp - 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 62048214-62054134(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAATGGATAAGA
SmilChr01G003559 Chr01 NC_080387.1:54195919-54195931promoter 内 318-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 54199602-54203213(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACTCT
SmilChr01G006141 Chr01 NC_080387.1:76919894-76919906promoter 内 78-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 76913729-76915983(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTCGGATAAGG
SmilChr01G006131 Chr01 NC_080387.1:76824710-76824722promoter 内 72-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 76828639-76833459(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTCGGATAAGG
SmilChr03G000090 Chr03 NC_080389.1:1033617-1033629promoter 内 2228-2240 bp + 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 5 1018269-1031856(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTT
SmilChr02G003367 Chr02 NC_080388.1:54796128-54796140promoter 内 3615-3627 bp - 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 54788150-54795754(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTAGGATAAGA
SmilChr03G000092 Chr03 NC_080389.1:1033617-1033629promoter 内 2097-2109 bp + 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 1029068-1031725(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTT
SmilChr02G000876 Chr02 NC_080388.1:15083578-15083590promoter 内 1789-1801 bp - 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 15080626-15081378(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTAGGATAAGA
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73068351-73068363promoter 内 158-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 73062182-73064520(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTAATT
SmilChr02G003859 Chr02 NC_080388.1:60394192-60394204promoter 内 3862-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 60390848-60394065(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTATT
SmilChr01G003661 Chr01 NC_080387.1:55033080-55033092promoter 内 3563-3575 bp - 426 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 55031026-55032654(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTAAAAGATAAGG
SmilChr01G000952 Chr01 NC_080387.1:20160550-20160562promoter 内 2947-2959 bp + 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 20146003-20159508(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCACATA
SmilChr02G001017 Chr02 NC_080388.1:17941369-17941381promoter 内 2905-2917 bp - 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 17939512-17940285(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGAGCGGATAAGG
SmilChr03G000236 Chr03 NC_080389.1:2821921-2821933promoter 内 2700-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 2819595-2820632(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTT
SmilChr01G000444 Chr01 NC_080387.1:9020244-9020256promoter 内 2480-2492 bp - 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 9018391-9018735(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTGTGGATAAGA
SmilChr02G001755 Chr02 NC_080388.1:32299591-32299603promoter 内 1915-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 32294007-32297517(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTATTTT
SmilChr01G005000 Chr01 NC_080387.1:68047039-68047051promoter 内 1546-1558 bp - 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 68049494-68051092(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTAATT
SmilChr03G000340 Chr03 NC_080389.1:3870096-3870108promoter 内 1173-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 3859136-3867280(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTT
SmilChr03G000162 Chr03 NC_080389.1:1781819-1781831promoter 内 833-845 bp - 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 1784987-1786606(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAATTT
SmilChr03G001694 Chr03 NC_080389.1:22455157-22455169promoter 内 655-667 bp - 3334 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 22458503-22458609(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACACG
SmilChr02G001946 Chr02 NC_080388.1:35082821-35082833promoter 内 3710-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 35080855-35082542(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTAAAAGATAAGG
SmilChr01G000847 Chr01 NC_080387.1:18314241-18314253promoter 内 3691-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 18314551-18321642(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTAC