转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 19 / 144 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002680 Chr03 NC_080389.1:42588798-42588810promoter 内 621-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 42592178-42593079(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTTT
SmilChr04G001144 Chr04 NC_080390.1:16857560-16857572promoter 内 596-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 4 16860965-16865244(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGAGTTGACTTTA
SmilChr01G002965 Chr01 NC_080387.1:48533282-48533294promoter 内 2464-2476 bp - 1525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 48524866-48531757(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAAAGCC
SmilChr04G002495 Chr04 NC_080390.1:39845293-39845305promoter 内 200-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 39849094-39851883(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTCGTTGACCTAG
SmilChr01G005296 Chr01 NC_080387.1:70273483-70273495promoter 内 3086-3098 bp + 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70274398-70275173(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGAGGTCAACGGG
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70157740-70157752promoter 内 3033-3045 bp + 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70158708-70159433(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGAGGTCAACGGG
SmilChr01G004352 Chr01 NC_080387.1:61721265-61721277promoter 内 2756-2768 bp - 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 61717133-61720032(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACCAA
SmilChr01G002694 Chr01 NC_080387.1:45195190-45195202promoter 内 2734-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 45196457-45199085(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTT
SmilChr02G004228 Chr02 NC_080388.1:64491232-64491244promoter 内 2572-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 64489743-64489815(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTT
SmilChr02G001811 Chr02 NC_080388.1:32932239-32932251promoter 内 2473-2485 bp + 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 32925959-32930723(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTT
SmilChr01G006003 Chr01 NC_080387.1:75606747-75606759promoter 内 1900-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 75601814-75604658(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCAAGTCAACGCA
SmilChr01G002161 Chr01 NC_080387.1:37612657-37612669promoter 内 1437-1449 bp - 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 37615221-37618203(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGCGTTGACCTAT
SmilChr01G005273 Chr01 NC_080387.1:70157740-70157752promoter 内 990-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 70160751-70163867(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGAGGTCAACGGG
SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35821221-35821233promoter 内 3985-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 35819285-35821217(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAGGTCAACGGC
SmilChr01G005993 Chr01 NC_080387.1:75535193-75535205promoter 内 3926-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75533859-75535130(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACCTGT
SmilChr04G000906 Chr04 NC_080390.1:11791813-11791825promoter 内 3859-3871 bp - 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 11789200-11791683(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAAAGCC
SmilChr02G002544 Chr02 NC_080388.1:44296424-44296436promoter 内 3853-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 44294146-44296288(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAAAGCC
SmilChr04G002712 Chr04 NC_080390.1:42723946-42723958promoter 内 3848-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 42724099-42726921(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACCAA
SmilChr03G004077 Chr03 NC_080389.1:59706618-59706630promoter 内 3700-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 59705038-59706329(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GATAGTCAACGTT
SmilChr03G003177 Chr03 NC_080389.1:49232762-49232774promoter 内 3457-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49233306-49238855(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACACA
SmilChr01G002520 Chr01 NC_080387.1:43155146-43155158promoter 内 3217-3229 bp + 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43155930-43159761(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACCAA
SmilChr01G003721 Chr01 NC_080387.1:55533056-55533068promoter 内 2811-2823 bp + 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55534246-55537248(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GATAGTCAACGAG
SmilChr02G001365 Chr02 NC_080388.1:25721583-25721595promoter 内 2384-2396 bp - 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 25723200-25723790(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGCTTTGACTTTG
SmilChr03G003812 Chr03 NC_080389.1:57167414-57167426promoter 内 2164-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57162719-57165589(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GATAGTCAACGTT
SmilChr01G002205 Chr01 NC_080387.1:38371963-38371975promoter 内 1610-1622 bp - 2379 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 38374354-38376882(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AACGTTGACTATC
SmilChr01G001834 Chr01 NC_080387.1:33278774-33278786promoter 内 1597-1609 bp - 2392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33281178-33283356(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTT
SmilChr01G005994 Chr01 NC_080387.1:75535193-75535205promoter 内 1552-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 75537642-75537748(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACAGGTCAACGCG
SmilChr01G003531 Chr01 NC_080387.1:53936181-53936193promoter 内 1516-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53931251-53933708(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCAAGTCAACGTG
SmilChr02G004227 Chr02 NC_080388.1:64491232-64491244promoter 内 1455-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64488626-64488698(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTT
SmilChr02G001266 Chr02 NC_080388.1:23223997-23224009promoter 内 1321-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 23218539-23221329(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAACAAC
SmilChr01G001651 Chr01 NC_080387.1:30574756-30574768promoter 内 864-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30577893-30583645(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACACA
SmilChr02G000565 Chr02 NC_080388.1:7959293-7959305promoter 内 791-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 7962503-7964742(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTTT
SmilChr01G003016 Chr01 NC_080387.1:49184869-49184881promoter 内 575-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49188295-49190988(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TTGGTTGACTTTT
SmilChr01G001831 Chr01 NC_080387.1:33278774-33278786promoter 内 420-432 bp - 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33268420-33275205(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACACA
SmilChr01G004731 Chr01 NC_080387.1:65489101-65489113promoter 内 356-368 bp - 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 65492746-65494127(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTTTT
SmilChr01G003129 Chr01 NC_080387.1:50124642-50124654promoter 内 332-344 bp - 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50118234-50120985(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACACA
SmilChr01G003744 Chr01 NC_080387.1:55770327-55770339promoter 内 315-327 bp - 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 55759079-55766653(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TCAAGTCAACGCA
SmilChr01G005297 Chr01 NC_080387.1:70273483-70273495promoter 内 295-307 bp + 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 70277189-70277889(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGAGGTCAACGGG
SmilChr02G000493 Chr02 NC_080388.1:6747776-6747788promoter 内 625-637 bp + 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 5 6751152-6755117(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAAAGGC
SmilChr01G000483 Chr01 NC_080387.1:9895445-9895457promoter 内 1098-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 4 9898348-9899628(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGTGTTGACTTTG
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SmilChr02G003070 Chr02 NC_080388.1:51558260-51558272promoter 内 2838-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 51559423-51561003(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAGGTCAACGAA
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SmilChr03G002078 Chr03 NC_080389.1:31897058-31897070promoter 内 3565-3577 bp + 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 31897494-31903418(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAACACA
SmilChr04G001050 Chr04 NC_080390.1:14969336-14969348promoter 内 3511-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 14969826-14970193(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TACGTTGACTTGG
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SmilChr03G002313 Chr03 NC_080389.1:36387125-36387137promoter 内 3052-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 36383127-36386188(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAGTTGACTTTG