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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G003267; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018221-RA_Salv SmilChr08G003267 MYB XP_057779249.1 MP00406 AAAAAATTAGGTAAA

可能结合的靶基因

9917 个结合位点 7839 个候选靶基因 第 19 / 157 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001337 Chr03 NC_080389.1:15608846-15608860promoter 内 3667-3681 bp + 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 15609180-15610408(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TAATAATTAGGTAAT
SmilChr02G001417 Chr02 NC_080388.1:26803500-26803514promoter 内 3519-3533 bp - 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 26799343-26803032(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATAAATTAGGTGAA
SmilChr05G000758 Chr05 NC_080391.1:5868300-5868314promoter 内 1735-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 5870566-5871524(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAATAATTAGGTATT
SmilChr04G000152 Chr04 NC_080390.1:1331216-1331230promoter 内 1193-1207 bp - 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 1327590-1328422(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCTAAATTAGGTAGG
SmilChr03G000572 Chr03 NC_080389.1:6235103-6235117promoter 内 904-918 bp - 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 6229919-6232020(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GATTAATTAGGTACA
SmilChr03G004331 Chr03 NC_080389.1:61665848-61665862promoter 内 714-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 61669135-61676778(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAAAATTAGGTCCC
SmilChr04G002242 Chr04 NC_080390.1:36206833-36206847promoter 内 428-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 36210406-36218365(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTATCT
SmilChr04G002195 Chr04 NC_080390.1:35515866-35515880promoter 内 46-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 35509471-35511925(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CAAAAATTAGGTCAT
SmilChr04G002762 Chr04 NC_080390.1:43369893-43369907promoter 内 3920-3934 bp - 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 43368473-43369826(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 GAATTATTAGGTAGA
SmilChr04G002529 Chr04 NC_080390.1:40364016-40364030promoter 内 3880-3894 bp - 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40362913-40363909(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATGAAATTAGGTAAT
SmilChr04G002414 Chr04 NC_080390.1:38755715-38755729promoter 内 3641-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 38756075-38759860(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACAAAATTAGGTGAA
SmilChr03G003893 Chr03 NC_080389.1:58016143-58016157promoter 内 3324-3338 bp + 663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 58016820-58018212(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ACAATATTAGGTATG
SmilChr01G000511 Chr01 NC_080387.1:10400003-10400017promoter 内 3003-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 10401001-10401339(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCATAATTAGGTAGG
SmilChr04G002728 Chr04 NC_080390.1:42890953-42890967promoter 内 2883-2897 bp - 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 42885677-42889849(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATTAGTTAGGTAAA
SmilChr04G002528 Chr04 NC_080390.1:40364016-40364030promoter 内 2865-2879 bp - 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40362097-40362894(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATGAAATTAGGTAAT
SmilChr03G001294 Chr03 NC_080389.1:15150307-15150321promoter 内 2823-2837 bp + 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 15132815-15149143(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGTACCTAACTTCCA
SmilChr04G000524 Chr04 NC_080390.1:5761440-5761454promoter 内 2530-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 5756241-5759983(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGGACCTAATTTTCC
SmilChr03G002079 Chr03 NC_080389.1:31910358-31910372promoter 内 2426-2440 bp - 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 31911933-31916492(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTTACCTAACTATGA
SmilChr04G001838 Chr04 NC_080390.1:29922348-29922362promoter 内 2425-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 29923924-29926040(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CACAAATTAGGTATA
SmilChr03G002990 Chr03 NC_080389.1:46719197-46719211promoter 内 2402-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 46720796-46721795(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AGATAATTAGGTAAT
SmilChr02G004273 Chr02 NC_080388.1:64939871-64939885promoter 内 2400-2414 bp - 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 64941472-64943380(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCCACCTAATTTTTA
SmilChr05G001371 Chr05 NC_080391.1:12225173-12225187promoter 内 2165-2179 bp - 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 12227009-12229997(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TCTACCTAACTATGG
SmilChr04G000163 Chr04 NC_080390.1:1470386-1470400promoter 内 2079-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1463504-1468478(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTTGT
SmilChr01G001442 Chr01 NC_080387.1:28111395-28111409promoter 内 1588-1602 bp + 2399 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 28102489-28108996(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTATTA
SmilChr04G000153 Chr04 NC_080390.1:1331216-1331230promoter 内 1374-1388 bp - 2613 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 1333843-1339955(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCTACCTAATTTAGA
SmilChr04G002530 Chr04 NC_080390.1:40364016-40364030promoter 内 1329-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40366688-40368533(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 ATTACCTAATTTCAT
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SmilChr01G001481 Chr01 NC_080387.1:28586842-28586856promoter 内 848-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 28589995-28591016(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTTGT
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SmilChr04G001157 Chr04 NC_080390.1:17111241-17111255promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 17115019-17115125(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TGAAAATTAGGTATT
SmilChr04G001894 Chr04 NC_080390.1:30915001-30915015promoter 内 3112-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 30915890-30924549(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATTAATTAGGTAAC
SmilChr03G001446 Chr03 NC_080389.1:17260892-17260906promoter 内 3870-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 17257797-17260775(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTCTC
SmilChr03G001447 Chr03 NC_080389.1:17265390-17265404promoter 内 3870-3884 bp + 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 17262296-17265273(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTCTC
SmilChr03G003876 Chr03 NC_080389.1:57877771-57877785promoter 内 3717-3731 bp + 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57873352-57877501(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CTCACCTAATTTATT
SmilChr02G002344 Chr02 NC_080388.1:41180120-41180134promoter 内 3678-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 41180443-41183329(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TATACCTAATTATCA
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SmilChr05G003161 Chr05 NC_080391.1:40383627-40383641promoter 内 2593-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 40385035-40386378(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 TTCACCTAATTTCTC
SmilChr01G001464 Chr01 NC_080387.1:28442282-28442296promoter 内 2327-2341 bp - 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 28438186-28440622(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCATAGTTAGGTAGG
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SmilChr05G000838 Chr05 NC_080391.1:6612452-6612466promoter 内 1524-1538 bp + 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 6614929-6633581(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AAAATATTAGGTATT
SmilChr05G003314 Chr05 NC_080391.1:43394208-43394222promoter 内 1423-1437 bp - 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 43390751-43391644(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCATAGTTAGGTAGG
SmilChr03G003877 Chr03 NC_080389.1:57877771-57877785promoter 内 756-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 57881016-57883408(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 AATAAATTAGGTGAG
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SmilChr03G002331 Chr03 NC_080389.1:36775145-36775159promoter 内 646-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 36770655-36771804(-) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCTACCTAACTATGG
SmilChr04G001332 Chr04 NC_080390.1:21514081-21514095promoter 内 242-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 21517840-21523385(+) SMil_00018221-RA_Salv MP00406 CCATAGTTAGGTAGG