转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 2 / 134 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003159 Chr01 NC_080387.1:50424368-50424382promoter 内 291-305 bp - 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 50417757-50420672(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGGTGATGATTAC
SmilChr03G001143 Chr03 NC_080389.1:13184835-13184849promoter 内 3860-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 13184976-13186188(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATAGTAATGATGAG
SmilChr01G004604 Chr01 NC_080387.1:64024084-64024098promoter 内 3403-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 64020290-64023500(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTGTAATGATGAT
SmilChr02G000882 Chr02 NC_080388.1:15218342-15218356promoter 内 437-451 bp + 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 15213888-15214792(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACAATT
SmilChr01G003162 Chr01 NC_080387.1:50424368-50424382promoter 内 171-185 bp - 3816 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 50428198-50431024(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCACCTTT
SmilChr02G003771 Chr02 NC_080388.1:59402744-59402758promoter 内 1742-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 59398874-59400499(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATGTAATGATTAT
SmilChr01G003051 Chr01 NC_080387.1:49463767-49463781promoter 内 1011-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 49466757-49476130(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATATAATGATGAC
SmilChr02G004401 Chr02 NC_080388.1:66351343-66351357promoter 内 2982-2996 bp + 1005 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 66348931-66350338(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATTATT
SmilChr01G004635 Chr01 NC_080387.1:64372654-64372668promoter 内 2278-2292 bp - 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 64374377-64376174(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTACTTTT
SmilChr01G002248 Chr01 NC_080387.1:39092762-39092776promoter 内 593-607 bp - 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 39096170-39098340(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATTATT
SmilChr02G005207 Chr02 NC_080388.1:73301781-73301795promoter 内 463-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 73305319-73307739(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATATTC
SmilChr01G003855 Chr01 NC_080387.1:56819943-56819957promoter 内 3507-3521 bp + 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 56820437-56822342(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATCGTAATGATGAT
SmilChr03G001981 Chr03 NC_080389.1:28956547-28956561promoter 内 2946-2960 bp + 1041 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 28953228-28955506(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTACATTG
SmilChr02G003021 Chr02 NC_080388.1:50896639-50896653promoter 内 2770-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 50897870-50901111(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACGATC
SmilChr02G003164 Chr02 NC_080388.1:52679388-52679402promoter 内 2811-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 52675067-52678212(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACGATC
SmilChr01G001650 Chr01 NC_080387.1:30559066-30559080promoter 内 3979-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 4 30553005-30559058(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATAATC
SmilChr03G003012 Chr03 NC_080389.1:47018797-47018811promoter 内 1583-1597 bp + 2404 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 3 47021215-47022940(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATAATAATGATTAC
SmilChr02G004237 Chr02 NC_080388.1:64552700-64552714promoter 内 3925-3939 bp + 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 64552776-64556602(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAGGTAATGATGAT
SmilChr03G003102 Chr03 NC_080389.1:48104041-48104055promoter 内 3713-3727 bp + 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 48101971-48103767(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACCATT
SmilChr03G001275 Chr03 NC_080389.1:14892237-14892251promoter 内 3537-3551 bp + 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 14892701-14894798(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATAATAATGATTAC
SmilChr03G000026 Chr03 NC_080389.1:368489-368503promoter 内 2251-2265 bp - 1736 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 370239-372416(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATCTCC
SmilChr02G000249 Chr02 NC_080388.1:3219736-3219750promoter 内 1096-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 3211379-3216845(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTGTAATGATTAT
SmilChr03G002282 Chr03 NC_080389.1:36016887-36016901promoter 内 846-860 bp - 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 36013189-36013746(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGATAATGATGAC
SmilChr02G002694 Chr02 NC_080388.1:46673197-46673211promoter 内 3605-3619 bp + 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 46673593-46680047(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAACATAATGATGAC
SmilChr03G002654 Chr03 NC_080389.1:42203151-42203165promoter 内 2773-2787 bp - 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 42190409-42201937(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATTGTAATGATTAT
SmilChr01G002014 Chr01 NC_080387.1:35693999-35694013promoter 内 853-867 bp - 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 35689427-35690865(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATGATTAA
SmilChr01G002501 Chr01 NC_080387.1:42849446-42849460promoter 内 2179-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 42844910-42847638(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTACAATG
SmilChr03G002887 Chr03 NC_080389.1:45523350-45523364promoter 内 3964-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 5 45520383-45523327(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTACAAAT
SmilChr02G004156 Chr02 NC_080388.1:63883153-63883167promoter 内 3231-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 63883923-63886493(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAACGTAATGATTAT
SmilChr01G005840 Chr01 NC_080387.1:74411682-74411696promoter 内 2397-2411 bp + 1590 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 74405949-74410092(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATGTTT
SmilChr02G000002 Chr02 NC_080388.1:23319-23333promoter 内 1845-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 18658-21177(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACAATC
SmilChr03G002698 Chr03 NC_080389.1:42958290-42958304promoter 内 1300-1314 bp - 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 42955507-42955603(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGCTAATGATGAC
SmilChr03G002697 Chr03 NC_080389.1:42958290-42958304promoter 内 1057-1071 bp - 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 42955283-42955360(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGCTAATGATGAC
SmilChr01G004893 Chr01 NC_080387.1:66990665-66990679promoter 内 721-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 66986539-66987399(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTACCCTC
SmilChr03G003055 Chr03 NC_080389.1:47449011-47449025promoter 内 480-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 47452532-47455079(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATCTCT
SmilChr01G005841 Chr01 NC_080387.1:74411682-74411696promoter 内 301-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 74406422-74407996(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATGTTT
SmilChr02G000003 Chr02 NC_080388.1:23319-23333promoter 内 3013-3027 bp + 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 21172-22345(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACAATC
SmilChr02G000493 Chr02 NC_080388.1:6750159-6750173promoter 内 3008-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 6751152-6755117(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACAATC
SmilChr03G002336 Chr03 NC_080389.1:36846392-36846406promoter 内 1240-1254 bp + 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 36842803-36843645(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACGTTT
SmilChr01G004958 Chr01 NC_080387.1:67675114-67675128promoter 内 545-559 bp - 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 67678570-67681247(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTACAATT
SmilChr02G004073 Chr02 NC_080388.1:63014153-63014167promoter 内 1801-1815 bp + 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 63016353-63020836(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGGTAATGATGAG
SmilChr02G002453 Chr02 NC_080388.1:42803862-42803876promoter 内 1451-1465 bp - 2536 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 42806412-42807480(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTATGTTC
SmilChr01G001164 Chr01 NC_080387.1:23641935-23641949promoter 内 982-996 bp + 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 23637805-23638930(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTACCTCC
SmilChr02G003870 Chr02 NC_080388.1:60706971-60706985promoter 内 747-761 bp - 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 60710225-60712683(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTACCACT
SmilChr01G002610 Chr01 NC_080387.1:44335675-44335689promoter 内 714-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 44330640-44332402(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACCCTT
SmilChr03G000070 Chr03 NC_080389.1:829752-829766promoter 内 3794-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 828588-829559(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTACCCTT
SmilChr01G005083 Chr01 NC_080387.1:68709267-68709281promoter 内 3561-3575 bp - 426 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 68709707-68710950(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACATTT
SmilChr01G001796 Chr01 NC_080387.1:32823714-32823728promoter 内 2868-2882 bp + 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 32824847-32825280(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGATAATGATGAT
SmilChr01G004725 Chr01 NC_080387.1:65429065-65429079promoter 内 905-919 bp + 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 65432161-65434293(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAAGTAATGATGAT
SmilChr01G004197 Chr01 NC_080387.1:60431673-60431687promoter 内 592-606 bp + 3395 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 60435082-60442917(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAAGTAATGATTAT