转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 20 / 128 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005002 Chr02 NC_080388.1:71819766-71819777promoter 内 2638-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 71821129-71821929(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTTT
SmilChr03G001377 Chr03 NC_080389.1:16301055-16301066promoter 内 2477-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 16302579-16304191(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGA
SmilChr02G000321 Chr02 NC_080388.1:4036664-4036675promoter 内 2433-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 4038232-4039837(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGT
SmilChr03G000125 Chr03 NC_080389.1:1377110-1377121promoter 内 2352-2363 bp + 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1374491-1375472(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTA
SmilChr01G006117 Chr01 NC_080387.1:76700127-76700138promoter 内 2263-2274 bp + 1727 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 76701865-76702674(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGA
SmilChr03G001138 Chr03 NC_080389.1:13097514-13097525promoter 内 1978-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 13099537-13103091(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGA
SmilChr01G001475 Chr01 NC_080387.1:28533835-28533846promoter 内 1777-1788 bp + 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 28536059-28538387(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGA
SmilChr01G001428 Chr01 NC_080387.1:27919024-27919035promoter 内 1560-1571 bp - 2430 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 27921465-27924019(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTTT
SmilChr01G002443 Chr01 NC_080387.1:42007522-42007533promoter 内 1455-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 42010068-42015034(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTA
SmilChr02G004694 Chr02 NC_080388.1:69285167-69285178promoter 内 1359-1370 bp - 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 69287809-69295931(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr01G004190 Chr01 NC_080387.1:60362184-60362195promoter 内 1203-1214 bp + 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 60364982-60367666(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGA
SmilChr02G005290 Chr02 NC_080388.1:73903663-73903674promoter 内 1134-1145 bp - 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 73898662-73900807(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGGA
SmilChr02G000060 Chr02 NC_080388.1:776558-776569promoter 内 1076-1087 bp - 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 772169-773644(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGGT
SmilChr02G004953 Chr02 NC_080388.1:71493683-71493694promoter 内 1069-1080 bp + 2921 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 71488154-71490762(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTTA
SmilChr02G002564 Chr02 NC_080388.1:44615305-44615316promoter 内 940-951 bp - 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 44610723-44612255(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr02G002561 Chr02 NC_080388.1:44560096-44560107promoter 内 845-856 bp - 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 44555391-44556951(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAGCAGAGCA
SmilChr03G000103 Chr03 NC_080389.1:1143852-1143863promoter 内 835-846 bp - 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1147018-1154474(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr02G001567 Chr02 NC_080388.1:29069335-29069346promoter 内 685-696 bp + 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 29072651-29074053(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGA
SmilChr01G004115 Chr01 NC_080387.1:59680239-59680250promoter 内 661-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 59683579-59684819(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGA
SmilChr02G000435 Chr02 NC_080388.1:5670160-5670171promoter 内 537-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 5673624-5676683(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTG
SmilChr02G002263 Chr02 NC_080388.1:40087315-40087326promoter 内 333-344 bp + 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 40081593-40083658(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCA
SmilChr03G000699 Chr03 NC_080389.1:7820512-7820523promoter 内 117-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7810854-7816639(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTCT
SmilChr01G006116 Chr01 NC_080387.1:76689119-76689130promoter 内 98-109 bp + 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 76682695-76685227(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTCA
SmilChr02G003183 Chr02 NC_080388.1:52990043-52990054promoter 内 59-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 52983766-52986112(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAGGT
SmilChr01G005054 Chr01 NC_080387.1:68479857-68479868promoter 内 21-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 68474427-68475888(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAGGC
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73485232-73485243promoter 内 8-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 73489225-73490124(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTG
SmilChr03G001509 Chr03 NC_080389.1:18507206-18507217promoter 内 2117-2128 bp + 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 12 18509090-18509806(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAGCAGAGCA
SmilChr01G002362 Chr01 NC_080387.1:40781066-40781077promoter 内 3680-3691 bp + 310 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 10 40777094-40780756(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTC
SmilChr01G001366 Chr01 NC_080387.1:27024534-27024545promoter 内 3406-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 10 27025129-27027803(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTC
SmilChr01G001365 Chr01 NC_080387.1:27023300-27023311promoter 内 3878-3889 bp - 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 7 27023423-27025072(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTTC
SmilChr01G001093 Chr01 NC_080387.1:22379413-22379424promoter 内 3691-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 22379723-22397006(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGCC
SmilChr01G003950 Chr01 NC_080387.1:57877699-57877710promoter 内 3308-3319 bp - 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 57878392-57882862(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTCTT
SmilChr01G004345 Chr01 NC_080387.1:61607234-61607245promoter 内 1130-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 61610105-61613153(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTCT
SmilChr01G005047 Chr01 NC_080387.1:68405046-68405057promoter 内 3706-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 68401320-68404762(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTG
SmilChr02G000113 Chr02 NC_080388.1:1429957-1429968promoter 内 3497-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 1427366-1429464(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTC
SmilChr01G000231 Chr01 NC_080387.1:4287738-4287749promoter 内 3460-3471 bp - 530 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 4286721-4287208(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGGC
SmilChr03G000579 Chr03 NC_080389.1:6421869-6421880promoter 内 3338-3349 bp - 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 6422532-6425079(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTC
SmilChr02G003044 Chr02 NC_080388.1:51232743-51232754promoter 内 3035-3046 bp - 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 51230962-51231788(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTG
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SmilChr02G000971 Chr02 NC_080388.1:17010125-17010136promoter 内 2326-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 17005463-17008461(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAGTG
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SmilChr02G000112 Chr02 NC_080388.1:1429957-1429968promoter 内 1426-1437 bp + 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 1426595-1427393(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCTC
SmilChr02G004860 Chr02 NC_080388.1:70722852-70722863promoter 内 1382-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 70725471-70736174(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCA
SmilChr01G004078 Chr01 NC_080387.1:59213844-59213855promoter 内 155-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 59207508-59210009(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTCTT
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SmilChr01G002274 Chr01 NC_080387.1:39518247-39518258promoter 内 3865-3876 bp - 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 39518383-39520006(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTT
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SmilChr01G002059 Chr01 NC_080387.1:36407553-36407564promoter 内 3630-3641 bp + 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 36407924-36411467(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAAAACAGAGGC