Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003805; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020790-RA_Salv SmilChr04G003805 MIKC_MADS XP_057805691.1 MP00315 TTTCCAAAAAAGGAAAAAA

可能结合的靶基因

9567 个结合位点 7291 个候选靶基因 第 20 / 146 下载 TSV

上一页 20 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000668 Chr07 NC_080393.1:4534200-4534218promoter 内 2120-2138 bp - 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 4529915-4532337(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr07G000669 Chr07 NC_080393.1:4534200-4534218promoter 内 2029-2047 bp - 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 4536172-4538600(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr08G000347 Chr08 NC_080394.1:2406912-2406930promoter 内 1712-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 2402369-2404641(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAAGGGAAAGAG
SmilChr02G004208 Chr02 NC_080388.1:64348003-64348021promoter 内 1565-1583 bp - 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 64342311-64345585(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAATGGAAATGT
SmilChr04G000946 Chr04 NC_080390.1:12532612-12532630promoter 内 1563-1581 bp + 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 12527019-12530192(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTGGGTAA
SmilChr05G001802 Chr05 NC_080391.1:17802392-17802410promoter 内 897-915 bp + 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 17798471-17799306(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CTCTTTCCCTTTTTGGTAA
SmilChr07G000166 Chr07 NC_080393.1:1006667-1006685promoter 内 3898-3916 bp + 85 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 1006770-1011007(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr05G002086 Chr05 NC_080391.1:21841450-21841468promoter 内 3726-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 21838022-21841193(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr02G003556 Chr02 NC_080388.1:56734889-56734907promoter 内 3723-3741 bp + 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 56735167-56739212(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr01G005827 Chr01 NC_080387.1:74271552-74271570promoter 内 3448-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 74272105-74275418(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr04G003049 Chr04 NC_080390.1:47038025-47038043promoter 内 3199-3217 bp + 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 47038827-47043832(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCCAAAAAGGAAATGA
SmilChr04G003166 Chr04 NC_080390.1:48273198-48273216promoter 内 3067-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 48267411-48272282(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCCAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G004755 Chr01 NC_080387.1:65752751-65752769promoter 内 3059-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 65753693-65755291(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53897629-53897647promoter 内 3054-3072 bp + 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 53898576-53900830(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr02G001938 Chr02 NC_080388.1:34830756-34830774promoter 内 2797-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34831960-34835432(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCTAAAAAAGGAAAATA
SmilChr08G001389 Chr08 NC_080394.1:11116656-11116674promoter 内 2486-2504 bp - 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 11113983-11115159(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAAAAGAAAAGA
SmilChr01G004172 Chr01 NC_080387.1:60199014-60199032promoter 内 2063-2081 bp + 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 60200952-60202141(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr02G001767 Chr02 NC_080388.1:32407138-32407156promoter 内 2009-2027 bp - 1974 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32409130-32411706(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr07G002780 Chr07 NC_080393.1:27693652-27693670promoter 内 1837-1855 bp + 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 27695816-27703373(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr01G001779 Chr01 NC_080387.1:32684607-32684625promoter 内 1832-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32686776-32690199(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACATTTCCATTTTTGGAAA
SmilChr07G000593 Chr07 NC_080393.1:4051582-4051600promoter 内 1660-1678 bp + 2323 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4053923-4054713(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAAAAAGAAAAGA
SmilChr02G001766 Chr02 NC_080388.1:32407138-32407156promoter 内 1578-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32404592-32404733(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr08G002722 Chr08 NC_080394.1:26846217-26846235promoter 内 1450-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 26843613-26843684(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCTTTTCTTTTTTTGGTAA
SmilChr08G002721 Chr08 NC_080394.1:26846217-26846235promoter 内 1342-1360 bp + 2641 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 26838201-26843576(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCTTTTCTTTTTTTGGTAA
SmilChr01G006015 Chr01 NC_080387.1:75739344-75739362promoter 内 932-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 75742413-75743410(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr03G004382 Chr03 NC_080389.1:62023668-62023686promoter 内 782-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 62026887-62029727(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr08G000889 Chr08 NC_080394.1:6596595-6596613promoter 内 632-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 6585624-6593244(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr04G000770 Chr04 NC_080390.1:9467920-9467938promoter 内 612-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 9463934-9464549(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAAAGGAAACGC
SmilChr08G004387 Chr08 NC_080394.1:53631692-53631710promoter 内 609-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 53621175-53628318(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTGGGTAA
SmilChr05G000894 Chr05 NC_080391.1:7071711-7071729promoter 内 287-305 bp + 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 7075425-7078319(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr01G005209 Chr01 NC_080387.1:69728280-69728298promoter 内 279-297 bp + 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 69732002-69732558(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr01G005508 Chr01 NC_080387.1:71935776-71935794promoter 内 240-258 bp + 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 71939537-71944581(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCGAAAAAGGAAAGAG
SmilChr07G002626 Chr07 NC_080393.1:25337111-25337129promoter 内 233-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 25328561-25333361(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACATTTCCTTTTTTGGTAA
SmilChr01G005207 Chr01 NC_080387.1:69728280-69728298promoter 内 228-246 bp + 3755 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 69723859-69724525(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ACGTTTCCTTTTTGGGCAA
SmilChr05G001914 Chr05 NC_080391.1:19418780-19418798promoter 内 173-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 19411569-19414970(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TAGTTTCCTTTTTTGGAAT
SmilChr08G000607 Chr08 NC_080394.1:4503126-4503144promoter 内 135-153 bp - 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4497022-4499278(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCCAAAAAGGAAACGT
SmilChr05G001651 Chr05 NC_080391.1:15558916-15558934promoter 内 3897-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 15556863-15558830(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr03G001798 Chr03 NC_080389.1:24604281-24604299promoter 内 482-500 bp - 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 4 24598375-24600780(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G004833 Chr01 NC_080387.1:66460679-66460697promoter 内 2849-2867 bp + 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 66461831-66464241(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G000805 Chr01 NC_080387.1:17423066-17423084promoter 内 2325-2343 bp + 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 17424742-17427727(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr01G000965 Chr01 NC_080387.1:20487530-20487548promoter 内 3572-3590 bp + 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 20483415-20487119(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr03G003884 Chr03 NC_080389.1:57921066-57921084promoter 内 3565-3583 bp + 418 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 57920037-57920648(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGTTTCTTTTTTTGGCAA
SmilChr06G002956 Chr06 NC_080392.1:42365984-42366002promoter 内 3376-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 42364787-42365377(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr03G001421 Chr03 NC_080389.1:16831877-16831895promoter 内 3288-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 16832590-16834140(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G003669 Chr01 NC_080387.1:55106713-55106731promoter 内 3219-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 55107495-55110325(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr06G000266 Chr06 NC_080392.1:1808535-1808553promoter 内 3130-3148 bp - 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 1799954-1807682(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G004113 Chr01 NC_080387.1:59652204-59652222promoter 内 3039-3057 bp - 944 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 59653166-59658647(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr01G002287 Chr01 NC_080387.1:39669618-39669636promoter 内 2921-2939 bp + 1062 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 39670698-39674128(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr03G003685 Chr03 NC_080389.1:55709190-55709208promoter 内 2784-2802 bp + 1199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 55707074-55707991(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr01G001674 Chr01 NC_080387.1:30886406-30886424promoter 内 2608-2626 bp - 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 30882641-30885031(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA