转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 22 / 151 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001968 Chr03 NC_080389.1:28370175-28370187promoter 内 2623-2635 bp - 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 28367274-28368809(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr04G000942 Chr04 NC_080390.1:12477774-12477786promoter 内 2473-2485 bp + 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 12479302-12480618(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr04G000943 Chr04 NC_080390.1:12487118-12487130promoter 内 2473-2485 bp + 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 12488646-12489962(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCAA
SmilChr01G001918 Chr01 NC_080387.1:34325265-34325277promoter 内 2183-2195 bp - 1806 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 34317381-34323459(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCGAT
SmilChr01G001874 Chr01 NC_080387.1:33768495-33768507promoter 内 2054-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 33760644-33766560(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCGAT
SmilChr04G001558 Chr04 NC_080390.1:25837646-25837658promoter 内 1984-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 25839663-25842702(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGGGTAGGTAAA
SmilChr03G000917 Chr03 NC_080389.1:10480470-10480482promoter 内 1949-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 10482522-10483574(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTGGA
SmilChr05G001711 Chr05 NC_080391.1:16359124-16359136promoter 内 1814-1826 bp - 2175 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 16355215-16356949(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCAGT
SmilChr03G002912 Chr03 NC_080389.1:45869910-45869922promoter 内 1223-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45866385-45867144(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACG
SmilChr03G004355 Chr03 NC_080389.1:61769692-61769704promoter 内 727-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 61772966-61776806(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTGGA
SmilChr03G004356 Chr03 NC_080389.1:61769692-61769704promoter 内 696-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 61772997-61773938(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTGGA
SmilChr01G002120 Chr01 NC_080387.1:37217290-37217302promoter 内 574-586 bp - 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 37220717-37221475(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGGC
SmilChr01G000539 Chr01 NC_080387.1:11069355-11069367promoter 内 532-544 bp - 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 11072824-11074457(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGAGTAGGTAAG
SmilChr05G001746 Chr05 NC_080391.1:16955497-16955509promoter 内 500-512 bp + 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 16958998-16962418(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACG
SmilChr02G002392 Chr02 NC_080388.1:41836671-41836683promoter 内 153-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 41831477-41832835(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACG
SmilChr01G003893 Chr01 NC_080387.1:57221908-57221920promoter 内 86-98 bp + 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 57225823-57234347(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTCCT
SmilChr01G001566 Chr01 NC_080387.1:29677075-29677087promoter 内 3019-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 29678057-29679748(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTGCG
SmilChr01G001565 Chr01 NC_080387.1:29677075-29677087promoter 内 2781-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 29672780-29675867(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCACCTACCACC
SmilChr04G000108 Chr04 NC_080390.1:953614-953626promoter 内 2659-2671 bp + 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 954956-959804(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTCTT
SmilChr02G004149 Chr02 NC_080388.1:63816133-63816145promoter 内 210-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 63809857-63812354(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTCTT
SmilChr01G005374 Chr01 NC_080387.1:70964206-70964218promoter 内 179-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 70968028-70970769(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCGTG
SmilChr01G001533 Chr01 NC_080387.1:29349257-29349269promoter 内 3314-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 29345473-29348582(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGCACCTACCACC
SmilChr05G000093 Chr05 NC_080391.1:535491-535503promoter 内 2700-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 536792-539179(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGGTAGGTAAG
SmilChr02G004379 Chr02 NC_080388.1:66147762-66147774promoter 内 2215-2227 bp + 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 66144318-66145988(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAGTTAGGTAAG
SmilChr02G004630 Chr02 NC_080388.1:68775262-68775274promoter 内 1623-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 5 68777640-68785367(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCGTG
SmilChr01G002476 Chr01 NC_080387.1:42500104-42500116promoter 内 750-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 5 42503355-42505763(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCGTG
SmilChr01G003268 Chr01 NC_080387.1:51362948-51362960promoter 内 3876-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 51363073-51369146(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTAGA
SmilChr02G005232 Chr02 NC_080388.1:73513654-73513666promoter 内 2600-2612 bp - 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 73515055-73516164(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTAGC
SmilChr03G000506 Chr03 NC_080389.1:5451513-5451525promoter 内 2469-2481 bp + 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 5453045-5453746(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACTCTC
SmilChr05G002055 Chr05 NC_080391.1:21410453-21410465promoter 内 1944-1956 bp - 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 21407872-21408408(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTCT
SmilChr01G004961 Chr01 NC_080387.1:67699703-67699715promoter 内 1845-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 67695315-67697559(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTAA
SmilChr05G002054 Chr05 NC_080391.1:21410453-21410465promoter 内 1189-1201 bp - 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 21405442-21407653(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTCT
SmilChr03G000505 Chr03 NC_080389.1:5451513-5451525promoter 内 1133-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 5447638-5448657(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTAAA
SmilChr03G001093 Chr03 NC_080389.1:12619273-12619285promoter 内 152-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 12623122-12624957(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCCCG
SmilChr02G004628 Chr02 NC_080388.1:68775262-68775274promoter 内 127-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 68769284-68771400(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTAGG
SmilChr02G000222 Chr02 NC_080388.1:2883444-2883456promoter 内 3962-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 2882983-2883417(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACATT
SmilChr01G000612 Chr01 NC_080387.1:13515949-13515961promoter 内 3929-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 13514420-13515889(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTAC
SmilChr04G001124 Chr04 NC_080390.1:16301831-16301843promoter 内 3914-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 16298810-16301756(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCCC
SmilChr04G001125 Chr04 NC_080390.1:16311440-16311452promoter 内 3914-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 16308418-16311365(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACTCCC
SmilChr05G000420 Chr05 NC_080391.1:3174679-3174691promoter 内 3873-3885 bp - 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 3174807-3178989(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTAGG
SmilChr01G005014 Chr01 NC_080387.1:68153843-68153855promoter 内 3850-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 68147387-68153704(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAACTCT
SmilChr02G004775 Chr02 NC_080388.1:69905769-69905781promoter 内 3465-3477 bp - 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 69906305-69910079(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGTTAGGTAAA
SmilChr01G002622 Chr01 NC_080387.1:44491000-44491012promoter 内 3446-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 44489247-44490457(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTAAA
SmilChr04G002856 Chr04 NC_080390.1:44670337-44670349promoter 内 3312-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 44671026-44672169(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGTTAGGTAAA
SmilChr01G001271 Chr01 NC_080387.1:25409308-25409320promoter 内 2935-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 25402670-25408254(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCGCC
SmilChr05G000415 Chr05 NC_080391.1:3140441-3140453promoter 内 2721-2733 bp - 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 3137229-3139173(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCCAT
SmilChr04G003396 Chr04 NC_080390.1:50499376-50499388promoter 内 2381-2393 bp - 1608 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 50500996-50502099(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGAGTAGGTAGA
SmilChr02G004567 Chr02 NC_080388.1:68185825-68185837promoter 内 1972-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 68187854-68194128(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGTTAGGTAAA
SmilChr01G004993 Chr01 NC_080387.1:67971604-67971616promoter 内 1736-1748 bp - 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 67966518-67969351(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCGTG
SmilChr04G001996 Chr04 NC_080390.1:32305819-32305831promoter 内 1628-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 32298865-32303458(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAAGTAGGTAAA