转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 22 / 149 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002207 Chr01 NC_080387.1:38409605-38409615promoter 内 2608-2618 bp - 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 38410998-38414939(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGG
SmilChr06G002216 Chr06 NC_080392.1:30997967-30997977promoter 内 2453-2463 bp - 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 30999515-31010580(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr07G001801 Chr07 NC_080393.1:15376280-15376290promoter 内 2245-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 15378036-15379512(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCGG
SmilChr07G003126 Chr07 NC_080393.1:33178234-33178244promoter 内 2214-2224 bp - 1777 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 33173526-33176457(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr06G001509 Chr06 NC_080392.1:16111924-16111934promoter 内 1935-1945 bp + 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 16113990-16117789(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCT
SmilChr01G004235 Chr01 NC_080387.1:60710435-60710445promoter 内 1638-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60707062-60708082(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr04G001970 Chr04 NC_080390.1:31921169-31921179promoter 内 1522-1532 bp - 2469 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 31923648-31925144(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr07G001800 Chr07 NC_080393.1:15376280-15376290promoter 内 1149-1159 bp - 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 15366155-15373438(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGGGCTGTCA
SmilChr07G000402 Chr07 NC_080393.1:2770908-2770918promoter 内 1115-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 2773794-2775039(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr07G001219 Chr07 NC_080393.1:9319675-9319685promoter 内 1039-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 9322637-9332891(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCT
SmilChr03G000038 Chr03 NC_080389.1:455484-455494promoter 内 468-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 459017-461513(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGA
SmilChr03G000463 Chr03 NC_080389.1:4960784-4960794promoter 内 428-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 4952720-4957221(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCT
SmilChr04G001502 Chr04 NC_080390.1:24623476-24623486promoter 内 212-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 24627265-24628260(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr02G002559 Chr02 NC_080388.1:44520083-44520093promoter 内 172-182 bp + 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 44523912-44525140(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGGCT
SmilChr01G001909 Chr01 NC_080387.1:34216694-34216704promoter 内 122-132 bp + 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 34211136-34212825(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr05G001513 Chr05 NC_080391.1:13878833-13878843promoter 内 3922-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 13878912-13883130(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr01G004238 Chr01 NC_080387.1:60710435-60710445promoter 内 3891-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60710545-60711123(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr05G001613 Chr05 NC_080391.1:14856113-14856123promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 14852260-14855718(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr04G001563 Chr04 NC_080390.1:25942545-25942555promoter 内 3505-3515 bp + 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 25941443-25942059(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr04G001595 Chr04 NC_080390.1:26578238-26578248promoter 内 3487-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 26578752-26579789(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr06G002725 Chr06 NC_080392.1:39360813-39360823promoter 内 3163-3173 bp + 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 39359461-39359985(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr03G000479 Chr03 NC_080389.1:5088792-5088802promoter 内 3150-3160 bp - 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 5085337-5087951(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr02G002168 Chr02 NC_080388.1:38907819-38907829promoter 内 2953-2963 bp + 1038 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 38908867-38910207(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr02G005031 Chr02 NC_080388.1:72031546-72031556promoter 内 2725-2735 bp - 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 72032822-72037578(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr01G001824 Chr01 NC_080387.1:33188449-33188459promoter 内 2643-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 33184536-33187101(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr02G000379 Chr02 NC_080388.1:4771076-4771086promoter 内 2630-2640 bp + 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 4766030-4769715(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr04G003027 Chr04 NC_080390.1:46701370-46701380promoter 内 2407-2417 bp - 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 46697250-46699786(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr01G004278 Chr01 NC_080387.1:61010188-61010198promoter 内 2228-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 61005525-61008425(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr07G001795 Chr07 NC_080393.1:15295929-15295939promoter 内 2215-2225 bp - 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 15297715-15300434(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr02G001017 Chr02 NC_080388.1:17942229-17942239promoter 内 2047-2057 bp - 1944 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 17939512-17940285(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGGGCTGTCA
SmilChr02G004846 Chr02 NC_080388.1:70602495-70602505promoter 内 2011-2021 bp - 1980 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 70604485-70608280(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr06G003265 Chr06 NC_080392.1:45288022-45288032promoter 内 1994-2004 bp - 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45281023-45286025(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr05G000275 Chr05 NC_080391.1:2125914-2125924promoter 内 1976-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 2127939-2131408(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr03G004373 Chr03 NC_080389.1:61933206-61933216promoter 内 1928-1938 bp + 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 61935279-61939607(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr04G000247 Chr04 NC_080390.1:2234709-2234719promoter 内 1908-1918 bp + 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 2231171-2232626(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr07G000958 Chr07 NC_080393.1:6905156-6905166promoter 内 1869-1879 bp - 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 6899734-6903034(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
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SmilChr02G002252 Chr02 NC_080388.1:39959448-39959458promoter 内 1765-1775 bp - 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 39961684-39964990(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr02G002939 Chr02 NC_080388.1:49887655-49887665promoter 内 1757-1767 bp - 2234 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 49889899-49891399(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr06G003229 Chr06 NC_080392.1:45028978-45028988promoter 内 1712-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45024344-45026699(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
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SmilChr03G003471 Chr03 NC_080389.1:53174021-53174031promoter 内 1695-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 53176327-53178406(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
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SmilChr04G003194 Chr04 NC_080390.1:48682306-48682316promoter 内 1598-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 48677946-48679913(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr01G001254 Chr01 NC_080387.1:25172741-25172751promoter 内 1429-1439 bp - 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 25175313-25176435(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr01G002167 Chr01 NC_080387.1:37757769-37757779promoter 内 1419-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 37760351-37763466(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCGGGCTGTCA
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SmilChr01G005007 Chr01 NC_080387.1:68108640-68108650promoter 内 993-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 68111648-68111721(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA
SmilChr06G001168 Chr06 NC_080392.1:11902142-11902152promoter 内 901-911 bp + 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 11905242-11907813(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCA
SmilChr01G000508 Chr01 NC_080387.1:10243899-10243909promoter 内 785-795 bp - 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 10247115-10250188(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGA