转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 24 / 144 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002133 Chr02 NC_080388.1:38390565-38390577promoter 内 361-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 38384804-38386937(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr02G005030 Chr02 NC_080388.1:72035422-72035434promoter 内 150-162 bp - 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 72028583-72031583(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCAAGTCAACCCC
SmilChr03G004262 Chr03 NC_080389.1:61114985-61114997promoter 内 109-121 bp - 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 61109432-61111105(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2592876-2592888promoter 内 43-55 bp - 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 2 2596834-2607793(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAGGTTGACTTTT
SmilChr04G001361 Chr04 NC_080390.1:22085950-22085962promoter 内 3923-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 22084731-22085884(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACCTCC
SmilChr04G001923 Chr04 NC_080390.1:31341972-31341984promoter 内 3853-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 31340151-31341836(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTTAGTCAACGGT
SmilChr03G003776 Chr03 NC_080389.1:56922061-56922073promoter 内 3780-3792 bp - 209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56921021-56921852(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr02G002127 Chr02 NC_080388.1:38090839-38090851promoter 内 3701-3713 bp + 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 38091139-38092294(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCAAGTCAACCCC
SmilChr01G000148 Chr01 NC_080387.1:2549202-2549214promoter 内 3569-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2548627-2548782(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTACG
SmilChr02G001055 Chr02 NC_080388.1:18819410-18819422promoter 内 3569-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18819842-18819997(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTACG
SmilChr02G001058 Chr02 NC_080388.1:18827472-18827484promoter 内 3569-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18827904-18828059(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTACG
SmilChr01G001765 Chr01 NC_080387.1:32444931-32444943promoter 内 3567-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32445365-32445886(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACCTCC
SmilChr01G005644 Chr01 NC_080387.1:72856213-72856225promoter 内 3556-3568 bp + 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 72856658-72859105(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr01G004355 Chr01 NC_080387.1:61728789-61728801promoter 内 3311-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 61729479-61746900(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGGGTTGACTTTA
SmilChr04G002099 Chr04 NC_080390.1:33862015-33862027promoter 内 3266-3278 bp - 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 33849332-33861292(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr01G000147 Chr01 NC_080387.1:2549202-2549214promoter 内 3185-3197 bp + 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 2545090-2548398(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTACG
SmilChr02G001056 Chr02 NC_080388.1:18819410-18819422promoter 内 3185-3197 bp - 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18820226-18823614(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTACG
SmilChr02G000593 Chr02 NC_080388.1:8492514-8492526promoter 内 3037-3049 bp + 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8493478-8565262(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CTAGGTCAACGGA
SmilChr02G004905 Chr02 NC_080388.1:71037540-71037552promoter 内 2898-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71033826-71036449(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGCTTTGACTTTT
SmilChr04G001700 Chr04 NC_080390.1:28129120-28129132promoter 内 2856-2868 bp + 1133 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 28124056-28127987(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGCTTTGACTTTT
SmilChr01G004354 Chr01 NC_080387.1:61728789-61728801promoter 内 2844-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 61727024-61727644(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAAGTCAACCCA
SmilChr02G004240 Chr02 NC_080388.1:64588143-64588155promoter 内 2815-2827 bp - 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 64589329-64596205(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTAT
SmilChr02G000457 Chr02 NC_080388.1:6100081-6100093promoter 内 2803-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 6101279-6102811(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAGGTCAACGTG
SmilChr02G005476 Chr02 NC_080388.1:75000935-75000947promoter 内 2664-2676 bp - 1325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 74998728-74999610(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACAAT
SmilChr03G000797 Chr03 NC_080389.1:9123425-9123437promoter 内 2647-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9121977-9122083(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATTGTTGACTTTT
SmilChr03G000799 Chr03 NC_080389.1:9144899-9144911promoter 内 2647-2659 bp + 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 9143451-9143557(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATTGTTGACTTTT
SmilChr04G000703 Chr04 NC_080390.1:8177103-8177115promoter 内 2636-2648 bp - 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 8178468-8181148(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATAGTTGACTTTC
SmilChr02G005477 Chr02 NC_080388.1:75000935-75000947promoter 内 2635-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 75002301-75004018(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATTGTTGACTTTT
SmilChr01G001818 Chr01 NC_080387.1:33101746-33101758promoter 内 2583-2595 bp - 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 33100189-33100340(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGTAGTCAACGGG
SmilChr03G001479 Chr03 NC_080389.1:17788887-17788899promoter 内 2490-2502 bp + 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 17784353-17787388(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATTGTTGACTTTT
SmilChr02G002829 Chr02 NC_080388.1:48384864-48384876promoter 内 2426-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 48386439-48389938(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAAAGTCAACAGA
SmilChr01G005643 Chr01 NC_080387.1:72856213-72856225promoter 内 2414-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 72852191-72854638(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACCTCC
SmilChr02G004033 Chr02 NC_080388.1:62626184-62626196promoter 内 2356-2368 bp - 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 62627829-62630397(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACCTCC
SmilChr03G001491 Chr03 NC_080389.1:18024561-18024573promoter 内 2269-2281 bp - 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 18026293-18027534(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GATGTTGACTTTG
SmilChr01G005642 Chr01 NC_080387.1:72852059-72852071promoter 内 2248-2260 bp - 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 72849507-72850318(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGGTCAACGCG
SmilChr04G000330 Chr04 NC_080390.1:3041724-3041736promoter 内 2031-2043 bp + 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 3036384-3039766(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGCTTTGACTTTT
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