Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 24 / 125 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001489 Chr03 NC_080389.1:17955481-17955500promoter 内 3599-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 17953517-17955098(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGAAAGA
SmilChr02G005487 Chr02 NC_080388.1:75062732-75062751promoter 内 3550-3569 bp + 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 75058151-75062300(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTCTCTTTTTTTCTC
SmilChr02G005488 Chr02 NC_080388.1:75062732-75062751promoter 内 3457-3476 bp + 525 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 75063276-75064597(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAAAGAGAAGAAAA
SmilChr02G002373 Chr02 NC_080388.1:41557905-41557924promoter 内 3445-3464 bp - 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 41549344-41557368(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAA
SmilChr02G000075 Chr02 NC_080388.1:970339-970358promoter 内 3254-3273 bp - 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 967593-969611(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGAGAGGAGAACA
SmilChr02G002161 Chr02 NC_080388.1:38826937-38826956promoter 内 3226-3245 bp - 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 38826087-38826181(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGATAAAGACAAAAACCCA
SmilChr02G004270 Chr02 NC_080388.1:64912754-64912773promoter 内 3200-3219 bp - 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 64907854-64911972(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAGAAGAGAAAT
SmilChr03G003235 Chr03 NC_080389.1:50260013-50260032promoter 内 3123-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 50257257-50259154(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr01G001478 Chr01 NC_080387.1:28565371-28565390promoter 内 2861-2880 bp - 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 28560710-28564250(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAA
SmilChr01G005489 Chr01 NC_080387.1:71831036-71831055promoter 内 2857-2876 bp + 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 71825897-71829911(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTAGTTTTTGTCTGCTTCCG
SmilChr02G001528 Chr02 NC_080388.1:28475681-28475700promoter 内 2762-2781 bp + 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 28476920-28477391(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAAAAAAGAGAAAAAAAAT
SmilChr03G001442 Chr03 NC_080389.1:17195155-17195174promoter 内 2214-2233 bp - 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 17190121-17193387(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACAAAAAGACAAGGCGGGA
SmilChr01G003700 Chr01 NC_080387.1:55385545-55385564promoter 内 2127-2146 bp + 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55374162-55383690(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCTCTCTTGTCTTCACCTC
SmilChr02G004060 Chr02 NC_080388.1:62895901-62895920promoter 内 2039-2058 bp - 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62890608-62893958(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAA
SmilChr02G003656 Chr02 NC_080388.1:57944963-57944982promoter 内 1867-1886 bp - 2115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 57947097-57947936(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr01G002755 Chr01 NC_080387.1:45858866-45858885promoter 内 1783-1802 bp + 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 45861084-45862112(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAAAAGAAGACAAAGTAGAA
SmilChr03G002347 Chr03 NC_080389.1:37021384-37021403promoter 内 1479-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 37015279-37018881(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr01G003245 Chr01 NC_080387.1:51187920-51187939promoter 内 1460-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 51190461-51192069(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr02G004381 Chr02 NC_080388.1:66162032-66162051promoter 内 867-886 bp + 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 66165166-66169186(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAAAA
SmilChr03G003427 Chr03 NC_080389.1:52599697-52599716promoter 内 715-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52602983-52606903(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr02G000439 Chr02 NC_080388.1:5714164-5714183promoter 内 683-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5709996-5710865(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCGTCTCTTTCTTTTTCTG
SmilChr01G003981 Chr01 NC_080387.1:58258801-58258820promoter 内 627-646 bp + 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 58262175-58264660(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCGGAGAAGACAAAGGAAAC
SmilChr03G002254 Chr03 NC_080389.1:35466881-35466900promoter 内 431-450 bp + 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 35470451-35472772(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAAAAAAAGACAAAAGACCC
SmilChr03G003686 Chr03 NC_080389.1:55768265-55768284promoter 内 46-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55753625-55764329(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCCTTTTTCTTTTTCTT
SmilChr01G003783 Chr01 NC_080387.1:56212858-56212877promoter 内 41-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 56216818-56219149(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr02G002160 Chr02 NC_080388.1:38826937-38826956promoter 内 3965-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38819841-38826920(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGATAAAGACAAAAACCCA
SmilChr01G001402 Chr01 NC_080387.1:27591101-27591120promoter 内 3855-3874 bp - 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27589426-27590974(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CGAATGAAGACAAAAGGGGA
SmilChr02G005106 Chr02 NC_080388.1:72585986-72586005promoter 内 3837-3856 bp - 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72586150-72586944(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGTTTTTTTCTCTTTTCGTC
SmilChr02G004594 Chr02 NC_080388.1:68441585-68441604promoter 内 3712-3731 bp + 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 68441874-68453109(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAAAAAAGAGAAAAATAGT
SmilChr01G004032 Chr01 NC_080387.1:58740753-58740772promoter 内 3706-3725 bp + 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58741048-58757991(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGACAGAGACAAAGCAATA
SmilChr03G000579 Chr03 NC_080389.1:6421606-6421625promoter 内 3075-3094 bp + 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 6422532-6425079(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGAAAAATGGA
SmilChr01G003997 Chr01 NC_080387.1:58372525-58372544promoter 内 3074-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58373452-58375694(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AATCTTTTTGTCTTTTTCCT
SmilChr02G004814 Chr02 NC_080388.1:70292858-70292877promoter 内 3043-3062 bp + 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 70290289-70291919(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr03G002040 Chr03 NC_080389.1:30814817-30814836promoter 内 2851-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 30815967-30837413(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTCCTTTTCCTCTTTTTCTC
SmilChr01G001322 Chr01 NC_080387.1:26258015-26258034promoter 内 2480-2499 bp + 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 26259536-26262315(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAAGAAGACAAAGAGCAT
SmilChr01G001422 Chr01 NC_080387.1:27829654-27829673promoter 内 2478-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27831177-27835759(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr03G000645 Chr03 NC_080389.1:7161606-7161625promoter 内 2310-2329 bp - 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7163297-7165057(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTCTCTCTTCTTC
SmilChr02G004752 Chr02 NC_080388.1:69718433-69718452promoter 内 2175-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 69720259-69726423(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr03G003161 Chr03 NC_080389.1:48965766-48965785promoter 内 2174-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48967593-48969350(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAGAGAGGGAAAAG
SmilChr01G005561 Chr01 NC_080387.1:72423679-72423698promoter 内 2077-2096 bp - 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72425603-72428599(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr01G003777 Chr01 NC_080387.1:56164202-56164221promoter 内 2065-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 56166138-56173198(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGGAAAGGACAAAAATAAG
SmilChr03G003122 Chr03 NC_080389.1:48383574-48383593promoter 内 2015-2034 bp + 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48379685-48381607(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr02G002265 Chr02 NC_080388.1:40107758-40107777promoter 内 1994-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 40109765-40113205(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGAAAAATGGA
SmilChr01G003995 Chr01 NC_080387.1:58372525-58372544promoter 内 1985-2004 bp - 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 58367056-58370528(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAAAAAGACAAAAAGATT
SmilChr01G002281 Chr01 NC_080387.1:39605103-39605122promoter 内 1983-2002 bp - 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 39607121-39613937(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACTCATTTTGTTTTTTTCTC
SmilChr01G000113 Chr01 NC_080387.1:1939619-1939638promoter 内 1871-1890 bp - 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1941749-1946063(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72752384-72752403promoter 内 1769-1788 bp + 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 72746687-72750171(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr02G002856 Chr02 NC_080388.1:48762446-48762465promoter 内 1653-1672 bp - 2329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 48764794-48768703(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTCTCTCTTTTTTTT
SmilChr02G002971 Chr02 NC_080388.1:50227825-50227844promoter 内 1652-1671 bp - 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 50230174-50231112(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCCGCCTTGTCTTTTTGTT
SmilChr03G000644 Chr03 NC_080389.1:7161606-7161625promoter 内 1634-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7156954-7159258(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAGAAGAGAGAAAAAAAAG