转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 24 / 121 下载 TSV

上一页 24 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003934 Chr02 NC_080388.1:61406907-61406921promoter 内 1623-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 61409285-61410546(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGGTCGAGATCTGGA
SmilChr02G001913 Chr02 NC_080388.1:34422444-34422458promoter 内 1619-1633 bp - 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 34424826-34426167(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGTACAT
SmilChr02G003932 Chr02 NC_080388.1:61406907-61406921promoter 内 1540-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 61403860-61404460(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCCAGATCTCGACCT
SmilChr03G002859 Chr03 NC_080389.1:45192819-45192833promoter 内 1507-1521 bp + 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 45195313-45197354(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCTTTTAGATCTGAA
SmilChr02G000097 Chr02 NC_080388.1:1263060-1263074promoter 内 1094-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 1265967-1268801(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCTGCTGGATCTGAG
SmilChr04G003701 Chr04 NC_080390.1:53358288-53358302promoter 内 1084-1098 bp - 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53361205-53363263(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTAAAACA
SmilChr02G001155 Chr02 NC_080388.1:21060199-21060213promoter 内 985-999 bp + 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 21054991-21057197(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCGTTTTC
SmilChr01G000277 Chr01 NC_080387.1:5479553-5479567promoter 内 923-937 bp + 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5471634-5476489(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCATAACC
SmilChr03G001548 Chr03 NC_080389.1:19489708-19489722promoter 内 916-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 19492793-19497459(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCCGATTTT
SmilChr04G003122 Chr04 NC_080390.1:47825051-47825065promoter 内 863-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 47828189-47831864(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGTTTTAGATCTGAA
SmilChr04G003550 Chr04 NC_080390.1:51856167-51856181promoter 内 604-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 51859564-51863084(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAATCGGATCTGAC
SmilChr02G000839 Chr02 NC_080388.1:14201812-14201826promoter 内 506-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 14205307-14207987(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGTTCCAGATCTGTG
SmilChr04G000521 Chr04 NC_080390.1:5748641-5748655promoter 内 484-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5738820-5745138(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGTTTTAGATCTGAA
SmilChr02G004485 Chr02 NC_080388.1:67324894-67324908promoter 内 335-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 67320603-67321242(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGGTCA
SmilChr01G004822 Chr01 NC_080387.1:66403782-66403796promoter 内 334-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 66396804-66400129(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGTCTAGATCCGCG
SmilChr01G001972 Chr01 NC_080387.1:35101486-35101500promoter 内 8-22 bp + 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 35105479-35107663(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGTTCCAGATCTGTG
SmilChr02G002242 Chr02 NC_080388.1:39803625-39803639promoter 内 1317-1331 bp - 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 7 39798509-39800955(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACTCCAGATCTGCG
SmilChr01G003223 Chr01 NC_080387.1:50994297-50994311promoter 内 756-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 7 50997542-51002729(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCTGCGGATCTGAT
SmilChr02G000249 Chr02 NC_080388.1:3217892-3217906promoter 内 2940-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 5 3211379-3216845(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTGATCCA
SmilChr05G001526 Chr05 NC_080391.1:13991977-13991991promoter 内 487-501 bp - 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 5 13987881-13988477(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGGTCCAGATCTGTT
SmilChr01G000746 Chr01 NC_080387.1:16509304-16509318promoter 内 3262-3276 bp + 725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 16510043-16513220(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTACTAGATCTGGG
SmilChr04G002152 Chr04 NC_080390.1:34566786-34566800promoter 内 1580-1594 bp - 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 34569207-34570383(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTGAAATG
SmilChr03G000408 Chr03 NC_080389.1:4437568-4437582promoter 内 3729-3743 bp - 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 4436879-4437310(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCATCCAGATCTGCA
SmilChr03G003619 Chr03 NC_080389.1:54853673-54853687promoter 内 3641-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 54854033-54855725(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTAGATAC
SmilChr01G000806 Chr01 NC_080387.1:17435472-17435486promoter 内 3284-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 17431542-17434769(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTACTAGATCTGGG
SmilChr05G000813 Chr05 NC_080391.1:6339425-6339439promoter 内 2475-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 6336534-6337913(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTACTTCA
SmilChr01G003222 Chr01 NC_080387.1:50994297-50994311promoter 内 2017-2031 bp + 1970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 50981776-50992327(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCGCAGCT
SmilChr02G000489 Chr02 NC_080388.1:6687404-6687418promoter 内 1447-1461 bp + 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 6689958-6694670(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGAAGTAGATCTGAG
SmilChr03G002407 Chr03 NC_080389.1:38260106-38260120promoter 内 1314-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 38262793-38265735(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCGCCGGATCTGAG
SmilChr02G001287 Chr02 NC_080388.1:23689645-23689659promoter 内 1284-1298 bp + 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 23692362-23698091(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGGGCCGGATCTGAA
SmilChr03G001022 Chr03 NC_080389.1:11849605-11849619promoter 内 1096-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 11852510-11854008(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CCCAGATCTAATCCA
SmilChr05G001527 Chr05 NC_080391.1:13991977-13991991promoter 内 743-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 13995235-14000208(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACAGATCTGGACCA
SmilChr02G000488 Chr02 NC_080388.1:6687404-6687418promoter 内 513-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 6680556-6683930(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTACTTCA
SmilChr05G000124 Chr05 NC_080391.1:1003149-1003163promoter 内 198-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 994000-999360(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCCTCCAGATCTGCT
SmilChr05G001684 Chr05 NC_080391.1:15986041-15986055promoter 内 3869-3883 bp + 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 15986173-15987351(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GACGCCAGATCTGGT
SmilChr04G003268 Chr04 NC_080390.1:49390108-49390122promoter 内 2617-2631 bp - 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 49385416-49388738(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTTACCGGATCTGAA
SmilChr05G000216 Chr05 NC_080391.1:1700203-1700217promoter 内 2485-2499 bp - 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1695699-1698701(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGAATCAGATCTGCC
SmilChr01G000362 Chr01 NC_080387.1:7471834-7471848promoter 内 2422-2436 bp + 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 7469354-7470269(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCAAAATT
SmilChr01G005408 Chr01 NC_080387.1:71335135-71335149promoter 内 1841-1855 bp - 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 71337295-71341005(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGCAGATCTGGAGCA
SmilChr05G001683 Chr05 NC_080391.1:15986041-15986055promoter 内 1641-1655 bp + 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 15981284-15983695(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTGGCGTC
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SmilChr04G001182 Chr04 NC_080390.1:17916340-17916354promoter 内 1510-1524 bp - 2477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 17918831-17919376(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTAGATAC
SmilChr03G002628 Chr03 NC_080389.1:41708016-41708030promoter 内 1324-1338 bp - 2663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 41710693-41718773(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTAGATCTAGATAC
SmilChr04G001954 Chr04 NC_080390.1:31726840-31726854promoter 内 672-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 31730169-31732306(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCTCTAGATCTGAG
SmilChr02G000425 Chr02 NC_080388.1:5429727-5429741promoter 内 640-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 5424566-5426380(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGTTTG
SmilChr04G001555 Chr04 NC_080390.1:25743900-25743914promoter 内 604-618 bp + 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 25739893-25740517(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTGGAGAT
SmilChr03G003194 Chr03 NC_080389.1:49417813-49417827promoter 内 3872-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49417942-49442263(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGACGTGGATCTGAG
SmilChr03G002965 Chr03 NC_080389.1:46398028-46398042promoter 内 3794-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 46398235-46400041(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAAGTGGATCTGAA
SmilChr03G000689 Chr03 NC_080389.1:7684570-7684584promoter 内 3597-3611 bp - 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 7682537-7684180(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATTACTAGATCTGGG
SmilChr01G003032 Chr01 NC_080387.1:49357297-49357311promoter 内 3386-3400 bp - 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49357912-49361275(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTCGGTCT