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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 26 / 123 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002151 Chr06 NC_080392.1:29224305-29224319promoter 内 262-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29228044-29229294(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACAGCTTC
SmilChr03G001307 Chr03 NC_080389.1:15336898-15336912promoter 内 146-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 15330344-15333057(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGGATCG
SmilChr06G001242 Chr06 NC_080392.1:12805159-12805173promoter 内 104-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12809056-12809754(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGATCCGTCGGTGGC
SmilChr06G000740 Chr06 NC_080392.1:6854932-6854946promoter 内 596-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 6846669-6851541(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGATTCG
SmilChr07G003992 Chr07 NC_080393.1:50982231-50982245promoter 内 3037-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 50983195-50985631(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGAATCT
SmilChr03G000345 Chr03 NC_080389.1:3896775-3896789promoter 内 3937-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 3896839-3897761(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCGCTGTCGGTGCT
SmilChr03G003441 Chr03 NC_080389.1:52800312-52800326promoter 内 3667-3681 bp - 320 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 52800646-52801167(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGATTCG
SmilChr08G003725 Chr08 NC_080394.1:41970943-41970957promoter 内 2387-2401 bp + 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 41972557-41977123(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCTGTGGCGGTGGT
SmilChr03G002305 Chr03 NC_080389.1:36279559-36279573promoter 内 2075-2089 bp + 1912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 36281485-36284227(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCTGTGGCGGTGGT
SmilChr03G000260 Chr03 NC_080389.1:3044314-3044328promoter 内 1874-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 3038683-3042201(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCTGTGGCGGTGGT
SmilChr03G003442 Chr03 NC_080389.1:52800312-52800326promoter 内 1543-1557 bp - 2444 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 52802770-52803940(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGATTCG
SmilChr02G005496 Chr02 NC_080388.1:75119299-75119313promoter 内 1305-1319 bp - 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 75121995-75125320(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACACACCT
SmilChr03G001084 Chr03 NC_080389.1:12547123-12547137promoter 内 884-898 bp + 3103 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 12550240-12551313(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCTGTGGCGGTGGT
SmilChr07G000878 Chr07 NC_080393.1:6274162-6274176promoter 内 671-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 6277492-6281503(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACCGCG
SmilChr03G000422 Chr03 NC_080389.1:4596106-4596120promoter 内 77-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 4589837-4592196(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCATTGTCGGTGAA
SmilChr03G004707 Chr03 NC_080389.1:64344708-64344722promoter 内 3958-3972 bp - 29 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 64344751-64348496(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACAGCTAC
SmilChr02G001054 Chr02 NC_080388.1:18817202-18817216promoter 内 3402-3416 bp + 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18817801-18819608(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCTTCGTCGGTGGC
SmilChr02G001057 Chr02 NC_080388.1:18825263-18825277promoter 内 3402-3416 bp + 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18825862-18827670(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCTTCGTCGGTGGC
SmilChr04G004115 Chr04 NC_080390.1:56057985-56057999promoter 内 3221-3235 bp + 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56052787-56057219(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAGCTCC
SmilChr07G003653 Chr07 NC_080393.1:43448767-43448781promoter 内 3190-3204 bp - 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43449578-43450054(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACATCGTC
SmilChr05G000124 Chr05 NC_080391.1:1000324-1000338promoter 内 3023-3037 bp + 964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 994000-999360(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACAGTTTG
SmilChr04G002365 Chr04 NC_080390.1:38127804-38127818promoter 内 2529-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 38129276-38147538(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACGATGTCGGTGAT
SmilChr02G004246 Chr02 NC_080388.1:64654201-64654215promoter 内 2484-2498 bp - 1503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 64655718-64657732(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACAGTTTG
SmilChr03G000230 Chr03 NC_080389.1:2725979-2725993promoter 内 2384-2398 bp - 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2727596-2728591(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACAGCGAC
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SmilChr06G003275 Chr06 NC_080392.1:45339149-45339163promoter 内 1899-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45341251-45341929(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GATTGTGGCGGTGGT
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SmilChr08G004146 Chr08 NC_080394.1:50561981-50561995promoter 内 1763-1777 bp - 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 50557212-50559757(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCTTCGTCGGTGGA
SmilChr02G003889 Chr02 NC_080388.1:60982870-60982884promoter 内 1758-1772 bp - 2229 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 60985113-60991057(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACAAACCG
SmilChr08G001632 Chr08 NC_080394.1:13503064-13503078promoter 内 1553-1567 bp + 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 13505512-13506387(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTGATTGTCGGTGGT
SmilChr07G002875 Chr07 NC_080393.1:28955399-28955413promoter 内 1507-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 28948963-28952919(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGGGGTGTCGGTGAG
SmilChr07G002900 Chr07 NC_080393.1:29389045-29389059promoter 内 1371-1385 bp + 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 29383562-29386429(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACAGCGAC
SmilChr02G001055 Chr02 NC_080388.1:18817202-18817216promoter 内 1361-1375 bp + 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18819842-18819997(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCTTCGTCGGTGGC
SmilChr02G001058 Chr02 NC_080388.1:18825263-18825277promoter 内 1360-1374 bp + 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18827904-18828059(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCTTCGTCGGTGGC
SmilChr08G001799 Chr08 NC_080394.1:15168658-15168672promoter 内 1255-1269 bp + 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15171404-15173489(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAACTGTCGGTGAT
SmilChr01G003669 Chr01 NC_080387.1:55104743-55104757promoter 内 1249-1263 bp + 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55107495-55110325(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGAGTTGTCGGCGAC
SmilChr06G000911 Chr06 NC_080392.1:8581937-8581951promoter 内 1036-1050 bp - 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8584902-8585833(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAGCTCC
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SmilChr07G001029 Chr07 NC_080393.1:7518499-7518513promoter 内 910-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7507313-7515422(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACAGTTTT
SmilChr03G003733 Chr03 NC_080389.1:56368082-56368096promoter 内 501-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56361768-56364596(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCTGTGGCGGTGGT
SmilChr01G004498 Chr01 NC_080387.1:63086900-63086914promoter 内 237-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 63079386-63083150(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCACAGAC
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SmilChr02G001258 Chr02 NC_080388.1:23083281-23083295promoter 内 3344-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 23079644-23082638(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCAGATGTCGGTGAT