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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 26 / 134 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000234 Chr01 NC_080387.1:4396331-4396345promoter 内 3917-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 4395398-4396261(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGCGATTT
SmilChr07G003983 Chr07 NC_080393.1:50821325-50821339promoter 内 3867-3881 bp - 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 50818134-50821205(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTCACCGACATCT
SmilChr02G000831 Chr02 NC_080388.1:14090811-14090825promoter 内 3338-3352 bp + 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 14087237-14090162(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGCCTTGA
SmilChr05G002096 Chr05 NC_080391.1:21942009-21942023promoter 内 2133-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 21943877-21944811(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGGCGCCGACAACG
SmilChr02G000832 Chr02 NC_080388.1:14090811-14090825promoter 内 944-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 14093868-14096579(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCAAGGCCGACATCA
SmilChr05G001207 Chr05 NC_080391.1:10147448-10147462promoter 内 520-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 10150929-10152754(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTGGAAT
SmilChr01G004464 Chr01 NC_080387.1:62748904-62748918promoter 内 513-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 62743094-62745430(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGCCGAAG
SmilChr03G002347 Chr03 NC_080389.1:37018884-37018898promoter 内 3984-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37015279-37018881(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACATGTCGGTAGAGT
SmilChr08G004273 Chr08 NC_080394.1:52236596-52236610promoter 内 3981-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52236616-52238820(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGAGGTCGGCAGAGC
SmilChr06G001584 Chr06 NC_080392.1:17278036-17278050promoter 内 3940-3954 bp + 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 17278097-17283063(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTCGTGCCGACATCA
SmilChr05G001206 Chr05 NC_080391.1:10147448-10147462promoter 内 3901-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10147548-10149327(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTGGAAT
SmilChr06G000398 Chr06 NC_080392.1:3184836-3184850promoter 内 3674-3688 bp + 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3185163-3195748(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATCCCGCCGACACCA
SmilChr04G003229 Chr04 NC_080390.1:49130933-49130947promoter 内 3649-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49129572-49130595(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGTTGTCGGCGAGAG
SmilChr07G002153 Chr07 NC_080393.1:19718669-19718683promoter 内 3530-3544 bp - 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19718141-19718212(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCGGTGCCGACGTCC
SmilChr04G002256 Chr04 NC_080390.1:36521888-36521902promoter 内 3456-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36522433-36523368(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGCTGACCGACATCA
SmilChr05G003194 Chr05 NC_080391.1:40832222-40832236promoter 内 3445-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40828804-40831680(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAATCACCGACATAA
SmilChr06G002749 Chr06 NC_080392.1:39999845-39999859promoter 内 3432-3446 bp - 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39997884-39999290(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTCCGCCGACACAC
SmilChr02G000594 Chr02 NC_080388.1:8525058-8525072promoter 内 3424-3438 bp + 563 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8523336-8524495(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTCGGTA
SmilChr02G003906 Chr02 NC_080388.1:61123625-61123639promoter 内 3324-3338 bp - 663 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61124302-61124374(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGCGTCGA
SmilChr08G002885 Chr08 NC_080394.1:28723382-28723396promoter 内 3258-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28719423-28722653(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTTTGCCGACATTC
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71522227-71522241promoter 内 3205-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71519011-71521445(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr03G004669 Chr03 NC_080389.1:64155868-64155882promoter 内 3079-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 64156790-64163442(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGCCACCT
SmilChr02G004952 Chr02 NC_080388.1:71482318-71482332promoter 内 3076-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71483243-71487460(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGTGTCGGCGCCGC
SmilChr01G001321 Chr01 NC_080387.1:26230910-26230924promoter 内 3038-3052 bp - 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26231873-26232954(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTAAAGT
SmilChr02G000272 Chr02 NC_080388.1:3514390-3514404promoter 内 2966-2980 bp + 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3509153-3513369(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCCAAGT
SmilChr04G001981 Chr04 NC_080390.1:32087825-32087839promoter 内 2802-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 32089024-32090649(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGCTCGCCGACAACA
SmilChr08G000264 Chr08 NC_080394.1:1812144-1812158promoter 内 2579-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1813566-1815410(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATCGCCGACAAGA
SmilChr01G005492 Chr01 NC_080387.1:71841472-71841486promoter 内 2520-2534 bp + 1467 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71834680-71840005(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTGAGAC
SmilChr03G003686 Chr03 NC_080389.1:55765886-55765900promoter 内 2430-2444 bp + 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55753625-55764329(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATGTCGGCTGTGT
SmilChr07G001863 Chr07 NC_080393.1:16142203-16142217promoter 内 2255-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16143949-16147072(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTCTGCCGACATAC
SmilChr02G002872 Chr02 NC_080388.1:48965462-48965476promoter 内 2159-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 48957194-48963634(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGGCGCCGACACCA
SmilChr04G003271 Chr04 NC_080390.1:49410300-49410314promoter 内 2083-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49406301-49408396(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTCCACCGACATAA
SmilChr02G005260 Chr02 NC_080388.1:73684655-73684669promoter 内 1801-1815 bp - 2186 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 73686855-73688340(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAATGTCGGTGGCTC
SmilChr08G003944 Chr08 NC_080394.1:47189955-47189969promoter 内 1657-1671 bp + 2330 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 47184599-47187625(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTATGTCGGTCGAAG
SmilChr02G001978 Chr02 NC_080388.1:35738068-35738082promoter 内 1606-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 35732406-35735687(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATTGCCGACATAG
SmilChr08G001715 Chr08 NC_080394.1:14377645-14377659promoter 内 1561-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14380085-14383713(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGATGTCGGCTAGGT
SmilChr03G003687 Chr03 NC_080389.1:55765886-55765900promoter 内 1438-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 55768449-55771826(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACACAGCCGACATGG
SmilChr03G002079 Chr03 NC_080389.1:31909240-31909254promoter 内 1308-1322 bp - 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 31911933-31916492(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGCGCAGA
SmilChr03G003172 Chr03 NC_080389.1:49097289-49097303promoter 内 1273-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 49092602-49094575(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATATGTCGGCGTGGA
SmilChr02G001393 Chr02 NC_080388.1:26463938-26463952promoter 内 1122-1136 bp + 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26466817-26470187(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTGCGCCGACATTA
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SmilChr01G000867 Chr01 NC_080387.1:18545105-18545119promoter 内 1051-1065 bp - 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 18548055-18550334(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGTTGTCGGCGAGAG
SmilChr06G001028 Chr06 NC_080392.1:10208729-10208743promoter 内 1015-1029 bp - 2972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10202881-10205757(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGCTCGCCGACAACA
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SmilChr07G000496 Chr07 NC_080393.1:3459874-3459888promoter 内 694-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3450156-3456581(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGGCGCCGACACCA