转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 26 / 149 下载 TSV

上一页 26 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000932 Chr04 NC_080390.1:12163195-12163205promoter 内 1416-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 12158815-12160620(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTC
SmilChr05G001422 Chr05 NC_080391.1:12899448-12899458promoter 内 1399-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 12902050-12908325(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAA
SmilChr03G002343 Chr03 NC_080389.1:36941356-36941366promoter 内 1356-1366 bp - 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 36936490-36938721(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr05G003639 Chr05 NC_080391.1:48815672-48815682promoter 内 1345-1355 bp + 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 48812920-48813026(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr04G002383 Chr04 NC_080390.1:38374587-38374597promoter 内 1205-1215 bp + 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 38369075-38371801(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr01G005245 Chr01 NC_080387.1:69964242-69964252promoter 内 1107-1117 bp + 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 69967136-69969848(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr03G004719 Chr03 NC_080389.1:64423594-64423604promoter 内 703-713 bp - 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 64417066-64420306(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr02G002189 Chr02 NC_080388.1:39080053-39080063promoter 内 666-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 39083388-39087574(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTC
SmilChr02G004013 Chr02 NC_080388.1:62443149-62443159promoter 内 517-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 62438878-62439675(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTC
SmilChr02G002187 Chr02 NC_080388.1:39080053-39080063promoter 内 459-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 39074556-39076521(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr07G002901 Chr07 NC_080393.1:29402112-29402122promoter 内 410-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 29396447-29398531(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAA
SmilChr02G003253 Chr02 NC_080388.1:53822457-53822467promoter 内 298-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 53826160-53831016(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr05G004154 Chr05 NC_080391.1:55464124-55464134promoter 内 3914-3924 bp + 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 55462250-55464047(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr07G002988 Chr07 NC_080393.1:30460031-30460041promoter 内 3893-3903 bp - 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 30458226-30459933(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr05G003476 Chr05 NC_080391.1:46135658-46135668promoter 内 3838-3848 bp + 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 46135821-46137214(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr01G002531 Chr01 NC_080387.1:43325391-43325401promoter 内 3680-3690 bp - 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 43323101-43325080(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr02G002969 Chr02 NC_080388.1:50210539-50210549promoter 内 3472-3482 bp - 519 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 50208013-50210020(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr01G001429 Chr01 NC_080387.1:27926341-27926351promoter 内 3425-3435 bp + 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 27924911-27925775(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr06G001665 Chr06 NC_080392.1:18930914-18930924promoter 内 3391-3401 bp - 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 18929405-18930314(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr01G000165 Chr01 NC_080387.1:2733128-2733138promoter 内 3350-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 2733779-2735810(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr03G000171 Chr03 NC_080389.1:1881088-1881098promoter 内 3315-3325 bp - 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 1876652-1880412(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAA
SmilChr03G003741 Chr03 NC_080389.1:56465314-56465324promoter 内 3287-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56460675-56464610(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr05G001573 Chr05 NC_080391.1:14403835-14403845promoter 内 3259-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 14402231-14403103(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr02G004876 Chr02 NC_080388.1:70842957-70842967promoter 内 3219-3229 bp + 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 70840325-70842185(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr02G002416 Chr02 NC_080388.1:42150838-42150848promoter 内 3143-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 42149232-42149990(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr03G002334 Chr03 NC_080389.1:36820164-36820174promoter 内 3116-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 36817041-36819289(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr05G001360 Chr05 NC_080391.1:12104775-12104785promoter 内 3094-3104 bp + 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 12100982-12103878(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr03G001636 Chr03 NC_080389.1:21081308-21081318promoter 内 2970-2980 bp + 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 21078468-21080287(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr01G002816 Chr01 NC_080387.1:46722497-46722507promoter 内 2943-2953 bp - 1048 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 46723555-46729059(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr05G000089 Chr05 NC_080391.1:495547-495557promoter 内 2846-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 496702-497737(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr01G005204 Chr01 NC_080387.1:69714152-69714162promoter 内 2822-2832 bp - 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 69712303-69712983(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr01G005213 Chr01 NC_080387.1:69741531-69741541promoter 内 2774-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 69742758-69744892(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr06G001062 Chr06 NC_080392.1:10496302-10496312promoter 内 2751-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 10492552-10495062(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr03G004074 Chr03 NC_080389.1:59695742-59695752promoter 内 2683-2693 bp + 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 59697060-59697653(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr02G002308 Chr02 NC_080388.1:40693956-40693966promoter 内 2593-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 40695364-40701609(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr05G004015 Chr05 NC_080391.1:54114287-54114297promoter 内 2555-2565 bp - 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 54111903-54112851(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr04G003614 Chr04 NC_080390.1:52628162-52628172promoter 内 2498-2508 bp - 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 52629665-52631180(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr02G000431 Chr02 NC_080388.1:5584638-5584648promoter 内 2494-2504 bp + 1497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 5582653-5583141(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr05G004304 Chr05 NC_080391.1:56752325-56752335promoter 内 2388-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56749148-56750722(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr04G001786 Chr04 NC_080390.1:29292016-29292026promoter 内 2364-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 29288826-29290389(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr07G002228 Chr07 NC_080393.1:20496207-20496217promoter 内 2344-2354 bp - 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 20497864-20500157(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr04G002420 Chr04 NC_080390.1:38828549-38828559promoter 内 2334-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 38830216-38833020(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr03G004126 Chr03 NC_080389.1:60097395-60097405promoter 内 2299-2309 bp - 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 60099097-60101368(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr03G001665 Chr03 NC_080389.1:21592920-21592930promoter 内 2292-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 21587746-21591221(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCCAGCTGGT
SmilChr03G000623 Chr03 NC_080389.1:6884864-6884874promoter 内 2237-2247 bp + 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 6886628-6890764(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr04G001856 Chr04 NC_080390.1:30225349-30225359promoter 内 2237-2247 bp + 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 30227113-30228504(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr01G005220 Chr01 NC_080387.1:69769043-69769053promoter 内 2206-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 69765732-69767258(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA
SmilChr02G003713 Chr02 NC_080388.1:58738770-58738780promoter 内 2187-2197 bp + 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 58732871-58736966(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGAA
SmilChr01G003648 Chr01 NC_080387.1:54952957-54952967promoter 内 2163-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 54954795-54957194(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCA
SmilChr01G005755 Chr01 NC_080387.1:73647016-73647026promoter 内 2160-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 73641169-73645185(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCA