转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 27 / 134 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002249 Chr01 NC_080387.1:39104356-39104368promoter 内 2843-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 39105514-39107684(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTAAGGATAAGA
SmilChr03G001911 Chr03 NC_080389.1:26735701-26735713promoter 内 2773-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 26736929-26737921(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAGATT
SmilChr02G002857 Chr02 NC_080388.1:48773615-48773627promoter 内 2469-2481 bp + 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 48768678-48772095(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTTA
SmilChr03G000942 Chr03 NC_080389.1:10702062-10702074promoter 内 2211-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 10698446-10700284(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTTTC
SmilChr02G004886 Chr02 NC_080388.1:70946411-70946423promoter 内 2150-2162 bp - 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 70938481-70944572(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATCTGGATAAGA
SmilChr02G004663 Chr02 NC_080388.1:69021548-69021560promoter 内 2118-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 69016892-69019677(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGGAGGATAAGG
SmilChr01G004549 Chr01 NC_080387.1:63612738-63612750promoter 内 2033-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 63608236-63610782(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACATC
SmilChr02G004832 Chr02 NC_080388.1:70437505-70437517promoter 内 1681-1693 bp + 2308 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 70431909-70435197(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACATC
SmilChr01G004783 Chr01 NC_080387.1:66031338-66031350promoter 内 1436-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 66028084-66028785(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAGCGGATAAGA
SmilChr03G002149 Chr03 NC_080389.1:33437620-33437632promoter 内 574-586 bp - 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 33433170-33434205(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAAGC
SmilChr03G000216 Chr03 NC_080389.1:2509949-2509961promoter 内 117-129 bp - 3872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 2513833-2516724(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGTATT
SmilChr01G003672 Chr01 NC_080387.1:55164435-55164447promoter 内 37-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 3 55155753-55160483(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTTA
SmilChr02G000687 Chr02 NC_080388.1:10875382-10875394promoter 内 3943-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 10875440-10876560(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTAGATAAGG
SmilChr01G005058 Chr01 NC_080387.1:68496938-68496950promoter 内 3684-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 68497255-68498694(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATAGGATAAGA
SmilChr01G005084 Chr01 NC_080387.1:68720381-68720393promoter 内 3382-3394 bp + 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 68721000-68722304(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAAGC
SmilChr03G000375 Chr03 NC_080389.1:4190072-4190084promoter 内 3350-3362 bp - 639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 4186723-4189433(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGAAGATAAGG
SmilChr01G004017 Chr01 NC_080387.1:58559509-58559521promoter 内 3164-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 58560346-58570392(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTCGGATAAGA
SmilChr02G000284 Chr02 NC_080388.1:3637651-3637663promoter 内 3112-3124 bp + 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3635326-3636774(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr02G002033 Chr02 NC_080388.1:36621071-36621083promoter 内 2858-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 36622214-36622996(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAGATT
SmilChr03G000463 Chr03 NC_080389.1:4959202-4959214promoter 内 2008-2020 bp + 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 4952720-4957221(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTCT
SmilChr03G002457 Chr03 NC_080389.1:38913819-38913831promoter 内 1990-2002 bp - 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 38915830-38915901(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTCT
SmilChr03G000307 Chr03 NC_080389.1:3498404-3498416promoter 内 1744-1756 bp - 2245 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 3493752-3496159(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAACAGGATAAGA
SmilChr01G004685 Chr01 NC_080387.1:64926664-64926676promoter 内 1380-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 64921586-64924055(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTTC
SmilChr02G000192 Chr02 NC_080388.1:2407597-2407609promoter 内 674-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 2410924-2412487(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTTTGGATAAGA
SmilChr01G004733 Chr01 NC_080387.1:65507875-65507887promoter 内 284-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 65511592-65513149(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTTTC
SmilChr01G004090 Chr01 NC_080387.1:59327502-59327514promoter 内 183-195 bp + 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 59319395-59323696(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTTA
SmilChr03G000200 Chr03 NC_080389.1:2274056-2274068promoter 内 89-101 bp + 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 2 2277968-2282418(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAACAGGATAAGA
SmilChr01G004800 Chr01 NC_080387.1:66208425-66208437promoter 内 3926-3938 bp - 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 66208500-66209420(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCTCT
SmilChr01G003205 Chr01 NC_080387.1:50813568-50813580promoter 内 3830-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 50811557-50813409(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAATGGGATAAGG
SmilChr03G000872 Chr03 NC_080389.1:9908602-9908614promoter 内 3755-3767 bp - 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9908848-9909798(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr01G004932 Chr01 NC_080387.1:67376430-67376442promoter 内 3698-3710 bp - 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 67372644-67376139(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAAAAAGATAAGG
SmilChr01G004892 Chr01 NC_080387.1:66984277-66984289promoter 内 3606-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 66983066-66983894(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTTTTC
SmilChr01G004412 Chr01 NC_080387.1:62243384-62243396promoter 内 3578-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 62243807-62244992(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr03G000066 Chr03 NC_080389.1:735589-735601promoter 内 3438-3450 bp - 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 734422-735038(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGAAGATAAGG
SmilChr02G001009 Chr02 NC_080388.1:17843588-17843600promoter 内 3107-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 17841831-17842706(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr03G000850 Chr03 NC_080389.1:9690490-9690502promoter 内 3090-3102 bp + 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9688500-9689591(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr03G002033 Chr03 NC_080389.1:30520606-30520618promoter 内 3084-3096 bp - 905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 30521523-30522614(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATTA
SmilChr01G004363 Chr01 NC_080387.1:61817947-61817959promoter 内 2866-2878 bp - 1123 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 61814118-61816824(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAAGC
SmilChr01G005451 Chr01 NC_080387.1:71570412-71570424promoter 内 2809-2821 bp - 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71563624-71569232(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATAGGATAAGA
SmilChr01G002942 Chr01 NC_080387.1:48203419-48203431promoter 内 2795-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 48199708-48202225(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATAGGATAAGA
SmilChr02G005018 Chr02 NC_080388.1:71958710-71958722promoter 内 2793-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71955985-71957514(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTTC
SmilChr03G001999 Chr03 NC_080389.1:29715789-29715801promoter 内 2763-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 29717027-29718523(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAAAG
SmilChr02G001997 Chr02 NC_080388.1:36121783-36121795promoter 内 2688-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 36105911-36120482(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTCC
SmilChr02G004154 Chr02 NC_080388.1:63847983-63847995promoter 内 2534-2546 bp + 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 63849450-63852102(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATAGGATAAGA
SmilChr02G003684 Chr02 NC_080388.1:58206478-58206490promoter 内 2405-2417 bp + 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 58208074-58213277(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTTTAGATAAGG
SmilChr03G002302 Chr03 NC_080389.1:36239476-36239488promoter 内 2344-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 36241133-36243860(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAAGC
SmilChr02G004453 Chr02 NC_080388.1:66913266-66913278promoter 内 2148-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 66908101-66911425(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTAAG
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11647876-11647888promoter 内 2103-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 11644323-11645990(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCTTC
SmilChr02G003395 Chr02 NC_080388.1:55074048-55074060promoter 内 1972-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 55063768-55072031(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAGGAGATAAGG
SmilChr03G000843 Chr03 NC_080389.1:9623026-9623038promoter 内 1751-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9617494-9620788(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAGAAGATAAGG