转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 29 / 149 下载 TSV

上一页 29 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000423 Chr04 NC_080390.1:4494417-4494431promoter 内 1314-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4490669-4491744(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAATGGATAAGTTC
SmilChr04G000499 Chr04 NC_080390.1:5453951-5453965promoter 内 1303-1317 bp + 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 5456649-5458870(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTTATCCACTGA
SmilChr03G002888 Chr03 NC_080389.1:45547236-45547250promoter 内 1142-1156 bp - 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45550095-45553642(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr01G001232 Chr01 NC_080387.1:24770457-24770471promoter 内 1109-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 24762242-24767579(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCTTTAA
SmilChr02G003843 Chr02 NC_080388.1:60170283-60170297promoter 内 1105-1119 bp - 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60173179-60175367(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr03G002939 Chr03 NC_080389.1:46121423-46121437promoter 内 928-942 bp + 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46117412-46118364(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATATGGATAACCTT
SmilChr03G004714 Chr03 NC_080389.1:64387398-64387412promoter 内 927-941 bp - 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64390472-64393314(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGAGGATAAGGCG
SmilChr03G000638 Chr03 NC_080389.1:7018241-7018255promoter 内 885-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7021357-7024041(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr03G000666 Chr03 NC_080389.1:7456522-7456536promoter 内 672-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7459851-7462643(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAGGGAT
SmilChr02G000840 Chr02 NC_080388.1:14234585-14234599promoter 内 641-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 14237945-14239455(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAATTGGATAAGAAA
SmilChr04G001902 Chr04 NC_080390.1:31104420-31104434promoter 内 515-529 bp + 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 31099298-31100948(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr01G005975 Chr01 NC_080387.1:75419494-75419508promoter 内 437-451 bp + 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 75414077-75415944(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr01G001077 Chr01 NC_080387.1:22192243-22192257promoter 内 405-419 bp + 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 22195839-22202144(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAACTTATCCATTAC
SmilChr01G003360 Chr01 NC_080387.1:52348991-52349005promoter 内 267-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 52337701-52345271(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCAATTA
SmilChr03G003906 Chr03 NC_080389.1:58154448-58154462promoter 内 247-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 58158202-58162638(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTTT
SmilChr04G003037 Chr04 NC_080390.1:46851620-46851634promoter 内 163-177 bp - 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 46855458-46857194(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAGGGAT
SmilChr02G004230 Chr02 NC_080388.1:64494691-64494705promoter 内 78-92 bp - 3909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64498614-64500758(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGAGGATAAGGCG
SmilChr02G000977 Chr02 NC_080388.1:17066357-17066371promoter 内 54-68 bp + 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17070304-17071308(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCCTTTCA
SmilChr01G004873 Chr01 NC_080387.1:66833272-66833286promoter 内 18-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 66837255-66837328(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATTGGATAACGTG
SmilChr02G004130 Chr02 NC_080388.1:63561195-63561209promoter 内 3247-3261 bp - 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 4 63558436-63560455(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTTATCCACAAT
SmilChr02G000666 Chr02 NC_080388.1:10231829-10231843promoter 内 3903-3917 bp - 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 10231927-10233018(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTAGATAAGGTG
SmilChr01G005761 Chr01 NC_080387.1:73713992-73714006promoter 内 3867-3881 bp + 120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 73714126-73716841(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATATA
SmilChr01G004883 Chr01 NC_080387.1:66901628-66901642promoter 内 3287-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 66896875-66900928(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATAAGAGT
SmilChr01G001960 Chr01 NC_080387.1:34861073-34861087promoter 内 2371-2385 bp - 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 34853780-34859457(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACTTTATCCAAATA
SmilChr03G001942 Chr03 NC_080389.1:27668907-27668921promoter 内 1480-1494 bp - 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 27664212-27666400(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTTATCCTATCA
SmilChr04G001549 Chr04 NC_080390.1:25589417-25589431promoter 内 933-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 25585530-25586363(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCGAATA
SmilChr04G000751 Chr04 NC_080390.1:9203089-9203103promoter 内 628-642 bp - 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 9206462-9207454(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGTTTGGATAAGCAT
SmilChr02G004307 Chr02 NC_080388.1:65450013-65450027promoter 内 3936-3950 bp + 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 65445620-65449962(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCAGTGGATAAGATT
SmilChr02G003341 Chr02 NC_080388.1:54624511-54624525promoter 内 3604-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 54624908-54629749(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTCTTATCCAAATG
SmilChr02G002857 Chr02 NC_080388.1:48772540-48772554promoter 内 3542-3556 bp + 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 48768678-48772095(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTGTGGATAACATT
SmilChr01G001494 Chr01 NC_080387.1:28769869-28769883promoter 内 3498-3512 bp - 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 28770372-28774508(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGAGGATAAGAAT
SmilChr01G004648 Chr01 NC_080387.1:64562317-64562331promoter 内 3287-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 64561144-64561617(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACATTATCCATTCT
SmilChr02G001837 Chr02 NC_080388.1:33474278-33474292promoter 内 3190-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 33471214-33473481(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACTATGGATAACGTT
SmilChr04G001813 Chr04 NC_080390.1:29632538-29632552promoter 内 3157-3171 bp + 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 29633382-29634236(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAACTTATCCACTAC
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71522374-71522388promoter 内 3058-3072 bp - 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 71519011-71521445(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATCTTATCCAATCA
SmilChr02G004431 Chr02 NC_080388.1:66667235-66667249promoter 内 2531-2545 bp + 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 66663173-66665779(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6063318-6063332promoter 内 2504-2518 bp + 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 6058931-6061835(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAAAATT
SmilChr03G000223 Chr03 NC_080389.1:2608676-2608690promoter 内 2098-2112 bp + 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 2610579-2611193(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACATTATCCAAAGA
SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35823131-35823145promoter 内 2073-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 35819285-35821217(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAAGTGGATAATGCT
SmilChr02G000003 Chr02 NC_080388.1:24387-24401promoter 内 1945-1959 bp - 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 21172-22345(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATATA
SmilChr02G000493 Chr02 NC_080388.1:6749090-6749104promoter 内 1939-1953 bp + 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 6751152-6755117(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTATCCATATA
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73067239-73067253promoter 内 1268-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 73062182-73064520(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTAGGATAAGATA
SmilChr02G002432 Chr02 NC_080388.1:42331822-42331836promoter 内 799-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 42335024-42336319(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCACTTA
SmilChr02G004975 Chr02 NC_080388.1:71641586-71641600promoter 内 730-744 bp + 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 71632567-71638329(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATGTGGATAACATT
SmilChr03G002300 Chr03 NC_080389.1:36215034-36215048promoter 内 565-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 36218470-36218878(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCGTTATCCAAATA
SmilChr02G003682 Chr02 NC_080388.1:58188364-58188378promoter 内 460-474 bp + 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 58180474-58184837(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGAGGATAAGAAT
SmilChr04G001629 Chr04 NC_080390.1:27050368-27050382promoter 内 434-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 27044852-27046815(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTGAGGATAAGAAT
SmilChr03G003377 Chr03 NC_080389.1:52120118-52120132promoter 内 290-304 bp - 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 52113362-52116421(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCATTATCCACATC
SmilChr01G001908 Chr01 NC_080387.1:34166810-34166824promoter 内 236-250 bp - 3751 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 34170575-34171755(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAATGGATAGGGTG
SmilChr01G001865 Chr01 NC_080387.1:33593782-33593796promoter 内 214-228 bp - 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 33597569-33598788(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTAATGGATAGGGTG