转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 31 / 149 下载 TSV

上一页 31 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005500 Chr02 NC_080388.1:75144516-75144526promoter 内 2817-2827 bp + 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 75145700-75149372(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G005870 Chr01 NC_080387.1:74645643-74645653promoter 内 2759-2769 bp + 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 74642540-74644411(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G000495 Chr01 NC_080387.1:10098506-10098516promoter 内 2753-2763 bp - 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 10099754-10101707(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr05G002249 Chr05 NC_080391.1:24165043-24165053promoter 内 2719-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 24166325-24170221(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr04G001424 Chr04 NC_080390.1:23188690-23188700promoter 内 2338-2348 bp + 1653 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 23185042-23187037(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G003037 Chr01 NC_080387.1:49378160-49378170promoter 内 2132-2142 bp + 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49375882-49376301(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr01G000121 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047522promoter 内 1106-1116 bp + 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2050407-2050513(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G001118 Chr01 NC_080387.1:22815149-22815159promoter 内 1086-1096 bp - 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 22811251-22812244(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G002014 Chr01 NC_080387.1:35693873-35693883promoter 内 983-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 35689427-35690865(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr06G002053 Chr06 NC_080392.1:27057668-27057678promoter 内 669-679 bp + 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 27053630-27054346(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G000418 Chr03 NC_080389.1:4509645-4509655promoter 内 497-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 4505141-4506151(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCGGCTGTCA
SmilChr01G000122 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047522promoter 内 399-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2051114-2052985(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G003013 Chr01 NC_080387.1:49165338-49165348promoter 内 369-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49168970-49169650(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGC
SmilChr01G000120 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047522promoter 内 6-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2043018-2043527(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr06G001461 Chr06 NC_080392.1:15478839-15478849promoter 内 3950-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15478890-15487051(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr01G005865 Chr01 NC_080387.1:74594690-74594700promoter 内 3931-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 74591958-74594630(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G000492 Chr01 NC_080387.1:9976097-9976107promoter 内 3673-3683 bp + 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9972478-9975779(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr04G001962 Chr04 NC_080390.1:31815338-31815348promoter 内 3618-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31810581-31814965(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCGGCTGTCA
SmilChr05G003496 Chr05 NC_080391.1:46537909-46537919promoter 内 3598-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 46538312-46590024(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr01G000733 Chr01 NC_080387.1:16293154-16293164promoter 内 3589-3599 bp + 402 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 16289859-16292752(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr05G003052 Chr05 NC_080391.1:38277236-38277246promoter 内 3517-3527 bp - 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38276181-38276762(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr03G000607 Chr03 NC_080389.1:6707838-6707848promoter 内 3185-3195 bp - 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6706463-6707032(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G002006 Chr02 NC_080388.1:36195014-36195024promoter 内 3176-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 36195839-36196471(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G003424 Chr04 NC_080390.1:50830143-50830153promoter 内 3165-3175 bp - 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 50827045-50829317(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr07G001559 Chr07 NC_080393.1:12739325-12739335promoter 内 3156-3166 bp + 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 12740170-12742662(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr05G001483 Chr05 NC_080391.1:13603508-13603518promoter 内 3134-3144 bp + 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13595297-13602651(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr07G003003 Chr07 NC_080393.1:30837086-30837096promoter 内 3049-3059 bp + 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 30838038-30838700(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr07G001367 Chr07 NC_080393.1:10606772-10606782promoter 内 3022-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 10607751-10608560(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G002226 Chr04 NC_080390.1:35989712-35989722promoter 内 3007-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 35988241-35988728(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G002228 Chr04 NC_080390.1:36000631-36000641promoter 内 3007-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 35999160-35999647(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G004386 Chr02 NC_080388.1:66201310-66201320promoter 内 2997-3007 bp + 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66202314-66205202(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G001450 Chr04 NC_080390.1:23827749-23827759promoter 内 2927-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23828823-23830991(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr06G003021 Chr06 NC_080392.1:43070581-43070591promoter 内 2912-2922 bp + 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43071670-43075188(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G002353 Chr04 NC_080390.1:38007795-38007805promoter 内 2728-2738 bp + 1263 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38009068-38024714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCG
SmilChr05G000269 Chr05 NC_080391.1:2082312-2082322promoter 内 2692-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 2057143-2081013(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGC
SmilChr03G003124 Chr03 NC_080389.1:48428659-48428669promoter 内 2599-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48424143-48427267(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr05G001171 Chr05 NC_080391.1:9804541-9804551promoter 内 2448-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 9806094-9809339(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr02G000812 Chr02 NC_080388.1:13607500-13607510promoter 内 2221-2231 bp - 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13609280-13609351(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G000518 Chr03 NC_080389.1:5573801-5573811promoter 内 2217-2227 bp - 1774 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 5575585-5578173(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCGAT
SmilChr02G000987 Chr02 NC_080388.1:17361653-17361663promoter 内 2185-2195 bp + 1806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17363469-17366231(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G001423 Chr02 NC_080388.1:26828147-26828157promoter 内 2178-2188 bp + 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26829970-26830536(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G000630 Chr01 NC_080387.1:14082266-14082276promoter 内 2161-2171 bp - 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14084106-14086762(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr04G001161 Chr04 NC_080390.1:17249138-17249148promoter 内 2067-2077 bp + 1924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17246738-17247214(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr02G005603 Chr02 NC_080388.1:75734369-75734379promoter 内 2017-2027 bp - 1974 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75736353-75739430(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGC
SmilChr07G003231 Chr07 NC_080393.1:34312089-34312099promoter 内 1929-1939 bp + 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 34302185-34310027(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr01G002946 Chr01 NC_080387.1:48333748-48333758promoter 内 1790-1800 bp + 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 48335959-48339486(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G002083 Chr04 NC_080390.1:33593080-33593090promoter 内 1704-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33587826-33590793(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G002071 Chr02 NC_080388.1:37294376-37294386promoter 内 1693-1703 bp + 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 37296684-37298030(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr05G003548 Chr05 NC_080391.1:47405344-47405354promoter 内 1688-1698 bp - 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 47400519-47403041(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCG
SmilChr04G001587 Chr04 NC_080390.1:26377046-26377056promoter 内 1523-1533 bp + 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26379524-26382320(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA